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AFLP

AFLP的相关文献在1990年到2022年内共计1467篇,主要集中在园艺、农作物、分子生物学 等领域,其中期刊论文1378篇、会议论文39篇、专利文献50篇;相关期刊370种,包括生物技术通报、西北植物学报、作物学报等; 相关会议30种,包括中国园艺学会南瓜分会2009年学术研讨会、西南地区南瓜产业化发展论坛、第三届会员代表大会、中华中医药学会2008年药用植物化学与中药有效成分分析研讨会、中国园艺学会观赏园艺专业委员会2008年学术年会等;AFLP的相关文献由4206位作者贡献,包括张启翔、邢世岩、王斌等。

AFLP—发文量

期刊论文>

论文:1378 占比:93.93%

会议论文>

论文:39 占比:2.66%

专利文献>

论文:50 占比:3.41%

总计:1467篇

AFLP—发文趋势图

AFLP

-研究学者

  • 张启翔
  • 邢世岩
  • 王斌
  • 马峙英
  • 傅廷栋
  • 王清印
  • 包振民
  • 张军丽
  • 张开春
  • 张桂华
  • 期刊论文
  • 会议论文
  • 专利文献

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关键词

    • 李永涛; 王振猛; 杨庆山; 周健; 王莉莉; 刘德玺; 魏海霞
    • 摘要: 【目的】探究山东省野生豆梨种质资源的遗传多样性及亲缘关系,为其种质资源收集、保存以及育种材料的选择提供理论依据。【方法】采用AFLP分子标记技术对山东省分布的6个群体61个野生豆梨单株的遗传多样性进行了分析。【结果】8对引物组合共扩增出清晰条带1344条,平均每对引物组合扩增出168条带,其中多态性条带有1340条,多态位点百分率为99.75%。扩增条带中包含特异性条带179条,通过这些特异性条带可对88.52%的野生豆梨单株进行鉴别。6个野生豆梨群体的多态位点百分率(PPB)、观测等位基因数(Na)、有效等位基因数(Ne)、Nei’s多样性指数(H)及Shannon’s信息指数(I)的变化范围分别为24.07%~55.09%、1.2407~1.5509、1.1541~1.2378、0.0905~0.1455及0.1346~0.2271。AMOVA分析显示,12.53%的变异来自群体间,87.47%的变异来自种群内。UPMGA聚类分析得出,61个单株的遗传相似性系数介于0.7378~0.8843之间,平均值为0.8068。在遗传相似系数0.806处可划分为5组,其中部分来源于同一地区的单株并没有完全聚为一组,而在遗传相似性系数0.824处分割时,还可将第Ⅴ组分为8个亚组,且亚组中来源于同一地区的资源倾向于聚为一类,主效应分析结果和UPGMA结果基本一致。【结论】山东省野生豆梨群体间存在一定的基因交流,各群体内遗传分化程度大于群体间,且群体间的地理来源和遗传变异程度并没有严格的相关性。
    • Chunwang LAI; Yuling LIN; Xiaojuan ZHOU; Ting PENG
    • 摘要: [Objectives]The paper was to analyze the differences of genes and genome methylation between‘lane late’navel orange and it’s bud sport pumpkin-like navel orange,and to reveal the causes of bud sport.[Methods]Amplification fragment length polymorphism(AFLP)and methylation sensitive amplification polymorphism(MSAP)were used to analyze the differences in genes and genome methylation of‘lane late’navel orange and its bud sport pumpkin-like navel orange.[Results]Gene mutation occurred between the‘lane late’navel orange and its bud sport pumpkin-like navel orange.A total of 15 differential bands were obtained by AFLP markers,and the percentage of polymorphic bands was 6.0000%.Meantime,10 differential bands were obtained by MSAP markers,and the percentage of polymorphic bands was 5.4645%.The semimethylation rate and permethylation rate of‘lane late’navel orange were higher than that of pumpkin-like navel orange,that is,pumpkin-like navel orange had demethylation(demethylation ratio was 1.6393%).