三级结构

摘要： 本实验以市售鲜蛋制备得到的蛋清为原料,分别利用巴氏杀菌和超高压杀菌处理(200~300 MPa,2.5~12.5 min),经喷雾干燥后,采用圆二色光谱、傅里叶变换红外光谱、紫外光谱、荧光光谱和动态光散射激光粒度仪等研究超高压杀菌处理对蛋清蛋白的构象、粒径、表面电位、起泡特性的影响。结果表明,巴氏杀菌和超高压杀菌处理均对蛋清蛋白构象产生不可逆改变;随着杀菌压力的增加,α-螺旋和无规卷曲的相对含量增大,β-折叠和β-转角相对含量降低;超高压处理后样品荧光强度低于未处理鲜蛋,随压力的升高和保压时间的延长,总体呈先升高后降低趋势;高压处理能够促使酪氨酸、色氨酸和苯丙氨酸残基暴露,但随着保压时间的延长,暴露的氨基酸残基又会被重新包埋。此外,压力还会诱导蛋清聚集,随着杀菌压力的升高和保压时间的延长,蛋清粒径呈先升高后下降的趋势,且分布均匀;300 MPa下,表面电位、起泡性和泡沫稳定性随着杀菌时间的延长出现了先增强后减弱的趋势,在7.5 min达到最大值;200 MPa及250 MPa下起泡性和泡沫稳定性持续增强。与巴氏杀菌相比,超高压杀菌对二级结构破坏更大,对三级结构破坏较小,有效提高了蛋清多分散系数、表面电位、起泡性和泡沫稳定性。

摘要： 为探究冷冻对大豆分离蛋白结构和乳化性质的影响,选取0.04 g/mL大豆分离蛋白溶液进行研究,以-5°C和-20°C作为冷冻温度,冷冻3 d.通过傅立叶红外光谱、内源荧光光谱、十二烷基硫酸钠-聚丙烯酰胺凝胶电泳(sodium dodecyl sulfate polyacrylamide gel electrophoresis,SDS-PAGE)、静态多散射稳定性分析仪以及倒置荧光显微镜等方法,研究冷冻处理对大豆分离蛋白微观结构以及乳化性质的变化影响.结果表明,经冷冻处理和未经冷冻处理的大豆分离蛋白亚基组成基本相同,冷冻使蛋白产生可逆变性;冷冻处理后的样品最大吸收峰在340 nm,证明冷冻后的大豆分离蛋白三级构象发生变化;冷冻后蛋白的β-类型结构均少于80％,β-折叠和无规卷曲结构增多、β-转角减少,表明冷冻使大豆分离蛋白结构趋于无序化.通过研究浓度为0.002 g/mL大豆分离蛋白乳状液的粒径分布、稳定性和微观结构,发现未经冷冻处理的大豆分离蛋白乳状液粒径多数在20μm以下,冷冻后,乳状液粒径峰型变宽,多数粒径分布在10μm～50μm之间,表明产生了聚集体;通过对乳状液微观结构的观察和对稳定性的测定,发现冷冻大豆分离蛋白乳状液中存在蛋白聚集体,且稳定性与未经冷冻处理蛋白乳状液相比明显较差,表明冷冻处理对于大豆分离蛋白的结构及乳化性质带来不利影响.

摘要： 通过比较天祝白牦牛(Bos grunniens)与黄牛(Bos taurus)NGB蛋白三级结构,分析天祝白牦牛NGB蛋白氨基酸位点突变对其三级结构的影响.利用生物信息学在线分析网站及软件对天祝白牦牛和黄牛NGB蛋白的同源性、系统发育进化、三级结构进行比较分析.结果显示,天祝白牦牛NGB蛋白进化趋于保守,83号位点为未知突变,97号位点为保守替换;83号位点突变使得NGB蛋白Ser突变为Pro,主要为R侧链由醇羟基突变为四碳环,侧链结构发生改变,使得83号位点由α-螺旋突变为无规卷曲,突变位于E、F链之间,使得E、F链之间的距离由11.79?变为8.21?,致使与卟啉环中心铁原子相连远端His 64距离由2.17?变为2.10?;97号位点突变使得NGB蛋白Arg突变为Gln,主要为R侧链由氮原子突变为氧原子,且与碳原子通过双键连接,侧链结构未发生改变,使得97号位点突变后仍为α-螺旋,突变基团指向亲水相,羧基端与近端His 96位点相连,致使His 96与卟啉环中心铁原子距离由1.98?变为2.00?.经比较天祝白牦牛两处突变未发生在NGB蛋白核心功能区,对NGB蛋白功能未产生影响;突变造成R侧链基团发生改变,可能对NGB蛋白稳定性、柔韧性及溶解度造成一定影响;核心His 64、His 96与卟啉环中心铁原子距离发生改变,说明突变极有可能会对血红素外源配体结合造成一定影响.

