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血凝素基因

血凝素基因的相关文献在1995年到2021年内共计179篇,主要集中在畜牧、动物医学、狩猎、蚕、蜂、基础医学、分子生物学 等领域,其中期刊论文139篇、会议论文30篇、专利文献184893篇;相关期刊75种,包括微生物学报、疾病监测、中国病毒学等; 相关会议21种,包括山东畜牧兽医学会禽病学专业委员会第四届禽病学术研讨会、福州市科协2014年学术年会、第五届中国兽药大会(中国畜牧兽医学会动物药品学分会2014年学术年会、中国畜牧兽医学会生物制药学分会暨中国微生物学会兽医微生物学专业委员会联合学术论坛)等;血凝素基因的相关文献由643位作者贡献,包括陈化兰、于康震、刘明等。

血凝素基因—发文量

期刊论文>

论文:139 占比:0.08%

会议论文>

论文:30 占比:0.02%

专利文献>

论文:184893 占比:99.91%

总计:185062篇

血凝素基因—发文趋势图

血凝素基因

-研究学者

  • 陈化兰
  • 于康震
  • 刘明
  • 钱爱东
  • 周宇
  • 王伟利
  • 刘秀梵
  • 赵丽
  • 金宁一
  • 唐秀英
  • 期刊论文
  • 会议论文
  • 专利文献

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排序:

年份

    • 万永虎; 郭华; 庄丽; 任丽娟; 郑勤妮; 蒋维佳; 牟鸿江; 李世军
    • 摘要: 目的 了解贵州省H9N2亚型禽流感病毒(avian influenza virus,AIV)的流行与遗传变异情况,为AIV的防控提供依据.方法 统计2018年10月—2019年3月贵州省活禽市场外环境AIV检出情况,对选取的H9N2亚型AIV进行基因组的提取、血凝素(hemagglutinin,HA)基因的RT-PCR扩增与测序,并对获得的HA基因序列进行同源性、遗传进化和关键位点变异分析.结果 贵州省活禽市场外环境AIV检出率为52.2%,H9N2占阳性的83.7%.H9N2亚型AIV HA基因的核苷酸和氨基酸同源性分别为91.6%~100.0%和91.0%~100.0%,均属于Y280亚系,G57基因型;与致病性相关的裂解位点序列均为PSRSSRGLF和LSRSSRGLF,符合低致病性AIV的分子特征;与宿主特异性相关的受体结合关键位点存在H191N、E198T/A和Q234L三个位点的突变,具有人样受体结合特征;与毒力相关的糖基化位点均具有7个,其中因突变218位点均存在一个糖基化位点缺失,313位点均存在一个增加.与人感染毒株相比关键位点未发生重要突变.结论 贵州省活禽市场外环境AIV检出率较高,污染较严重,且以H9N2为优势流行亚型;H9N2亚型AIV均属于Y280亚系,G57基因型,为低致病性AIV,毒株遗传差异在增大,关键氨基酸位点存在变异,具有感染人的风险,故应加强监测该病毒的分子遗传变异情况.
    • 韩光跃; 李岩; 姜彩肖; 杨语嫣; 刘艳芳; 刘兰芬; 齐顺祥
    • 摘要: 目的 了解河北省2017-2020年流行期甲型H1N1流感的流行病学特征及血凝素(haemagglutinin,HA)基因变异进化情况,为流感防控提供科学依据.方法 从中国流感监测信息系统下载河北省2017年4月至2020年3月流感监测数据进行统计分析,选择期间分离的37株甲型H1N1流感毒株,对HA基因进行测序和进化分析.结果 河北省2017-2020年共检测流感样病例(influenza like illness,ILI)咽拭子标本57670份,流感病毒核酸阳性8569份,阳性率为14.86%,其中甲型H1N1占总阳性的比例为40.52%(3472/8569).全省11个地市均有该病例检出,各年龄组均可发病,检出率最高的是25~岁组,冬春季为流行高峰.37株甲型H1N1流感病毒的HA基因均属于6B.1大分支,氨基酸同源性在97.31%~100.00%之间,2017-2018年流行期涉及的主要氨基酸变异位点有S74R、S164T、S183P和I295V;2018-2019年流感毒株主要氨基酸变异位点为S183P、H126Y、N129D、T185I、L233I、N260D;2019-2020年流行株出现D187A和Q189E变异.结论 河北省甲型N1N1流感流行具有明显的季节性,HA基因与其编码的氨基酸逐年变异,2019-2020年流行期甲型H1N1流感流行株与2020-2021年北半球疫苗株A/Guangdong-Maonan/SWL 1536/2019高度同源.
    • 高绪慧; 韩姗姗; 张民霞; 张秀美; 秦立廷; 孙伟; 李志中; 魏笑笑; 吴海洋; 刁秀国; 王晓茹; 武梅; 马芹
    • 摘要: 为了解山东省H9N2亚型禽流感的流行情况,2017年从山东省不同地区分离并鉴定16株H9N2亚型禽流感病毒(AIV)株,并对其血凝素(HA)基因进行扩增、克隆和测序,将所得序列进行同源性和遗传进化分析.结果显示,2017年分离的16株病毒之间HA基因的核苷酸序列同源性为91.2%~99.8%,氨基酸同源性为93.6%~100.0%.系统进化树显示,16株病毒均属于H9.4.2.5分支,表明H9.4.2.5分支毒株仍是山东省H9N2亚型AIV主要流行株.重要氨基酸位点研究显示,16株病毒的HA蛋白的裂解位点仍是K/RSSR↓GLF,符合低致病性AIV的特征;16株病毒的234受体结合位点多为L,除198位受体结合位点存在变异外,其他受体结合位点均保守;16株病毒的潜在糖基化位点有7个~8个,其中7个位点较保守,而218位糖基化位点均缺失,其中3株病毒分别在145位、206位和285位新增糖基化位点.总之,山东省分离的H9N2亚型AIV在分子生物学上发生了部分新的遗传进化,但与临床上病毒的致病性与流行规律的关系还有待于进一步研究.
    • 万永虎; 杨桃梅; 郑勤妮; 庄丽; 任丽娟; 付琳; 米飞; 唐光鹏; 李世军
    • 摘要: 目的 了解贵州省人感染H7N9禽流感病毒血凝素(hemagglutinin,HA)基因的分子特征、溯源和疾病风险,为高致病性禽流感H7N9病毒的预防和控制提供依据.方法 采用实时PCR对5株高致病性禽流感H7N9毒株标本(1株人感染鼻咽拭子标本,4株活禽市场环境标本)进行核酸的提取、HA基因的扩增和测序,运用生物信息学软件对H7N9禽流感病毒HA基因的同源性、遗传进化、受体结合关键位点、致病相关位点和糖基化位点变异情况进行分析.结果 贵州省威宁县人感染H7N9禽流感病毒HA基因与当地活禽市场环境中H7N9禽流感病毒核苷酸和氨基酸同源性分别为99.8%和99.6%,而4株活禽市场环境中的H7N9禽流感病毒核苷酸和氨基酸同源性分别为100.0%和100.0%.与2017年广西人感染的A/Guangxi/5/2017毒株同源性最高,分别为99.7%~99.9%和99.4%~99.8%;与2016年底广东环境中分离的毒株A/Environment/Guangdong/C16283222/2016同源性为99.0%~99.2%和98.9%~99.2%,而与WHO推荐的A/Shanghai/2/2013和A/Anhui/1/2013候选疫苗株的同源性为96.8%~97.0%和95.8%~96.2%.与广西毒株A/Guangxi/5/2017遗传进化距离最近.5株毒株HA蛋白裂解位点突变为PEVPKRKRTAR↓GLF,为高致病性禽流感突变株;受体结合关键位点均发生了G186V的突变,均未发生Q226L突变,5株毒株均发生的新突变为A363S,仅感染人的毒株发生的突变是R56K和I297V;5个潜在糖基化位点中仅421NWT和493NNT发生位置后移的变异.结论 贵州省威宁县5株H7N9禽流感病毒均为高致病性禽流感突变株,候选疫苗株匹配保护效果可能已经降低,HA蛋白裂解位点、G186V和新的突变位点的变异可能增强了H7N9禽流感病毒对人体的易感性和致病性.
    • 赵冰; 叶楚楚; 邹文玮; 马平; 刘青; 孙乔; 郝莉鹏; 朱林英
