通过定相合成来进行核酸测序的系统和方法

摘要

提供了通过检测在增长中的核酸链的3’端掺入的荧光核苷酸类似物的身份来对核酸测序的系统和方法。一种方法包括下列步骤：(a)将多个包含模板核酸、配置成与所述模板杂交的引物和聚合酶的复合物固定化于基片的多个光学感测位点，其中所述基片是基于波导的光学扫描系统的一部分；(b)使用聚合酶延伸反应用聚合酶和一种或多种荧光核苷酸类似物将所述引物延伸单个核苷酸，其中每种类型的荧光核苷酸类似物包含任选地配置成抑制进一步的引物延伸的独特荧光标签和/或3’端的封闭剂，且其中所述荧光核苷酸类似物的掺入可逆地终止所述聚合酶延伸反应；(c)通过使用所述光学扫描系统来光学扫描所述基片以检测所述荧光核苷酸类似物的独特标签，从而鉴定通过所述聚合酶反应掺入的所述荧光核苷酸类似物；(d)记录所述基片的光学扫描结果；(e)通过向所述基片的一个或多个光学感测位点提供光切割脉冲光来切割所述荧光标签或所述封闭剂，从而逆转所述聚合酶延伸反应的终止；并(f)重复步骤(b)到(e)。