突变位点

摘要： 目前已发现与非综合征型聋相关的致病基因有120余个(http://hereditaryhearingloss.org),其中群体凝血因子C同源物(coagulation factor C homology,COCH)基因是首个被报道伴有前庭功能障碍的常染色体显性遗传性非综合征型聋,即DFNA9(deafness autosomal dominant 9)型聋致病基因。迄今为止文献共报道了27个与DFNA9相关的COCH基因突变致病位点,并发现其突变位点与听力和前庭表型密切相关[1~4]。

摘要： 本实验旨在鲁莱黑猪群体中检测已报道的MYH3功能性突变的基因型频率分布,并分析该突变和MYH3基因外显子突变与肌内脂肪含量的关联性,为鲁莱黑猪肉品质的分子选育提供科学依据。利用PCRRFLP技术,对鲁莱黑猪MYH3功能性突变位点(XM_013981330.2:g.-1805_-1810del,chr12:55373707)进行基因分型。同时对MYH3基因外显子进行测序,搜寻外显子突变位点,对外显子突变位点进行有害性预测和保守位点分析。采用SNaPshot分型技术检测上述突变位点在鲁莱黑猪群体中的基因型,进一步分析MYH3功能性突变位点和外显子突变位点与肌内脂肪含量的关联性。结果表明:在鲁莱黑猪中检测到MYH3功能性突变位点存在分离,其基因型频率分别为0.098(qq)、0.143(QQ)、0.759(Qq)。关联分析显示:在鲁莱黑猪群体中MYH3功能性突变与肌内脂肪无显著性关联;外显子突变位点与肌内脂肪也无显著性关联,仅与体重有关联。已报道的MYH3功能性突变可能不是影响该鲁莱黑猪群体肌内脂肪的因果位点,不能作为该群体肉质性状选育的分子标记。同时,MYH3基因外显子突变也与肌内脂肪无关联性,提示可能存在别的突变位点调控鲁莱黑猪肌内脂肪的含量。

摘要： 目的对昆明地区低病毒载量乙肝患者进行基因分型及耐药突变位点的分析研究,为低载量乙肝患者临床抗病毒治疗难易程度的判定及抗病毒精准医疗个体化方案的制定提供依据。方法选取1452例低病毒载量(HBV DNA《2.0x10^(3) IU/mL)慢性乙型肝炎患者,进行乙肝分型和耐药基因位点检测。结果昆明地区乙肝低载量人群中HBeAg阴性者占比较高(59.5%),男性患者占比(70.6%)高于女性,年龄分布以30~60岁为主(72.7%),基因分型以C基因型占比最高(61.8%)。1452例昆明地区低载量乙肝患者中共有37例患者检出耐药突变位点,其中拉米夫定与恩曲他滨耐药率一致(1.6%),替比夫定耐药率为1.2%,阿德福韦耐药率0.9%,恩替卡韦耐药率0.2%,替诺福韦未检出耐药突变位点。除耐药突变位点外,还检出其他突变位点112例,其中S256G、S213T、N/H238T/D、Q215H检出率最高,检出率最低的突变位点为A194T。结论昆明地区乙肝基因型以C型为主,提示该地区的HBV基因型分布状况有独立特征。昆明地区低病毒载量乙肝患者恩替卡韦的耐药率最低,未发现TDF耐药,但存在替诺福韦酯药物敏感性下降。检出的其他突变位点是否与耐药性相关,仍存在一定的争议,但其检出率也存在一定的占比。