    • 摘要: Objective To investigate the prevalence and to evaluate the genetic characteristics and the amino acid substitutions of influenza A (H3N2) virus in Shanghai Pudong district during the 2015-2017 influenza season. Methods A total of 5 436 swabs were collected from the influenza like illness (ILI) patients at two influenza sentimental hospitals in Shanghai during January 2015 to July 2017 and were used to detect influenza subtypes by real time RT-PCR. The positive samples were cultured with MDCK cells. The hemagglutinin (HA) genes of 275 strains of influenza A (H3N2) were sequenced and were compared with the HongKong circulating strain and WHO recommended vaccine strain to analyze the amino acid substitutions at key sites. Results Noticeably, approximately 22.9% (1 245/5 436) cases were tested positive, and 54.5% (678/1 245) influenza-positive patients were infected by influenza A (H3N2). The HA sequences of 275 A (H3N2) virus strains were divided into 2 clades, e.g. 3c.2a and 3c.3a and 96.0% (264/275) of strains were belong to 3c.2a clade. Sixty two out of 264 strains were belong to 3c.2a1 subclade which lies in 3c.2a clade. N121K AA substitutions were accounted to a high proportion (10.5%, 29/275). Strains carrying N121K AA substitution in 2017 were accounted for remarkably high proportion (94.1%). Conclusions Influenza A (H3N2) strains were the predominant subtype in Shanghai Pudong district during 2015-2017. The significant increment of influenza A (H3N2) were due to genetic drift caused by HA gene variants.%目的 了解2015—2017年上海市浦东新区甲型H3N2亚型流感病毒流行特征及血凝素(HA)基因变异情况. 方法 收集2015年1月至2017年7月5 436份在上海市浦东新区两所国家级流感监测哨点医院采集符合流感样病例(ILI)定义的鼻咽拭子标本,使用荧光定量PCR进行常见流感亚型检测,核酸阳性样本进行MDCK细胞培养.选取275株甲型H3N2亚型病毒分离株进行HA基因测序,对比同期中国香港流行代表株和世界卫生组织(WHO)推荐疫苗株基因序列,分析关键氨基酸位点替换情况. 结果 流感病毒检出率为22.9%(1 245/5 436),其中54.5%(678/1 245)为甲型H3N2亚型.275株甲型H3N2亚型有效测序毒株HA基因分成3C.2a和3C.3a等2个主分枝,96.0%(264/275)毒株位于3C.2a分枝上,其中62株位于3C.2a1新分枝上;氨基酸替换位点主要为N121K,替换率为10.5%(29/275),在3C.2a1亚分枝中携带N121K替换位点的2017年毒株高达94.1%.结论 甲型H3N2亚型是上海市浦东新区2015—2017年流行的主要流感亚型,其HA基因位点改变带来的基因漂移是造成流行高峰的主要原因.
    • 董泽丰; 夏瑜; 王笛; 沈强; 雅雪蓉
    • 摘要: 目的 调查分析苏州市两起家庭聚集性人感染H7N9禽流感疫情流行病学及病原学特征,为该地区人感染H7N9病毒疫情防控提供科学依据.方法 采集聚集性疫情中H7N9病例及其密切接触者咽拭子标本,同时收集流行病学及临床资料,应用实时荧光-聚合酶链式反应(RT-PCR)检测流感病毒及H7N9亚型的特异性基因,对H7N9阳性标本进行病毒分离并测序,比对分析H7N9病毒血凝素基因变异状况.结果 第一起聚集性疫情中2例H7N9病例被成功救治.而第二起聚集性疫情中的1例H7N9死亡,另1例存活.两起疫情中的其他密切接触者无发病报告.H7N9病毒的受体结合位点没有发生变异.引起这两起人感染H7N9禽流感聚集性疫情的病毒血凝素切割位点的氨基酸序列为PEIPKGR↓GLF.耐药位点E120G、R153K、H276Y及R294K未发生改变.结论 H7N9病毒在有血缘关系的近亲属之间可能更容易传播,对于H7N9患者应加强院感防控,防止密切接触者感染.目前,H7N9病毒仅具有有限的人传人能力,尚不能在人际间持续传播,第二起聚集性疫情中的H7N9病毒血凝素基因序列高度同源且仍对奥司他韦等神经氨酸酶抑制剂敏感.
    • 万永虎; 庄丽; 郑勤妮; 任丽娟; 付琳; 蒋维佳; 唐光鹏; 张德著; 李世军