[Conclusions]It is proved at the DNA level that the emergence of bud sport pumpkin-like navel orange is due to gene mutation,and the DNA methylation level of the bud sport material has also changed.This study lays a foundation for further exploring the mechanism of bud sport.
    • 闫春梅; 高春山; 陈伟强; 李忠强; 金香琴
    • 摘要: 为了解吉林省杂色杜父鱼野生群体遗传多样性,应用扩增片段长度多态性(amplified fragment length polymorphism,AFLP)标记技术,对漫江、三道松江河和鸭绿江上游采捕的3个杂色杜父鱼群体总计30个个体的遗传多样性、遗传变异及遗传相似性进行分析,并构建系统进化树。8组引物组合总计扩增出915个条带,其中多态性位点843个,占比92.1%。3个群体的观测等位基因数(N_(a))分别为1.3166、1.3067、1.2037,有效等位基因数(N_(e))分别为1.1517、1.1342、1.1119,Nei’s基因多样性指数(H)分别为0.0912、0.0816、0.0670,Shannon’s信息指数(I)分别为0.1410、0.1273、0.1020,其中漫江群体的遗传多样性水平最高,鸭绿江上游群体最低;3个群体的遗传分化系数(G_(st))平均值为0.2860,表明3个群体之间发生了一定程度的分化;30个个体的遗传相似性在0.8090~0.9456,表明所采集的30尾杂色杜父鱼个体间存在较丰富的遗传变异,该鱼对环境具有较强的适应性。
    • 潘蓉蓉; 钟秋蔚; 张露; 马际凯; 程强强; 袁生贵; 孙荣喜
    • 摘要: 以江西九连山国家级自然保护区毛红椿天然林为研究材料,对毛红椿AFLP反应体系中的DNA提取方法、酶切与连接步骤、连接产物稀释倍数、预扩增产物稀释倍数等影响因子进行优化,并筛选AFLP多态性高的引物。结果表明:不同提取方法对DNA质量有很大影响,试剂盒法提取的DNA杂质少,质量高;酶切与连接采用一步法完成;连接产物最适稀释倍数为3倍,预扩增产物最适稀释为10倍;利用4个天然居群的毛红椿基因组DNA从64对引物组合中筛选出4对具有多态性扩增条带的引物,总扩增出147个位点,其中多态性位点122个,平均多态位点百分率84.36%,多态性较高,适用于毛红椿AFLP分析的4对引物组合分别是:E1/M6、E4/M7、E5/M3、E5/M8,为毛红椿遗传多样性和种质资源研究奠定了基础。
    • 赖春旺; 周小娟; 米兰芳; 陈健美; 欧阳欢; 钟八莲
    • 摘要: 【目的】探究不同成熟期的脐橙在基因组、甲基化修饰水平和变异模式方面的差异,为挖掘早熟性状分子标记,探讨脐橙早熟芽变性状与DNA甲基化的关系及早熟性状相关候选基因的筛选奠定基础。【方法】以纽荷尔脐橙、纽荷尔早熟芽变品种赣南早脐橙及赣南早的早熟性状回复型突变体(性状回复型)为试材,采用扩增片段长度多态性技术(amplified fragment length polymorphism,AFLP)和甲基化敏感扩增多态性分析(methylation sensitive amplification polymorphism,MSAP)对其在基因组、甲基化修饰水平和变异模式方面的差异与脐橙早熟性状之间的关系进行探究。【结果】采用AFLP与MSAP技术均发现较多多态性条带,其中AFLP的多态性占比(5.5046%~5.5556%)高于MSAP(1.3699%~3.2110%),发现7对引物共8条多态性条带与脐橙熟期性状共分离。试材DNA甲基化发生频率为13.7614%~16.8182%,平均14.9116%,全甲基化为主要的甲基化方式。试材超甲基化发生频率显著高于去甲基化发生频率,性状回复型果实熟期回复推测与CHG去甲基化相关。【结论】在基因层面证明性状回复型为赣南早的回复型突变体。脐橙果树在形成不同熟期芽变材料过程中,基因组DNA的超甲基化与去甲基化同时发生,但以超甲基化为主。本研究为进一步阐明脐橙果实熟期性状的发生发展机制提供指导。
    • 杨伟; 代应贵; 安丹丹; 韩虎峰
    • 摘要: 为了解珠江水系北盘江光唇裂腹鱼(Schizothorax lissolabiatus)种群遗传多样性的现状,采用8个引物组合对其30尾个体进行了全基因组DNA扩增片段长度多态性AFLP分析.每个引物组合扩增片段数在8~73之间,扩增片段长度为69~500 bp,基因型数为28~30.8个引物组合共计检测出扩增位点975个,平均每个引物组合扩增出121.88个位点;其中多态性位点897个,多态位点比例为92.00%.观测等位基因数(Na)、有效等位基因数(Ne)、Nei遗传多样性指数(H)、Shannon信息指数(I)平均值分别为1.9123、1.3690、0.2271和0.3575.个体间遗传距离为0.2147~0.4109,平均为0.3040.基于个体间遗传距离构建的UPGMA和NJ系统树具有相似的拓扑结构,均显示30尾光唇裂腹鱼聚为两支,可能分别来源于两个亚群体.北盘江光唇裂腹鱼种群遗传多样性丰富,但由于受水电站建坝、水质污染、过度捕捞等因素的影响,该种群的分布区已缩小,种群数量减少,种群遗传变异离散程度较低并存在着等位基因丢失的现象,应采取措施恢复北盘江光唇裂腹鱼的种群数量,保护其遗传多样性.
