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分子进化

分子进化的相关文献在1980年到2022年内共计612篇,主要集中在分子生物学、畜牧、动物医学、狩猎、蚕、蜂、动物学 等领域,其中期刊论文541篇、会议论文60篇、专利文献104345篇;相关期刊289种,包括昆虫学报、四川动物、水生生物学报等; 相关会议51种,包括第八届中国优质禽育种与生产研究会学术讨论会暨代表大会、中国遗传学会第九次全国会员代表大会暨学术研讨会、河南省畜牧兽医学会第八届会员代表大会暨2013年学术研讨会等;分子进化的相关文献由1740位作者贡献,包括吕宝忠、张传溪、曹广力等。

分子进化—发文量

期刊论文>

论文:541 占比:0.52%

会议论文>

论文:60 占比:0.06%

专利文献>

论文:104345 占比:99.43%

总计:104946篇

分子进化—发文趋势图

分子进化

-研究学者

  • 吕宝忠
  • 张传溪
  • 曹广力
  • 罗辽复
  • 郎大田
  • 黄京飞
  • 薛仁宇
  • 贡成良
  • 何舜平
  • 刘次全
  • 期刊论文
  • 会议论文
  • 专利文献

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排序:

年份

    • 毛积鹏; 黄林旺; 郝静; 刘天颐; 黄少伟
    • 摘要: 为了解DXS基因的系统发育、密码子偏好性和分子进化等特性,选取44个代表性物种的DXS基因序列进行分析。结果表明:DXS基因家族具有较高的保守性,序列间的平均遗传距离为0.243;DXS基因的分化时间先于对应的物种分化,DXS基因树和对应物种树的拓扑结构基本一致;所选的裸子植物和单子叶植物及同科的双子叶植物均分别聚类在一块;DXS基因的密码子偏好性较低,平均有效密码子数、GC3和G+C含量分别为47.25、0.49和0.51;DXS基因在进化过程中主要受纯化选择作用,野大豆DXS基因受到的选择压最大为0.981,黍属DXS基因受到的选择压最小为0.001,平均选择压大小为0.094;在各模型中均未检测到后验概率大于0.95的受正向选择作用位点;DXS基因的有效密码子数、GC3和G+C含量与选择压的大小均无显著的相关性。研究为进一步了解DXS基因的功能及其在MEP途径中的调控机制提供一定的理论基础。
    • 杜军华; 姜东伯; 张津京; 余建平; 宋长新; 刘甜; 陈辉; 陈群; 吴晓明
    • 摘要: 为了更好地区分不同羊肚菌菌株,确定其生物多样性,对10个栽培羊肚菌和12个野生羊肚菌进行分析。通过对5个基因区域进行DNA测序,借助数据库检索、多序列比对和分子进化等方法进行分析,发现10种栽培样本属于3种已知物种:六妹羊肚菌(Morchella sextelata)、梯棱羊肚菌(M.importuna)、七妹羊肚菌(M.septimelata)。同GenBank核苷酸序列数据库中已测序样本相比,这些样本都含有一定程度的序列差异,体现在栽培的样本也具有遗传多样性。12个野生型样本同六妹羊肚菌、小海绵羊肚菌(M.spongiola)、Morchella prava物种更接近,并显示出较大的序列差异,其中1株同所有已知羊肚菌品种均有较大的遗传差异。考虑到这些野生羊肚菌的生长地域同其他羊肚菌生长地域的差异,推断由于独特的地理环境,使野生羊肚菌演化出了特有的基因序列。本研究获得了青海一些地区羊肚菌的分类、分子演化和多样性特征,有助于鉴定、选育适合栽培的羊肚菌菌株。
    • 龚玉娟; 滕凯; 肖志鹏; 蔡海林; 周向平; 肖艳松; 刘天波; 唐前君
    • 摘要: 为探明湖南烟草上发生的黄瓜花叶病毒Cucumber mosaic virus(CMV)的遗传多样性及分子进化特征,对来自湖南烟区的303份疑似感染病毒的烟草样品进行检测,分析CMV系统发育、遗传变异和群体结构等特征。结果表明:部分分离物的外壳蛋白(coat protein,CP)基因与NCBI上登录的CMV分离物的一致性为86.34%~98.42%;系统发育分析发现湖南烟草CMV分离物属ⅠB组,不同组间的分离物地理特征不明显,无重组现象,进化的主要驱动力是负选择;组间遗传变异比较明显,基因交流频率较低,受到遗传漂变影响,遗传多样性高,群体趋于扩张。研究结果为烟草抗CMV育种提供了理论依据,对病害防治具有重要意义。
    • 杨慧娟; 董文鸽
    • 摘要: 恙螨引起的恙虫病是世界上危害严重的一类人兽共患寄生虫病。本文综述现有纤恙螨属线粒体基因组信息,发现以下几个特点:纤恙螨属线粒体基因组与节肢动物以及前气门目其他物种的线粒体基因组排列发生了较大变化;红纤恙螨和地里纤恙螨有2个非编码区,苍白纤恙螨有4个非编码区;AT-偏斜为正值,但cox1第3位密码子的AT-偏斜和GC-偏斜与后生动物典型的链偏向相反;tRNA和rRNA基因的平均大小比部分寄螨总目物种要短,导致大部分tRNA基因具有非典型的二级结构。对纤恙螨属线粒体基因组的结构特征和变异情况进行比较,弥补了蜱螨亚纲线粒体基因组传统认识的不足和局限。