摘要： 目的分析广西柳州地区HIV-1高效抗反转录病毒治疗(HAART)患者中病毒抑制失败者的耐药基因突变特征,监测耐药发生并为评估抗病毒治疗效果提供依据。方法采用回顾性队列研究方法采集广西壮族自治区胸科医院一线抗病毒治疗时间超过12个月,病毒载量>1000copies/ml的HIV患者血浆标本308例,进行基因型耐药检测,分析耐药检测特征。结果共纳入308例患者,成功检测并获得288例基因序列,毒株亚型以CRF01_AE为主,总耐药率达到40.63%(117/288),耐药基因突变发生率57.29%(165/288),核苷类逆转录酶抑制剂(NRTIs)相关的突变位点主要为M184V、D67N和K65R;非核苷类逆转录酶抑制剂(NNRTIs)相关的突变位点则为K103N、G190A、Y181C和V179D;蛋白酶抑制剂(PIs)突变位点以L10I、L10V和A71V为主。结论广西柳州地区HAART失败人群中HIV-1基因型耐药比例高,需要加强耐药监测,了解耐药突变位点之间的相互作用,熟悉抗反转录病毒药物之间的耐药和交叉耐药模式的存在,有利于为患者提供精准有效的一线治疗方案,延迟二线药物的使用。

摘要： 黑素皮质素受体1 (Melanocortin-1 Receptor,MC1R)是一种7跨膜结构G蛋白耦联受体,在鸟类羽色形成中起着重要作用.为探讨MC1R对太湖鸽特殊羽色形成的影响,本实验利用PCR和直接测序法对太湖鸽、乌鸽和白卡奴鸽MC1R基因编码区进行扩增,并对不同鸽种MC1R基因序列进行差异性分析.结果 表明:鸽MC1R基因编码区全长942 bp,共编码313个氨基酸,存在7个跨膜结构;白卡奴鸽与乌鸽的MC1R基因编码区核酸序列基本一致,黑羽和棕羽太湖鸽的MC1R基因序列没有差异,而太湖鸽与其他2个鸽种分别于279 bp (A＞G)和520 bp (G＞A)处存在碱基差异,其中G520A造成了氨基酸(Ser 174Gly)的改变,推测该位点突变与太湖鸽特殊羽色形成有关.

摘要： 目的:使用Sanger测序法鉴定2个中国结晶样视网膜色素变性(BCD)家系中CYP4V2基因的突变位点.方法:收集2019-01/09临床诊断为BCD患者的临床相关资料.采集患者、患者家系成员的外周血,提取DNA,利用Sanger测序法鉴定突变位点.结果:共收集2个BCD先证者,先证者均表现为渐进性视力下降,眼底均可见典型的结晶样物质沉积.测序发现先证者1及其患病的哥哥,妹妹均在CYP4V2基因上存在c.802-8_810del17insGC的纯合突变.而先证者2则在CYP4V2基因上存在c.219T>A(p.F73L)、c.802-8_810del17insGC杂合突变.结论:中国BCD患者中最常见的c.802-8_810del17insGC突变在先证者1家系中为纯合突变,是其家系的致病突变.而先证者2则携带了中国BCD患者最常见的c.802-8_810del17insGC杂合突变,同时先证者2还携带c.219T>A(p.F73L)错义突变,突变均影响了CYP4V2基因的正常编码,进而导致疾病.

摘要： 为研究草地贪夜蛾Spodoptera frugiperda(以下简称FAW)对双酰胺类杀虫剂的抗性机制,根据FAW鱼尼丁受体(ranodine receptor,RyR)跨膜区域的氨基酸序列,通过同源建模的方法构建其三维结构;通过对比FAW与小菜蛾Plutella xylostella(以下简称DBM)RyR跨膜区域的氨基酸序列,发现两者具有较高的同源度,进而根据已报道的FAWRyR的突变位点I4734M及DBMRyR的突变位点G4946E(对应FAWRyR的G4891),在FAWRyR中引入突变,采用分子对接的方法分别分析其突变前后与5种双酰胺类杀虫剂的结合模式。结果表明:FAWRyR的I4734M突变模型与5种双酰胺类杀虫剂的亲和力与野生型的无明显差别,均存在氢键、卤键、疏水作用、π-π相互作用及π-阳离子作用等非共价相互作用;但G4891E突变模型与5种双酰胺类杀虫剂的亲和力下降、形成的作用力方式减少,从而影响RyR与双酰胺类杀虫剂的结合稳定性。本研究分析发现,FAWRyR的G4891E突变可能导致其对双酰胺类杀虫剂产生抗性,需在今后的研究中关注该突变。该研究结果还可会为基于鱼尼丁受体设计杀虫剂提供参考。

