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cDNA末端快速扩增

cDNA末端快速扩增的相关文献在2001年到2021年内共计70篇,主要集中在分子生物学、畜牧、动物医学、狩猎、蚕、蜂、水产、渔业 等领域,其中期刊论文66篇、会议论文2篇、专利文献382769篇;相关期刊53种,包括海洋与湖沼、生物技术通报、生物技术通讯等; 相关会议2种,包括中国蚕学会第六届青年学术研讨会、第十三次全国动物遗传育种学术讨论会等;cDNA末端快速扩增的相关文献由305位作者贡献,包括孙延鸣、沈文、冯玉兰等。

cDNA末端快速扩增—发文量

期刊论文>

论文:66 占比:0.02%

会议论文>

论文:2 占比:0.00%

专利文献>

论文:382769 占比:99.98%

总计:382837篇

cDNA末端快速扩增—发文趋势图

cDNA末端快速扩增

-研究学者

  • 孙延鸣
  • 沈文
  • 冯玉兰
  • 刘方
  • 刘正飞
  • 吴灶和
  • 周开亚
  • 夏定国
  • 尤纬缔
  • 张业顺
  • 期刊论文
  • 会议论文
  • 专利文献

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排序:

年份

    • 颜帅; 唐小超; 余典梅; 王海燕; 孟雯雯; 唐萍萍; 王贤纯
    • 摘要: 间斑寇蛛Latrodectus tredecimguttatus的一个显著特点是其毒腺外组织甚至卵粒中也存在毒性成分.研究毒腺外的毒素不但可以加深对蜘蛛毒素的了解,而且可以发现具有重要应用前景的新型毒素分子.为了探究间斑寇蛛卵粒中低丰度表达的蛋白质类毒素,利用生物信息学方法从间斑寇蛛卵粒转录组中挖掘出一条编码多肽毒素的基因序列,利用基于3'-RACE和巢式PCR的策略成功克隆并异源表达了该基因.表达的多肽毒素命名为间斑寇蛛卵粒毒素-Ⅵ(Latroeggtoxin-Ⅵ,LETX-Ⅵ).生物学活性鉴定结果表明,LETX-Ⅵ能抑制ND7/23细胞膜上的钠离子通道电流和促进PC12细胞多巴胺的释放,但对美洲蜚棟Periplaneta americana和金黄色葡萄球菌及白色念珠菌等细菌和真菌不显示明显的毒性,说明LETX-Ⅵ是一种哺乳动物特异的神经毒素,在神经生物学研究工具试剂和相关疾病治疗药物的研发等方面具有潜在的应用前景.
    • 范勇; 王兰; 张左兵
    • 摘要: 目的:从中华鳖脾脏、肝脏、肠道构建的SMARTer cDNA文库中克隆中华鳖白细胞介素21(IL-21)基因的cDNA.方法:采用cDNA末端快速扩增(RACE)法克隆中华鳖IL-21基因cDNA序列,并利用生物学软件进行生物信息学分析.结果:中华鳖IL-21 cDNA长874 bp,其编码产物包含135个氨基酸残基,二级结构主要包括α螺旋、延伸链、无规则卷曲和β转角,三级结构包括信号肽和IL-15结构域.系统进化分析表明其与鸟类首先聚类,其次为哺乳类.以人IL-21为模型,构建了中华鳖IL-21的3D结构模型.结论:从生物信息学分析可知我们所获序列为中华鳖IL-21 cDNA,为深入研究中华鳖IL-21及相关通路奠定了基础.
    • 王继雪; 孙延鸣
    • 摘要: [目的]为扩增巴什拜羊的肺表面活性物质相关蛋白A(Pulmonary surfactant-associated protein A,SP-A)基因cDNA全长序列并对该序列进行分析.[方法]根据已报道的GenBank中绵羊SP-A基因的开放阅读框序列来设计RACE引物,后用RACE法对巴什拜羊SP-A基因的3’端和5’端序列进行扩增,经华大公司测序和DNAMAN软件拼接最终得到巴什拜羊的SP-A基因cDNA序列全长.[结果]克隆得到SP-A基因的cDNA其全长为1962 bp,其开放阅读框序列长度为789 bp,编码的氨基酸数量为262,经DNASTAR软件分析其蛋白的分子量为27.53 kDa,等电点4.949.分析系统进化树后发现巴什拜羊与绵羊氨基酸的序列同源性最高.[结论]本研究结果可为后续更加深入研究新疆巴什拜羊SP-A基因的功能奠定基础.
    • 黄书婷; 刘秋萍; 邓川; 和野; 熊力; 牛纯青; 陈韵; 刘堰
    • 摘要: Heat shock protein (HSP) 70, as a molecular chaperone and extensively studied protein in environ-mental toxicology, plays a key role in membrane translocation, protein degradation, and regulatory process. However, as toxicology and risk assessment of freshwater, characterizations of HSP70 in rare minnow, Gobio-cypris rarus, remain unknown. In this paper, we described the full-length cDNA of HSP70, designated as GrHSP70, by cloning through rapid-amplification of cDNA ends (RACE) technique from the liver of Gobio-cypris rarus for the first time. The