    • 摘要: Objective To understand the molecular characteristics of hemagglutinin (HA) and neuraminidase (NA) as well as the disease risk of influenza virus A H7N9 in Guizhou province.Methods RNAs were extracted and sequenced from HA and NA genes of H7N9 virus strains obtained from 18 cases of human infection with H7N9 virus and 6 environmental swabs in Guizhou province during 2014-2017.Then the variation and the genetic evolution of the virus were analyzed by using a series of bioinformatics software package.Results Homology analysis of HA and NA genes revealed that 2 strains detected during 2014-2015 shared 98.8%-99.2% and 99.2% similarities with vaccine strains A/Shanghai/2/2013 and A/Anhui/1/2013 recommended by WHO,respectively.Two strains detected in 2016 and 14 strains detected in 2017 shared 98.2%-99.3% and 97.6%-98.8% similarities with vaccine strain A/Hunan/02650/2016,respectively.Other 6 stains detected in 2017 shared 99.1%-99.4% and 98.9%-99.3% similarities with strain A/Guangdong/17SF003/2016,respectively.Phylogenetic analysis showed that all the strains were directly evolved in the Yangtze River Delta evolution branch,but they were derived from different small branch.PEVPKRKRTAR ↓ GLF was found in 6 of 24 strains cleavage site sequences of HA protein,indicating the characteristic of highly pathogenic avian influenza virus.Mutations A134V,G186V and Q226L at the receptor binding sites were found in the HA.All the strains had a stalk deletion of 5 amino acid residue "QISNT" in NA protein,and drug resistance mutation R294K occurred in strain A/Guizhou-Danzhai/ 18980/2017.In addition,potential glycosylation motifs mutations NCS42NCT were found in the NA of 9 of 24 strains.Condusions HA and NA genes of avian influenza A (H7N9) virus showed genetic divergence in Guizhou province during 2014-2017.The mutations of key sites might enhance the virulence of the virus,human beings are more susceptible to it.Hence,the risk of infection is increasing.%目的 分析2014-2017年贵州省H7N9禽流感病毒HA和NA基因的分子特征和感染风险.方法 对2014-2017年贵州省获取的18例确诊人感染H7N9病例和6份环境样本分离的H7N9病毒株的HA和NA基因进行扩增,运用生物信息学软件解析其变异和遗传进化.结果 2014-2015年贵州省2株毒株与WHO推荐的A/Shanghai/2/2013和A/Anhui/1/2013疫苗株HA和NA基因的同源性最高,分别为98.8% ~ 99.2%和99.2%;2016年2株和2017年14株与A/Hunan/02650/2016疫苗株同源性最高,分别为98.2%~ 99.3%和97.6%~ 98.8%;2017年其余6株与A/Guangdong/17SF003/2016疫苗株同源性最高,为99.1%~99.4%和98.9%~99.3%.所有毒株均属于长江三角洲分支,但主要聚集为3个次分支.2017年贵州省西部有6株毒株(含2例人感染病例毒株)裂解位点存在插入突变为PEVPKRKRTAR ↓ GLF,具备高致病性禽流感病毒的分子特征;受体结合关键位点存在A134V、G186V和Q226L突变,NA蛋白颈区“QISNT”均缺失,毒株A/Guizhou-Danzhai/18980/2017发生耐药突变R294K,9株毒株NA蛋白糖基化位点发生NCS42NCT突变.结论 2014-2017年贵州省H7N9禽流感病毒HA和NA基因存在遗传差异,关键位点的变异增强了病毒对人体的易感性和毒力,部分毒株发生耐药突变,其感染与致病风险增加.
    • 万永虎; 雷强; 赵德恩; 王开民; 庄丽; 黄艳; 唐光鹏; 李世军