    • 安丹丹; 代应贵; 邹习俊
    • 摘要: 本研究采用扩增片段长度多态性(AFLP)分子标记技术,以筛选出的7对引物,对采自贵州乌江的30尾四川裂腹鱼(Schizothorax kolzovi)的遗传结构和多样性进行分析.结果显示,用7对引物获得的扩增片段数为5~73,扩增片段长度范围为69~500bp,共检出扩增位点856个.其中,多态位点796个,占扩增总位点数的92.99%.该种群含30个基因型,其观测等位基因数(Na)、有效等位基因数(Ne)、Nei多样性指数(H)、Shannon信息指数(Ⅰ)平均值分别为1.933 6、1.338 8、0.212 2和0.338 7.个体之间遗传距离为0.169 1~0.531 9,平均为0.306 8.根据遗传距离,采用UPGMA法和NJ法得到了拓扑结构相似的30个个体的系统树,该系统树由2个分支组成.其中,个体1为一个分支,而其余29个个体聚为另一个分支.乌江四川裂腹鱼种群具有较丰富的遗传多样性.然而,受水电站建坝、河流污染和酷渔滥捕的影响,该种群分布区已缩小,种群数量减少,处于生态受威胁状态,需要开展对乌江四川裂腹鱼种群及种质资源的保护.
    • 陈铭; 范蔓桦; 张癸新; 李子博; 李清清; 李江涛; 周萌; 梁日深; 林蠡
    • 摘要: 为从分子水平澄清我国仿石鲈科(Haemulidae)鱼类分类争议,研究测定分析了仿石鲈科及其相关科属共66种鱼类的线粒体DNA细胞色素b(Cyt b)部分序列,结合AFLP标记信息,共同探讨仿石鲈科及相关争议科属系统分类关系.结果 表明,在Cyt b基因上,66种鱼类一致序列为729 bp,编码243个氨基酸;AFLP图谱中,6对引物组合共得到669条清晰条带,多态性条带669条,多态性比率100%.基于Cyt b基因利用最大似然法与AFLP标记基于UPGMA聚类法构建的系统进化树大致相同,进化树上,(1)仿石鲈科鱼类主要形成石鲈亚科(Haemulinae)与胡椒鲷亚科(Plectorhynchinae)两大分支,石鲈属(Pomadasys)、仿石鲈属(Haemulon)、异孔石鲈属(Anisotremus)等7个属聚为石鲈亚科分支,胡椒鲷属(Plectorhinchus)、少棘胡椒鲷属(Diagramma)与矶鲈属(Parapristipoma)3个属聚为胡椒鲷亚科分支.(2)髭鲷属(Hapalogenys)与眶棘鲈属(Scolopsis)没有与仿石鲈科聚在一起,髭鲷属独自形成一支,眶棘鲈属与金线鱼科(Nemipteridae)聚为一支.(3)鯻科(Teraponidae)的种类也没有与仿石鲈科鱼类相聚,鯻科与舵鱼科(Kyphosidae)、石鲷科(Oplegnathidae)存在更近的亲缘关系.对于仿石鲈科及相关科属的分类争议,研究支持仿石鲈科分为石鲈亚科与胡椒鲷亚科两个亚科,以及鯻科、眶棘鲈属、髭鲷属不应该归为仿石鲈科的观点.
    • 窦霄; 陈俊强; 董章凯; 刘红; 段正洪
    • 摘要: 为研究木槿种质资源的遗传多样性及遗传关系,采用AFLP分子标记技术,对41份木槿种质资源进行遗传多样性和亲缘关系分析.结果 表明:9对AFLP引物对41份供试种质进行选择性扩增后,共产生谱带733条,其中多态性条带699条,多态性位比率平均为95%;Nei基因多样性指数为1.1801~1.2515,平均值1.2076;Shannon信息指数为0.1863~0.2445,平均值0.2035.通过聚类分析,41份木槿种质的Dice相似性系数为0.702~0.932,并在0.87处将供试材料分为5大类.研究认为,来源相同的木槿种质并未严格聚在一起,表明供试木槿种质表现出较大的遗传差异和丰富的遗传多样性,亲缘关系与材料来源没有绝对的相关性.
    • 葛丽丽; 李伟; 薛俊刚; 其其格; 高新; 张启昌
    • 摘要: 以吉林省长白山地区4个海拔梯度(600、1000、1400 m和1800 m)的野生蓝靛果忍冬为试材,采用AFLP分子标记技术,研究了不同海拔梯度野生蓝靛果忍冬间的遗传多样性,以期为蓝靛果忍冬野生资源的保护与利用和优质种质资源的选育提供参考依据.结果 表明:野生种群间Nei基因多样性指数和Shannon信息指数的均值分别为0.4675和0.6602.总基因多样度为0.4620,基因分化系数为0.0065,说明总体上不同海拔种群间遗传多样性较高.各种群遗传多样性从高到低依次为1400、1000、680m和1800m.基于遗传距离通过非加权组平均法(UPGMA)将4个海拔种群分为2组,其中低海拔600m和1000m一组;高海拔1400m和1800m一组.
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