摘要： 本文通过多次催化酯交换方法,研究了最优催化条件下脂肪酶活性和结构的关系,以及低活性脂肪酶的活性再生技术。在催化合成1,3-二油酸-2-棕榈酸甘油三酯的研究中,利用荧光光谱和傅里叶变换红外光谱,分析最优条件下不同使用次数脂肪酶的三级与二级结构,研究脂肪酶活性变化与其二级、三级结构之间的关系。使用异丙醇和混合油脂处理脂肪酶,使低活性脂肪酶的活性得以恢复。研究结果表明:随着脂肪酶活性的降低,脂肪酶荧光强度增强,氨基酸暴露面积逐渐增大,在二级结构中,α-螺旋含量降低,β-折叠含量逐渐增加。通过异丙醇处理,脂肪酶活性恢复到原脂肪酶的75.00%;再经混合油脂处理,脂肪酶活性恢复到原脂肪酶的96.60%,实现了高效催化恢复活性的目的。

摘要： 明确蛋白质与多糖之间静电相互作用对蛋白质结构和热特性的影响,可为深入理解两者静电复合物界面特性机制提供新见解.基于此,本研究借助紫外可见光谱、内源荧光光谱、圆二色谱、傅里叶变换光谱和差示扫描量热仪探究卵白蛋白(Ovalbumin,OVA)与壳聚糖(Chitosan,CS)之间的静电相互作用对OVA二级、三级结构及热特性的影响.结果表明,静电排斥力和静电吸引力都会导致OVA的结构发生去折叠,主要表现为色氨酸残基向亲水区域迁移且暴露程度下降;α-螺旋、β-转角和自由卷曲含量分别下降约26.9％、52.3％、6.0％,β-折叠增加约33.9％.此外,OVA的热变性温度也由于静电结合作用由78°C上升至83°C.这些发现可为利用多糖通过静电作用调控OVA功能特性提供参考和思路借鉴.

摘要： 应用远紫外CD光谱、紫外差光谱、内源荧光光谱以及ANS荧光光谱,探究了钙调磷酸酶B亚基钙结合位点的突变对B亚基结构和功能的影响.结果显示:钙结合位点突变体Y105W激活CNA的能力强于CNB;而E110Q活化CNA的能力弱于CNB;Y105W和E110Q与Ca2+亲和性低于CNB;CNB和它的突变体二级结构趋于一致,但三级结构存在明显差异,这种差异可能是它们功能差异的结构基础.

摘要： 为探究酸性pH值条件抑制芽孢萌发的机理,研究了不同pH值处理对芽孢皮层裂解酶(CwlJ)的活性和结构的影响.采用傅里叶红外光谱法与荧光光谱法来分析芽孢皮层裂解酶(CwlJ)的二、三级结构与酶的活性之间的关系.实验所采用的pH值为3、5、7、9、11,结果表明:1)pH 3、5时,随着时间的推移,芽孢皮层裂解酶(CwlJ)被激活,活性很高;2)酶的活性与其二级结构域中的α-螺旋相对含量紧密相关;当pH值从3增加到5时,α-螺旋相对含量不断的增大,由36.15％增加到37.29％,当pH值从5增加到7时,α-螺旋相对含量基本不变,当pH值从7增加到11时,α-螺旋相对含量不断的减小,即在pH 3～5之间酶可能被激活;3)随着pH处理条件的改变,pH 5的荧光强度最强,内部蛋白质完全展开,空间结构更加松散扩张,三级结构更加稳定.综上所述,在酸性pH值条件下,皮层裂解酶(CwlJ)的结构稳定,活性高,故推测酸对芽孢萌发的抑制作用不是因为其抑制了皮层裂解酶的活性.

摘要： 研究蛋白质结构是了解蛋白行使其生物功能的基础.蛋白质的结构是其功能的决定性因素,而结构的多样性则决定了功能的多样性.本文归纳了蛋白质二级结构与三级结构的经典光谱表征方法,主要包括圆二色光谱(CD)、拉曼光谱(RS)、傅里叶变换红外光谱(FTIR)、荧光光谱(FS)、核磁共振(NMR)与X-射线衍射(XRD).