摘要： 核苷(酸)类似物(nucleos(t)ide analogues,NAs)耐药乙型肝炎病毒(hepatitis B virus,HBV)感染是由长期使用药物后HBV逆转录酶区的基因突变导致.耐药性的出现可导致治疗失败,也是疾病进展的重要原因之一.阐明HBV耐药机制对于药物选择及预后治疗具有重要帮助;梳理HBV耐药的突变位点现状将为进一步探讨耐药HBV的相关风险信号及临床精准防控提供依据.本文就NAs耐药乙肝的分子机制与突变位点研究进行简要综述,旨在为耐药乙肝的治疗提供参考.

摘要： 目的 阐明宁波地区初治肺结核患者结核分枝杆菌rpoB、katG、inhA基因突变特征,深入分析基因突变与异烟肼、利福平耐药关系,为临床抗结核治疗提供科学依据.方法 采用1％比例法对2 455例结核分枝杆菌临床分离株进行药敏检测,对其中的耐药菌株和部分全敏菌株提取DNA,PCR扩增,对耐药菌株katG、inhA、rpoB基因测序,分析3种基因特征及基因突变与单耐药、耐多药关联性.结果 2 455例结核分枝杆菌临床分离株中,发现108例耐药结核分枝杆菌,其中单耐药75例(单耐异烟肼51例,利福平24例),单耐药率为3.05％;33例耐多药,耐多药率为1.34％.33例耐多药菌株中,5例发生inhA基因错义突变,突变率为15.15％(5/33),rpoB基因450位点(ser450leu)突变率为51.52％(17/33),katG基因315位点(ser315thr)突变率为87.88％(29/33),463位点(arg463leu)突变率为78.79％(26/33).24例单耐利福平菌株中有17例发生rpoB基因错义突变,突变率为70.83 ％(17/24),主要在446位点(lys446lysarg)发生,该位点突变率为45.83％(11/24).51例单耐异烟肼菌株中有45例发生katG基因错义突变,突变率为88.23％(45/51),315位点(ser315thr)突变率为72.55％(37/51),463位点(arg463leu)突变率为64.71％(33/51);22例发生inhA基因错义突变,突变率为43.14％(22/51),145位点(val 145valgly)突变率为27.45％(14/51);5例发生rpoB基因错义突变,突变率为9.80％(5/51),位点较分散.另外,108例耐药菌株中,有11例菌株发生rpoB、katG、inhA多基因联合突变,且在大多数位点发生错义突变,突变率为10.18％(11/108).结论 rpoB、katG、inhA基因在450(ser450leu)、315(ser315thr)、446(lys4461ysarg)、463(arg463leu)、145(val 145valgly)等位点突变和宁波区结核分枝杆菌对异烟肼、利福平耐药密切相关,其中rpoB、inhA基因的主要突变位点和突变频率存在明显地区差异.

摘要： 目的:探讨内皮素-1基因G8002A和T8000C突变位点的相关性. 方法:采用ARMS技术,对海南地区805例汉、黎族人群进行ET-1基因G8002A、T8000C突变位点的检测,统计各突变位点的基因型.结果:在海南汉、黎族人群中, G8002A突变位点可检测出GG、GA、AA3种基因型;未检测到T8000C突变.结论:当前存在的关于T8000C突变位点的报道可能为误报道,是与G8002A位点相混淆的报告.