    • 摘要: Objective To investigate the molecular characteristics of H5 subtype avian influenza viruses (AIV) in Weining, Guizhou Province. Methods Nine representative strains were randomly select-ed from H5 subtype AIV that were identified by real-time PCR in Weining, Guizhou Province from 2015 to 2017. Nucleic acid was extracted from each sample and hemagglutinin (HA) genes were amplified and then sequenced. Homology, genetic evolution and the sites related to pathogenicity, receptor binding regions as well as potential glycosylation of H5 AIV were analyzed by bioinformation software. Results Homology analysis revealed that there was 96. 1%-99. 9% and 95. 7%-100% similarity among the nine strains in nu-cleotide and amino acid of HA gene, respectively. These strains belonged to two branches, H5-1 and H5-2. The cleavage site motifs were PLREKRRKR↓GLF for five strains in H5-1 branch and PQRERRRKR↓GLF for four strains in H5-2 branch, which made them high pathogenic. QSG and QRG at the key receptor bind-ing sites were found in H5-1 and H5-2 branch strains, respectively. They were responsible for receptor bind-ing specificity of AIV. Mutations of 138Q, 139G and 53K were all detected in the nine strains. 129K, 189T, 140K and 282V mutations were discovered in the five strains of H5-1 branch, while 189N, 140M and 282I mutations were found in the four strains of H5-2 branch. Results of the glycosylation motif analysis showed that six sites were conservative, but there was an addition of 124NHT site in two strains of H5-2 branch isolated in 2017. Conclusion Two high pathogenic H5 subtypes of AIV could be epidemic in Wein-ing, Guizhou Province during 2015 to 2017. Although H5 subtype AIV did not possess specific receptor binding regions like human influenza viruses, they were in continuous variation with an increase in glycosyla-tion motifs, which might enhance their virulence and pathogenicity to human beings. Hence, surveillance and study on the molecular properties of H5 subtype AIV should be strengthened.%目的 了解贵州省威宁H5亚型禽流感病毒的分子遗传特征,为禽流感病毒的研究与防控提供依据.方法 对选取的9 株 H5 亚型禽流感毒株标本进行基因组的提取、血凝素基因(hemagglutinin, HA)的扩增和测序,运用生物信息学软件分析HA基因的同源性、遗传进化、致病相关位点、受体结合关键位点和糖基化位点变异情况.结果 贵州省威宁2015—2017年9株H5亚型AIV的HA基因核苷酸和氨基酸同源性分别为96. 1% ~99. 9%和95. 7% ~100% ,分属于H5-1 和H5-2两大分支. H5-1 分支中5 株毒株裂解位点均为 PLREKRRKR↓GLF,H5-2 分支中4 株均为PQRERRRKR↓GLF,全部属于高致病性毒株.受体结合关键位点H5-1分支中5 株均为QSG,H5-2分支中4株均为 QRG,仍全部为禽流感病毒特异性受体结合区. 9 株毒株受体结合区均发生了138Q、139G和53K的突变,其中H5-1分支中5株毒株均存在129K、189T、140K和282V的突变,H5-2分支中4株均存在189N、140M和282I的突变. 9株毒株6个糖基化位点较稳定,但2017年H5-2分支中的2株毒株存在一个糖基化位点124NHT的增加.结论 贵州省威宁2015—2017年H5亚型禽流感病毒可能存在两种型别的流行,均属于高致病性禽流感病毒,虽不具有人源流感病毒特异性受体结合区,但病毒存在持续不断地变异,且糖基化位点有增多趋势,存在毒力增强和感染人的风险,故应加强监测与研究.
    • 单芬; 吴其锐; 邹洁建; 花福有; 陈武
    • 摘要: 对分离自国内虎源的犬瘟热病毒进行细胞培养及PCR鉴定,并对H蛋白进行序列及遗传演化分析.结果显示:本分离株经传代培养后可以引起Vero细胞脱落和死亡,且扩增出580 bp的特异性目的片段.H蛋白作为犬瘟热病毒表面膜蛋白,在病毒感染过程中担负着重要的作用,H蛋白识别并吸附于细胞表面受体,决定病毒细胞嗜性,进而决定病毒的宿主特异性.对本研究中H蛋白进行分析发现:全长共1 824个碱基,共计编码608个氨基酸,H蛋白具有9个N-糖基化位点,具有549Y的特点.在Genbank中进行Blast分析表明,分离株的H序列与登录号为AF178038的小熊猫源、登录号为KM386683的东北虎源犬瘟热分离株的核苷酸序列相似性最高,均为99%.下载犬瘟热相关序列进行遗传演化、氨基酸序列比对分析,发现本分离株的H基因与标准强毒株A75/17的氨基酸同源性为96.2%,与疫苗Onderstepoort株的氨基酸同源性为89.8%.遗传演化分析显示本分离株基因型属于Asia-1型,与我国流行的野毒株相似.
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