摘要： 本文研究了热处理对大豆蛋白热聚集体的结构影响.结果表明:热诱导聚集体的形成降低了大豆蛋白β-折叠结构含量,增加了大豆蛋白二级结构的无序性.60°C和80°C热诱导大豆蛋白热聚集体的形成使大豆蛋白结构更趋于"包埋态",而100°C热诱导大豆蛋白热聚集体的形成使大豆蛋白更趋于"暴露态".

摘要： 引起牛肉过敏的主要过敏原是存在于血浆中的牛血清白蛋白，研究超高压协同温度处理对过敏原Bos d6抗原性和二级结构的影响.采用间接竞争ELISA、Ellman方法测自由巯基和ANS测定表面疏水,研究在温度25、40和55°C条件下,100～600MPa压力分别处理10min对过敏原Bos d6抗原性及三级结构的影响.超高压处理能有效降低过敏原Bos d6的抗原性及总巯基含量及其疏水性;但随着处理温度和压强的增加,蛋白表面巯基含量降低,二硫键断裂,同时疏水性降低,疏水基团包埋于分子内部.

摘要： 在蛋白质三级结构预测领域，基于蛋白质采样信息的结构预测方法是一种应用比较成功的方法，但是随着蛋白质数据库的增大，对计算能力的需求也越来越高，限制了这种方法的使用.随着FPGA芯片资源和计算能力的不断提高，基于FPGA芯片的硬件加速器已经成为加速蛋白质三级结构预测算法的理想平台.本文在分析蛋白质三级结构预测程序BackboneDBN的计算特征的基础上，设计并实现了一个基于FPGA平台的算法加速器，通过采用多PE并行，流水线并行和矩阵分割存储等优化策略提高算法加速器的性能.实验结果表明，与运行在Intel E7400双核处理器上的BackboneDBN程序相比本文所设计的算法加速器可以获得20倍左右的加速效果.

摘要： 嘧啶核苷磷酸化酶(Pyrimidine nucleoside phosphorylase PYNP)在核苷合成的补救途径中有催化可逆的嘧啶核苷磷酸解作用.在比较低等的生物中(例如:枯草杆菌),PYNP可催化胸腺嘧啶核苷和尿嘧啶核苷的磷酸解反应,然而在哺乳动物和其他的比较高等的生物中它只对胸腺嘧啶核苷的磷酸解起催化作用(胸腺嘧啶核苷磷酸化酶,TP).我们在Silicom Graphics工作站上利用Insight Ⅱ的Homology模块构建了枯草杆菌PYNP的三级结构模型.通过同源序列对比和使用InsightⅡ的Binding Site模块,确定了枯草杆菌PYNP的可能的活性中心和相关氨基酸.

摘要： 偶氮染料是分子中具有一个或多个偶氮基的芳香类化合物，被广泛应用于印染、纺织、食品和制药等行业中。国内外学者分离考察了可脱色偶氮染料的微生物，针对存在的一些不足，本文深入分析了细菌偶氮还原酶的三级结构模型，拓展了偶氮还原酶的底物谱、发现了偶氮还原酶的生理功能；利用基因芯片技术，对细菌还原偶氮染料过程的全转录组响应进行分析，深化了对细菌细胞还原偶氮染料的分子响应和机理的认识。

摘要： 针对当前低温超导电子、军事及空间探测等对液氦温区紧凑、长寿命、高可靠性制冷技术的需求,设计并研制了一台三级斯特林型脉管制冷机。讨论了制冷机第三级的回热器、脉管、调相机构等相关参数的设计,着重分析了液氦温区回热器长度与温度分布的特殊关系。实验中以He-4 为工质,在充压0.91 MPa,频率29.9 Hz,第三级输入电功率100 W的工况下获得了4.97 K的最低无负荷温度, 有制冷量25 mW@6 K。该结果首次证明了采用He-4 工质以三级结构的斯特林型脉管制冷机实现液氦温区制冷的可行性。

摘要： 报道了在不同pH的碱性溶液中,甲醇分子的体积分数对诱导肌血球素构象变化的影响。pH和甲醇的比例分数同时诱导肌血球素的构象变化,并分别决定了Mb的二级结构和三级结构的变性与否。