摘要： 目的：研究HBsAg与HBsAb同时阳性患者基因突变的特点,分析S区基因突变与P区的关系,深入探究HBsAg与HBsAb同时阳性产生形成的原因.rn 方法：选取3例HBsAg+/HBsAb+乙型肝炎患者作为实验组,4例HBsAg+/HBsAb-患者作为对照组,将两组患者血清中编码HBsAg的S基因区进行克隆并测序,分析突变位点特点,同时对S区和与P区重叠部分的基因序列进行氨基酸翻译,研究两个功能区氨基酸突变的相关性.rn 结果：同一患者的不同克隆株在同一位点表达为不同的碱基.实验组患者的碱基突变率明显高于对照组(p=0.000),这些突变以引起S区氨基酸变化的错义突变为主,实验组的S区错义突变显著多于对照组,有统计学意义(1.26％vs.0.81％,p=0.000),而其同义突变与对照组相比无差异(0.45％vs.0.33％,p=0.059).P区与S区重叠部分序列错义突变率低于S区,同义突变率高于S区.S区氨基酸的突变主要集中在MHR的a决定簇的第一个环,与对照组相比统计学差异显著(13.78％vs.1.28％,=0.000).rn 结论：乙肝患者体内可能同时有几种病毒基因的不同突变组合,HBsAg与HBsAb同时阳性的患者比一般HBsAg+/HBsAb-慢性乙肝患者在免疫压力的作用下更易发生突变,其病毒基因组的复杂程度更高.这些突变以会引起S区氨基酸改变的错义突变为主,同区域内P区的氨基酸突变低于S区,说明在免疫压力下,此区域发生的突变主要对编码HBsAg的S基因区的机构和功能造成潜在影响.这些突变主要集中在a决定簇第一个环状区域内,而这一区域的氨基酸突变可能改变了HBsAg的抗原性,使针对原先病毒株产生的抗体不能中和或不能完全中和这些抗原,是导致HBsAg与HBsAb同时阳性的现象的原因.

摘要： 目的:研究一个中国家系假肥大型肌营养不良相关致病基因dystrophin的突变情况.方法:收集一假肥大型肌营养不良家系临床资料,采用聚合酶链反应及直接测序法对此家系进行dystrophin基因突变检测,同时对126名家系外健康对照者的该位点进行单链构象多态性(SSCP)分析.结果:在假肥大型肌营养不良家系中发现了一个杂合变异,即dystrophin基因48号外显子上发现一个错义变异(c.7303A＞C),导致代表赖氨酸的2366位密码子变化为谷氨酰胺(p.Lys2366GIn).结论:在中国人假肥大型肌营养不良患者的dystrophin基因上发现了一个尚未报道的错义突变位点(c.7303A＞C).

摘要： 耳聋是影响人类健康和致残的常见病,据各国统计平均每1000个新生儿中就有1个耳聋儿.其中大致一般的耳聋与遗传因素相关,对于环境因素导致的耳聋,可以通过预防感染和加强孕期围产期的保健,避免应用耳聋性药物等措施有效地预防.但对遗传性耳聋的预防,明确耳聋基因的关键,同时对耳聋患者家庭的遗传咨询是咨询我国优生优育的人口政策,是关系到我国社会长远发展的战略型需求.应用遗传性耳聋基因芯片检测试剂盒的芯片(Microarray)技术对GJB2,SLC26A4,线粒体12SrRNA和GJB3四个耳聋相关基因的9个致聋突变位点进行检测。检测的遗传性耳聋基因突变热点包括GJB2基因的35,176,235及299位点，SLC26A4基因的2168和IVS7-2位点，线粒体12SrRNA基因的1494和1555位点，以及GJB3基因的538位点。该试剂盒以基因组 DNA为模板，采用带有Tag标签序列的基因位点特异性引物对相关突变位点所在的基因片段进行扩增和荧光标记，然后将扩增产物与能够识别相应标签序列的基因芯片进行杂交，通过微阵列芯片扫描仪对芯片进行扫描，最后将扫描结果进行判定和数据分析得到9个突变位点的检测结果。

摘要： 目的:探讨山西省各地区聋哑学校遗传性耳聋患者常见的致病基因以及突变位点.rn 方法:收集山西省各地区聋哑学校耳聋患者的外周血标本300例,通过基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱的方法,筛选常见的致病基因(GJB2、SLC26A4、GJB3、线粒体12rRNA)的突变位点,并用测序的方法进行验证.rn 结果:采用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱的方法对耳聋患者标本的四个常见基因20个位点进行检测,结果显示:GJB2基因中,c.235delC突变的携带率最高,达13.67％;SLC26A4 (PDS)基因中c.IVS7-2A＞G突变携带率为17.67％;线粒体12rRNA基因中c.1555A＞G突变携带率为2.00％;GJB3基因未发现突变,经测序验证后,所得结果与质谱符合度达98％以上.rn 结论:通过对山西省范围内的四种常见耳聋基因发生突变的情况进行分析,为该地区耳聋的早期诊断、治疗提供依据;同时,验证得出基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱是一种可靠的检测耳聋基因的方法。