GrHSP70 shares high nucleotide sequence homolog, corresponding to amino acid sequence homology (>95%) with other fish species by NCBI blast analysis. Through quantitative real-time PCR (RT-PCR), we obtained the distribution of GrHSP70 in thirteen tissues of the untreated Gobio-cypris rarus juveniles and its expression profile in liver after pentachlorophenol (PCP) exposure. The re-sults indicated that mRNA transcription level of GrHSP70 is tissue-dependent, with the highest expression in the gonad tissue. Moreover, GrHSP70 is significantly up-regulated in liver by a concentration/time-depen-dent manner after PCP exposure. In summary, our results suggest that GrHSP70 may serve as a very sensi-tive biomarker for a toxicology and risk assessment of freshwater pollution in China.%为研究稀有逗鲫(Gobiocypris rarus) HSP70用于淡水毒理学和风险评估方面的可行性,通过cDNA末端快速扩增的方法首次从稀有逗鲫肝脏中成功克隆出HSP70基因的cDNA全长,命名为GrHSP70。NCBI比对分析结果显示, GrHSP70核苷酸序列与其他鱼类的HSP70基因的核苷酸序列相似性极高,相应的氨基酸序列同源性也高(大于95%)。通过实时定量PCR获得未经污染物暴露的稀有逗鲫幼鱼体内13种组织中GrHSP70的分布以及PCP暴露后肝脏中该基因的表达图谱,结果表明GrHSP70在稀有逗鲫体内的表达呈现出组织依赖性,在性腺组织中的表达最高。此外,在不同时间﹑不同浓度的PCP暴露下稀有逗鲫肝脏中GrHSP70的表达模式呈现出显著的时间-剂量依赖效应。总之, GrHSP70可作为一种非常敏感的生物标志物,适用于中国淡水环境污染的毒理学研究及风险评估。
    • 摘要: 为了更好地利用生物技术手段提高观赏凤梨的开花质量,该研究在分析蜻蜓凤梨转录组数据的基础上,根据同源性比对发现了一个类TERMINAL FLOWER1(TFL1)基因的cDNA片段,结合cDNA末端快速扩增(rapid amplification of cDNA ends,RACE)技术获得了其937bp的CDNA全长,并将其命名为AfTFL1。
    • 龙登凯; 丁铃; 李军; 周涛; 江维克; 肖承鸿
    • 摘要: 为了获取可靠内参基因,采用同源克隆技术和cDNA末端快速延伸技术,首次从太子参中克隆3-磷酸甘油醛脱氢酶基因(GAPDH)的部分cDNA序列,命名为PhGAPDH,序列长度为981 bp,包含699 bp的部分阅读框,推测其编码232个氨基酸,还含有282 bp的3'UTR.序列分析结果表明,太子参PhGAPDH基因编码的氨基酸序列与同科植物香石竹(Dianthus caryophyllus)氨基酸序列同源性高达99%.PCR分析结果表明,PhGAPDH基因在太子参不同种源块根、同一种源不同组织及不同生长时期的表达水平较稳定,可以作为太子参功能基因研究的内部参考基因.
    • 高宝德; 张晓丽; 沈文; 孙延鸣
    • 摘要: 为了克隆盘羊与巴什拜羊杂交后代短鄂、肺及鼻咽上皮细胞克隆1(SPLUNC1)基因cDNA全长序列,本研究根据GenBank上已公布的牛、山羊的SPLUNC1基因序列来设计简并引物,以盘羊与巴什拜羊杂交F1代为材料,克隆出盘羊与巴什拜羊杂交后代SPLUNC1基因的片段序列,再利用RACE法克隆其SPLUNC1基因3’端和5’端,测序后拼接获得SPLUNC1基因全长cDNA序列.结果显示,盘羊与巴什拜羊杂交后代SPLUNC1基因的cDNA全长为1117 bp,5’非编码区(UTR)为84 bp,3'UTR为265 bp,开放阅读框(ORF)为768 bp,编码255个氨基酸.预测该基因编码蛋白的等电点5.006,分子量26.57 kDa.系统进化分析表明,盘羊与巴什拜羊杂交后代SPLUNC1氨基酸序列与绵羊的氨基酸序列同源性最高.本研究克隆了盘羊与巴什拜羊杂交后代SPLUNC1基因全长cDNA序列,为后续深入研究该杂交后代SPLUNC1基因的功能奠定基础.
    • 安红强; 范静; 梁易; 裴薇; 王万军