摘要： 原子力显微镜(AFM)具有分辨率高、样品制备简单以及可在保持样品生物活性条件下成像等优点。本文用原子力显微术研究了牛血清白蛋白(BSA)在六亚甲基四胺-盐酸缓冲溶液中的形态变化。牛血清白蛋白的AFM图像表明;BSA在去离子水中呈相互分散的椭圆形貌,在0.05 mol/L的六亚甲基四胺-盐酸缓冲溶液中BSA发生展开并相互粘连,其三级结构发生了明显改变。

摘要： 针对微系统CAD研究中存在的关键问题提出了基于三级结构的分布式CAD新方案.采用该方案所设计的CAD系统可实现在系统级对微系统进行辅助设计和模拟仿真,具有良好的开放性、扩充能力和可伸缩性.

摘要： 在嵌入式系统的设计与应用中,板级支持软件包BSP的形式与作用随不同的软硬件环境产生较大的差异,是嵌入式技术应用中软硬件结合层面的一个关键环节.本文从几个的方面对BSP的作用及其关联环节进行分析,为嵌入式技术的应用提供帮助.

摘要： 在嵌入式系统的设计与应用中,板级支持软件包BSP的形式与作用随不同的软硬件环境产生较大的差异,是嵌入式技术应用中软硬件结合层面的一个关键环节.本文从几个的方面对BSP的作用及其关联环节进行分析,为嵌入式技术的应用提供帮助.

摘要： 本发明提供一种场外衍生品合约要素三级存储管理方法及装置，本方法定义了一种新的场外衍生品合约要素的存储结构，即通过对场外衍生品各种类型合约的合约要素，根据其是否为共性要素以及该要素是否参与逻辑控制进行重新划分，归类，使用合约模型工厂，将完成归类的合约要素重新整合，形成与之相应的三级存储结构，最后以形成的三级存储结构为依据，将场外衍生品合约要素进行数据存储持久化，降低存储成本的同时提高研发效率。

摘要： 本发明提供了一种靶向生物毒素的环状核酸适配体三级结构的预测方法，在获取靶向生物毒素的核酸适配体的核苷酸序列之后，通过构建靶向生物毒素的环状核酸适配体三级结构模型，即可用于预测靶向生物毒素的环状核酸适配体三级结构。采用上述技术方案后，可通过环状核酸适配体的序列预测其三级结构。本申请模拟得到的环状核酸适配体的三级结构具有优异的准确性和稳定性，且能够调整预测的精确程度，按照使用者的需求来预测环状拓扑结构。

摘要： 本发明涉及微纳米材料制备技术，旨在提供一种具有三级结构的聚四氟乙烯微纳米纤维膜的制备方法。包括：取直链淀粉质量占比不小于50％的纯直链淀粉，或直链淀粉与支链淀粉的混合物，配置成淀粉溶液后与PTFE乳液混合搅拌、静置脱泡，作为纺丝液；以离心纺丝方法制备淀纤维，收集纤维形成纤维膜；在氮气气氛和385°C温度条件下煅烧，得到具有三级结构的聚四氟乙烯微纳米纤维膜。本发明所得纤维膜的多级结构特征与荷叶表面的多级“乳突”结构类似，因而能够更大程度地提高纤维膜的疏水性能。PTFE纤维直径处于亚微纳米范围内，制备方法简单易行。选用的淀粉原料不仅属于可再生资源，而且价格低廉，具有可观的工业应用前景。

摘要： 本发明提供了一种蛋白质三级结构的预测方法及系统，包括：网络结构搭建步骤；两个头输出设置步骤；距离概率分布获取步骤；角度概率分布获取步骤；损失函数l构造步骤；参数集获取步骤；拟合步骤；神经网络的学习步骤；预测结果计算步骤。共同预测的双头共享神经网络架构不仅仅能够解决距离和角度预测的不一致性，提升角度和距离预测的精确度，同时也大幅度减少计算的时间，加速预测速度。

摘要： 本发明属于核苷酸三级结构预测技术领域，具体为一种靶向生物毒素的G‑四联体式核酸适配体三级结构预测方法。本发明方法包括：G‑四联体二级结构预测；G‑四联体三级拓扑构型预测；核酸适配体末端补全和结构优化；温度依赖型分子动力学模拟（包括两个过程：恒温分子动力学模拟和升温分子动力学模拟）；采用RMSD分析方法获得最稳定核酸三级结构模型。本发明方法已用于预测靶向膝沟藻毒素的特异性核酸适配体序列GO18‑T‑d的三级结构，该序列为已知的通过指数富集配基进化技术筛选得到G‑四联体式适配体序列，通过圆二色谱实验检测到其G‑四联体构型为平行式G‑四联体构型，预测结果与圆二色谱实验检测结果完全吻合，证明本预测方法具有良好的准确性。