摘要： 采用PCR扩增五指山猪Myf5(myogenic factor 5,Myf5)基因组序列,通过克隆测序寻找基因中的突变位点.结果表明:在五指山猪Myf5基因组中共发现3处突变位点,分别位于第1外显子(C+121G,C+288G)和第1内含子(C+1204G),生物信息学分析发现猪Myf5基因启动子区域存在一些潜在的转录因子结合位点.为进一步研究五指山猪生长发育规律及矮小机制打下基础。

摘要： 目的：为了分析江西地区HBV慢性感染患者Enh Ⅱ/BCP/preC区基因变异与血清HBVDNA水平的关联性,进一步探讨HBV Enh Ⅱ/BCP/preC区基因变异对慢性肝病进展的影响.rn 方法：收集2012年来本院就诊的HBV慢性感染患者血清并分为无症状携带者(ASC)、慢性乙肝(CHB)患者、肝硬化(HC)患者、肝癌(HCC)患者四组.对其进行PCR扩增Enh Ⅱ/BCP/preC基因,与标准株比对分析变异位点.荧光定量PCR法定量检测血清HBV DNA拷贝数.数据使用SPSS16.0统计软件进行分析,P＜0.05为差异有统计学意义.rn 结果：HBVDNA Enh Ⅱ/BCP/preC基因突变位点C1653T、T1753C和A1762T/G 1764A在HCC和LC组发生率都明显高于ASC和CHB组,G1896A在HCC组发生率明显高于ASC和CHB组;发生T1753C突变、A1762T/G1764A双突变及G1896A突变患者的HBV DNA定量均明显低于对应无突变的患者.rn 结论：突变位点C1653T、T1753C和A1762T/G 1764A在HCC和LC形成进展中可能发挥了重要作用;T1753C、A1762T/G 1764A和G1896A突变可能降低了HBV的复制能力.

摘要： 遗传性多发性骨软骨瘤(HME)是一种以长骨干骺端多发性外生骨疣合并骨缺损为特征的常染色体显性遗传病,目前已发现的致病基因有2个,即定位在8q24.11-q24.13上的EXT1和11p12-11上的EXT2,EXT3、EXTL1、EXTL2和EXTL3虽然有可能是致病基因,但并未证实.EXTI和EXT2基因突变导致硫酸肝素生物合成不足,软骨细胞大量增殖,使邻近区域的骨骼生长异常,从而引起多发性外生性骨疣,恶变率5-28％.迄今为止,大多国外家系研究报道EXTl突变占所有HME突变的50％-70％,EXTl对EXT2突变比率约为1.8:1.然而大约有20-40％左右的家系无法确定HME的致病基因.本研究选择的骨软骨瘤家系共三代7人,无近亲婚配,已确诊患者3人,其中男性1人,女性2人.对先证者的EXTl和EXT2全部外显子进行测序,在EXT1的第10个外显子发现了一个单核苷酸变异(SNV)c.1902C>CA;p.634Y>X,该突变导致第634位编码酪氨酸的密码子TAC变为终止密码子TAA,使编码蛋白EXT1成为只有633个氨基酸的截断型蛋白,SIFT软件和Mutation taster软件均预测此突变是致病突变,HGMD数据库尚未收载634为无义突变致病报道.EXTI和EXT2其余外显子均未发现突变,将此突变在全部家系成员中进行验证,并在100例HME散发病例和500例正常人对照中进行检测,家系正常人、100例散发病例以及家系外500例正常人对照均未发现此突变,表明该突变是家系患者特有的基因突变,突变位点与疾病表型共分离,确定EXT1 exon10的c.1902C>CA(p.634Y>X)是HME致病基因EXT1新的突变位点。