    • 摘要: 目的:克隆铁皮石斛泛素结合酶基因DoUBC24,预测其蛋白结构特征和进化关系,分析其时空差异表达情况,并推测其在植物生长发育中的功能.方法:提取铁皮石斛全苗总RNA,采用cDNA末端快速扩增(RACE)和巢式PCR技术克隆DoUBC24基因;用生物信息手段分析基因序列结构特征,并预测其编码蛋白及其理化性质和亚细胞定位;用MEGA6.0构建系统发育树,分析物种进化关系;用qRT-PCR检测DoUBC24在原球茎不同发育时期及不同组织中的相对表达量.结果:克隆得到基因全长为3811 bp,包含2880 bp的CDS,编码959个氨基酸残基,编码产物含有一个保守的UBCc结构域;分子进化分析显示,DoUBC24同海枣、油棕、小果野芭蕉、玉米、短花药野生稻、二穗短柄草和大麦等单子叶植物的亲缘关系较近;qRT-PCR分析显示,DoUBC24在铁皮石斛叶原基维管系统形成、原球茎退化时期表达显著下降,而在椭球形原球茎、根端分生组织和类原球茎中表达量较高,在组织中的表达量水平依次为花>茎>种子>根>叶.结论:铁皮石斛泛素结合酶DoUBC24基因在铁皮石斛原球茎不同发育时期及不同组织中均有显著的差异表达,可能对原球茎发育及植物组织的形态建成具有重要调控作用.
    • 孙赛红; 刘圣聪; 孟雪松; 王秀利; 马普; 孙鹤; 孔德荣; 李慧; 仇雪梅; 姜志强; 刘海映; 刘洋
    • 摘要: Interferon Regulatory Factor(IRF)is a transcription factor with multifunctions. The full length cDNA ofTakifugu rubripes interferon regulatory factor 2(IRF2)was cloned by RT-PCR and rapid amplification of cDNA ends(RACE). The full-length cDNA of the gene was 1 552 bp,including a 187 bp 5' non-coding region,a 429 bp 3' non-coding region,and 936 bp coding region,and it encoded 311 amino acids. The recombinant pET32a(+)-IRF2 was constructed by ligating code sequence ofIRF2 with prokaryotic expression vector pET32a(+). Then,the recombinant genetic engineering bacteria with expressed IRF2 were obtained by transforming pET32a(+)-IRF2 into competent cell Escherichia coli BL21(DE3). pET32a(+)-IRF2 was expressed in BL21 under the induction of IPTG. The results from the detection of the purified products by Western blotting showed that the expression of theIRF2 gene in E. coliwas high,and thetarget protein was accurate.%干扰素调节因子(Interferon regulatory factor,IRF)是一种多功能的转录因子。采用反转录聚合酶链式反应(RT-PCR)和cDNA末端快速扩增(RACE)技术克隆了红鳍东方鲀干扰素调节因子2(Interferon regulatory factor 2,IRF2)基因的全长cDNA。该基因全长为1552 bp,其中5'非编码区(5'-UTR)187 bp,3'非编码区(3'-UTR)429 bp,编码区(CDS)为936 bp,共编码311个氨基酸。将IRF2的编码区序列连接到原核表达载体pET32a(+),成功构建了重组体pET32a(+)-IRF2。将重组体pET32a (+)-IRF2转入大肠杆菌感受态细胞BL21(DE3)中,获得了重组表达IRF2的基因工程菌。经IPTG诱导,pET32a(+)-IRF2在BL21中得到了融合表达。通过对表达产物的纯化和Western blotting检测,结果显示红鳍东方鲀IRF2基因在大肠杆菌中的表达效果较高,目的蛋白准确。
    • 杨文; 沈文; 郭海英; 陈冬梅; 陈凯丽; 孙延鸣
    • 摘要: [目的]克隆巴什拜羊杀菌/通透性增强蛋白(BPI)的cDNA序列,为研究该蛋白的结构和功能奠定基础.[方法]采集巴什拜羊外周血液,从中分离得到中性粒细胞后提取RNA.根据GenBank中牛BPI基因的cDNA序列设计兼并引物,用RT-PCR方法扩增巴什拜羊BPI基因部分序列,再根据已知的巴什拜羊BPI基因部分序列设计RACE引物,分别扩增出5 '和3'端目的片段,分别回收克隆的目的基因片段,再与pMD18-T载体连接,分别转化到大肠杆菌DH5α中,筛选阳性克隆,将重组菌测序后进行拼接,获得巴什拜羊BPI基因全长cDNA序列,并对序列进行分析.[结果]克隆的巴什拜羊BPI基因cDNA序列全长1 922 bp,其中开放阅读框为1 452 bp,共编码483个氨基酸;BLAST分析表明,巴什拜羊BPI基因的核苷酸序列与绵羊、牛、虎鲸、野猪、猕猴、人、家兔、小鼠、非洲爪蟾核苷酸的一致性分别为99%,91%,78%,74%,64%,61%,58%,53%和50%;氨基酸进化分析显示,巴什拜羊首先与绵羊聚为一类,其次与牛聚为一类,该聚类分析结果与生物学分类结果表现一致.[结论]通过RACE方法成功地克隆了1 922 bp的巴什拜羊BPI基因cDNA全长序列,且基因进化树聚类结果与生物学分类结果相一致.
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