摘要： 本发明公开一种换流器、直流侧接地三级结构柔性直流系统及控制方法，换流器的直流电极包括正极、负极和第3极，其中每个直流电极均包括平波电抗器和具有直流电压和直流电流双向运行能力的模块化电平变换器，模块化电平变换器包括交流侧和直流侧，交流侧用于接换流变压器的三相电源，直流侧包括第一端子和第二端子，第一端子经过平波电抗器后作为直流电极接入直流线路，第二端子接地。具有该换流器的柔性直流系统有正常双极运行模式，单级运行模式，两单极并联运行模式和增容运行模式。通过对故障极电压的控制和运行模式的灵活转换，实现直流侧故障瞬态能量的快速转移，有效抑制直流故障电流，同时确保故障期间功率传输的稳定性和连续性。

摘要： 本发明涉及一种高耐压三级结构的琼脂糖微球及其制备方法，属于琼脂糖微球技术领域。本发明所述的三级结构的琼脂糖微球的制备方法，包括以下步骤，首先向改性的琼脂糖中加入致孔剂后先加热至90‑100°C、再降温至65‑75°C，得到水相；然后在保护气氛下，向所述的水相中加入油相材料、乳化剂、引发剂1000‑1400rpm搅拌反应20‑28h，后进行降温100‑120rpm搅拌3‑7min，得到改性琼脂糖微球；最后在碱性条件下，向所述的改性琼脂糖微球的溶液中加入交联剂，45‑65°C反应22‑32h，得到所述三级结构的琼脂糖微球。本发明所述的三级结构的琼脂糖微球有利于目标分子快速渗透琼脂糖微球，比以往琼脂糖微球具有更快的渗透速率。

摘要： 本发明公开了一种基于并行和蒙特卡罗策略的RNA三级结构预测方法，该方法属于结构预测领域。该方法包括利用并行机制进行构象空间采样；根据最新更新的能量函数进行打分；通过两轮势能评判对构象基于“Stepwise ansatz”的蒙特卡洛操作进行合理性判断；最后经过结构完整性和建模精度的判断，对结果进行处理，直到获得稳定的高精度高完整性的RNA三级结构。本发明所提RNA三级结构预测方法能够获得高精度高完整性的RNA三级结构。基于并行和蒙特卡罗策略的RNA三级结构预测方法灵活性高，蒙特卡罗次数可指定，建模精度和建模时间成本可以由用户来衡量；该方法克服了现有技术方法对RNA模体建模不完整的问题；本发明增加了构象采样的广度和深度，减小了伪最低自由能的影响，提高建模精度。

摘要： 本发明提供了一种靶向生物毒素的环状核酸适配体三级结构的预测方法，在获取靶向生物毒素的核酸适配体的核苷酸序列之后，通过构建靶向生物毒素的环状核酸适配体三级结构模型，即可用于预测靶向生物毒素的环状核酸适配体三级结构。采用上述技术方案后，可通过环状核酸适配体的序列预测其三级结构。本申请模拟得到的环状核酸适配体的三级结构具有优异的准确性和稳定性，且能够调整预测的精确程度，按照使用者的需求来预测环状拓扑结构。

摘要： 本发明涉及微纳米材料制备技术，旨在提供一种具有三级结构的聚四氟乙烯微纳米纤维膜的制备方法。包括：取直链淀粉质量占比不小于50％的纯直链淀粉，或直链淀粉与支链淀粉的混合物，配置成淀粉溶液后与PTFE乳液混合搅拌、静置脱泡，作为纺丝液；以离心纺丝方法制备淀纤维，收集纤维形成纤维膜；在氮气气氛和385°C温度条件下煅烧，得到具有三级结构的聚四氟乙烯微纳米纤维膜。本发明所得纤维膜的多级结构特征与荷叶表面的多级“乳突”结构类似，因而能够更大程度地提高纤维膜的疏水性能。PTFE纤维直径处于亚微纳米范围内，制备方法简单易行。选用的淀粉原料不仅属于可再生资源，而且价格低廉，具有可观的工业应用前景。