摘要： 本研究运用PCR-RFLP方法对4个猪种的这4个突变位点(c.1053C>T、c.1394A>G(His465Arg)c.1751A>G(Asp582Gly)和c.3290C>A(17hr1097Asp))的遗传多态性进行检测和分析，从而对猪生长基因型的选育提供参考。

摘要： 长QT综合症可分为先天遗传性和后天获得性LQTS二类。其中先天性LQT2是由于hERG基因发生突变所致，最近报道发现了hERG基因的一个新的突变位点Q738X，对该基因突变导致hERG钾通道功能的改变迄今国内外尚未见报道。

摘要： 本发明公开了一种产类胡萝卜素的酵母突变菌株及其突变位点应用。酿酒酵母M3保藏于广东省微生物菌种保藏中心，保藏号为GDMCC No:61336。本发明通过乙醇介导的实验室适应性进化筛选获得一株酿酒酵母突变菌株M3。该菌株在摇瓶发酵条件下，YPD培养基中类胡萝卜素含量可以达到19.7mg/g，比出发菌株提高5.1倍；而在YPM培养基中类胡萝卜素含量可以达到42.4mg/g细胞干重。经基因组测序及反向代谢工程研究，确定PFK1基因失活是类胡萝卜素积累提高的主要因素，为定向改造提供了新的靶点。

摘要： 本发明属于农业生物技术工程和蔬菜遗传育种领域，具体涉及到与番茄雄性不育突变位点ms‑24及其等位突变位点ms‑10和ms‑36共分离的分子标记及其应用。所述的分子标记为可以检测番茄雄性不育突变位点ms‑10、ms‑24和ms‑36中插入片段的共显性分子标记MS24I。本发明可以替代传统的通过在开花期选择雄性不育植株以确保番茄育种材料含有雄性不育突变位点ms‑10、ms‑24或ms‑36的方法。利用本发明的分子标记可以在苗期辅助选择含有ms‑10、ms‑24或ms‑36突变位点的纯合植株和杂合植株，从而缩短育种周期、提高育种效率。

摘要： 本发明属于医学技术领域，基因突变位点的用途及突变位点检测方法。主要公开了PTEN‑p.P248L基因位点、PTEN‑p.T319fs基因位点、BRAF基因V600E位点、NRAS基因Q61R位点、RET基因M918T位点、NRAS基因Q61K位点、HRAS基因Q61R位点等在在制备甲状腺癌防治药物和/或制备甲状腺癌检测试剂中的应用。突变PTEN基因至少包括下述一种位点突变：PTEN‑p.P248L位点突变，碱基变化为c.743C>T；PTEN‑p.T319fs位点突变，碱基变化为c.955_956insAA。还公开了高通量测序中捕获方法。本发明提供了与甲状腺乳头状癌靶向用药相关的比例靠前的突变基因，因而可以有目的性的对这些位点进行检测，可以更好地用于辅助治疗，有效减小检测和数据分析的工作量，降低了检测时间和成本。

摘要： 本发明提供了一种多突变位点的逆转录酶突变体，具体地，本发明构建了逆转录酶(M‑MLV)突变库，通过大量筛选，最终筛选出了热稳定性提高且扩增效率较高的具有多突变位点的逆转录酶突变体，与野生型M‑MLV酶相比逆转录效率显著提高。

摘要： 本发明公开一种水稻理想脆秆突变体ibc的突变位点、控制基因IBC及其应用，涉及生物技术领域，所述基因IBC的核苷酸序列，(1)如SEQ ID No.1或SEQ ID No.2所示；或(2)添加、取代，插入或缺失一个或多个核苷酸而生成的突变体、等位基因或衍生物的核苷酸序列。本发明还提供基因IBC的编码蛋白、重组构建体、重组宿主细胞以及利用基因IBC使水稻成熟期茎秆变脆的方法及应用。本发明的有益效果在于：IBC的等位变异以及基因编辑的功能缺失突变体中，茎秆在成熟后期出现脆秆表型，叶片不脆，产量性状优良，其他农艺性状无明显变化，在收获期，田间收割秸秆易粉碎，有利于粉碎还田，秸秆的饲料化中易粉碎青贮、动物易咀嚼。

摘要： 本发明公开了一种产类胡萝卜素的酵母突变菌株及其突变位点应用。酿酒酵母M3保藏于广东省微生物菌种保藏中心，保藏号为GDMCC No:61336。本发明通过乙醇介导的实验室适应性进化筛选获得一株酿酒酵母突变菌株M3。该菌株在摇瓶发酵条件下，YPD培养基中类胡萝卜素含量可以达到19.7mg/g，比出发菌株提高5.1倍；而在YPM培养基中类胡萝卜素含量可以达到42.4mg/g细胞干重。经基因组测序及反向代谢工程研究，确定PFK1基因失活是类胡萝卜素积累提高的主要因素，为定向改造提供了新的靶点。

摘要： 本发明公开了一种基于密码子突变位点检测氨基酸突变的方法，其特征是，包括如下步骤：步骤S1：首先将数据进行预处理，获取原始密码子数据集C1;步骤S2：通过CMD算法获取单个碱基突变后的密码子数据集C2；步骤S3：通过CMD算法获得氨基酸数据集S1和S2;步骤S4：对氨基酸数据集S1和S2进行比对；步骤S5：输出氨基酸突变数据。本发明基于CMD密码子突变检测的机器学习算法对检测氨基酸突变进行检测，效率高且节约成本。本发明提出的CMD算法考虑了氨基酸的突变诱因，在理论上提高了检测的可信度。通过定位碱基突变来定位突变氨基酸，提高检测准确度。

摘要： 本发明属于基因工程领域，具体涉及纤维寡糖转运蛋白LacY的突变位点、突变转运蛋白LacY及其制备方法和应用。本发明的高效转运纤维寡糖的突变转运蛋白的制备方法，包括：(1)定向进化LacY对纤维寡糖的底物特异性；(2)分析步骤(1)进化样品的氨基酸序列，获取突变位点；(3)构建突变转运蛋白LacY的表达载体，并进行表达获得突变转运蛋白LacY。本发明还提供用上述方法得到的纤维二糖、纤维三糖、纤维四糖的突变转运蛋白LacY的表达载体，含所述表达载体的微生物，以及他们在纤维质利用领域的应用方法。本发明方法制得的突变转运蛋白LacY能够高效转运纤维寡糖，提高纤维质的利用。

摘要： 本发明公开一种肺癌突变位点的突变率的检测方法，其包括：(1)对肺癌患者外周血的血浆样本进行cfDNA的提取，获得cfDNA提取物；(2)针对肺癌相关的EGFR L858R位点设计第一突变型检测探针(序列为SEQ ID NO:5)和第一野生型检测探针(序列为SEQ ID NO:6)、第一引物(序列为SEQ ID NO:1)和第二引物(序列为SEQ ID NO:2)，并且针对肺癌相关的EGFR 19号外显子缺失位点设计第二突变型检测探针(序列为SEQ ID NO:7)、第二野生型检测探针(序列为SEQ ID NO:8)、第三引物(序列为SEQ ID NO:3)和第四引物(序列为SEQ ID NO:4)；(3)以cfDNA提取物为模板，进行ddPCR检测，获得含有敏感性突变位点的扩增产物；(4)对扩增产物进行数据分析，获得EGFR敏感性突变L858R和19Del的突变率。由此，能够灵敏地获得EGFR敏感性突变L858R和19Del的突变率。

摘要： 本发明公开了检测NOP10基因第2号外显子突变位点R34W(C100T)序列的方法和引物，包括扩增NOP10第2号外显子突变位点R34W(C100T)序列的正、反向引物和一对测序引物。将Touch‑down PCR扩增和Sanger测序相结合，可快速检测先天性角化不良症患者体内NOP10基因第2号外显子突变位点R34W(C100T)序列的突变情况。