    • 付春; 甘东平; 杨瑶君
    • 摘要: 超长链脂肪酸延伸酶(Elongation of very long chain fatty acids protein;ELO)是决定长足大竹象(Cyrtotrachelus buqueti)脂肪酸生物合成的关键酶。利用生物信息学方法对长足大竹象ELO基因家族的基因结构特征及其编码蛋白序列进行详细的分析以期探究长足大竹象ELO基因家族调控其脂肪酸生物合成的分子机制。结果表明,从长足大竹象基因组序列中共鉴定出15个ELO基因家族成员,分别位于四条染色体上。其等电点9.22~9.68、呈碱性。该家族蛋白具有稳定性、疏水性、具有跨膜现象、且有多个磷酸化位点、二级结构以α-螺旋为主。Cbu ELO蛋白家族共鉴定出10个保守基序。通过构建Cbu ELO蛋白家族进化树分析,长足大竹象与赤拟谷盗的ELO蛋白家族亲缘关系最近。该研究结果为深入探索长足大竹象ELO基因的功能提供了参考依据。
    • 刘静; 边迅
    • 摘要: 直翅目是不完全变态昆虫中数量最多的一个类群,全世界已知28000种以上.随着分子生物学技术的发展,线粒体基因组因进化速率快、普遍为母系遗传、极少发生重组等特点而被广泛应用于直翅目各个阶元的系统发育和进化研究中.目前,已有223条直翅目线粒体基因组序列被测定并上传至NCBI数据库,其中包括143条蝗亚目线粒体基因组序列和80条螽亚目序列.直翅目昆虫的线粒体基因组大小为16 kb左右,包括37个编码基因和一段控制区,是共价闭合的双链DNA结构,碱基组成有明显的AT偏向性.结合线粒体基因组数据探讨系统发育,有利于解决直翅目系统发生关系和进化方面的问题,但同时也存在研究类群不全面、数据信息发掘不到位等方面的不足.
    • 邓斐; 祁贤; 余慧燕; 王慎骄; 黄昊頔; 许可; 鲍倡俊
    • 摘要: [背景]自2014年以来,H5N6禽流感病毒在我国家禽和活禽市场持续进化,成为人类和动物健康的重大威胁.[目的]对2017-2019年中国南方地区93株高致病性H5N6禽流感病毒的HA基因进行分子进化分析.[方法]接种9-11日龄鸡胚分离核酸检测阳性的H5N6标本,运用下一代测序平台对病毒分离物进行全基因组测序,从NCBI和GISAID数据库下载参考序列,利用BLAST、MEGA 6.1及ClustalX等软件进行序列分析.[结果]2017-2019年,从189份江苏省H5亚型禽类/环境标本和1名H5N6患者咽拭子标本中共分离到43株病毒,完成了33株H5N6病毒的全基因组测序.下载网上同时期中国其他地区流行的H5N6毒株序列,对总计93株H5N6病毒的HA基因进行分子进化分析.93株H5N6病毒中有78株属于Clade2.3.4.4h,9株病毒属于Clade 2.3.4.4e,4株H5N6病毒属于Clade 2.3.4.4b,1 株属于Clade 2.3.4.4f,1 株属于Clade 2.3.4.4g.所有93株病毒HA蛋白的裂解位点含有多个碱性氨基酸,表明它们都属于高致病性禽流感病毒.所有93株病毒HA蛋白的Q222和G224位氨基酸没有发生突变,保留了禽类受体α2-3半乳糖苷唾液酸(SAa2-3Gal)结合特性;158位点丧失糖基化,同时124位出现一个新的潜在糖基化位点.[结论]2017-2019年间中国南方地区H5N6病毒进化活跃,具有明显的基因多样性,需要加强对病毒分子进化的监测.
    • 李泽隆; 朱颖; 张成玉; 郭颖彬; 韩兆雪
    • 摘要: 利用生物信息学方法,从玉米中鉴定到45个DUF581基因家族成员,与其他物种该家族基因的比较和系统发育分析表明,DUF581基因在物种间理化性质较保守;基于系统发育树,该家族基因可分为Ⅰ~Ⅵ6个进化枝,进化枝Ⅱ~Ⅵ内的玉米DUF581基因结构保守,含有1~2个外显子,而进化枝Ⅰ内的家族成员平均含有5个外显子;玉米DUF581基因散布于10条染色体上;基因复制分析表明玉米的14个串联复制基因位于4个串联复制基因簇中,两对片段复制基因Zm00001d002530/Zm00001d017646和Zm00001d017646/Zm00001d051496同时又属于串联复制基因;在正常生长条件下,接近半数(22/45)的玉米DUF581基因在玉米的3种组织(叶、雌穗和雄穗)、4个生长发育时期(V12、V14、V18和R1期)内呈现组成型表达,并且在雌穗和雄穗两个生殖组织内有较高的表达水平;干旱胁迫下,26个DUF581呈现差异表达,V14和V18期的雌穗以及V12和V14期的雄穗中差异表达基因都被下调,而雌穗V12和R1期的大部分差异表达基因都被上调;此外,大部分复制基因对表现出差异的表达模式.
    • 彭颖; 周文蔚; 姚慧; 刘志薇; 张琛; 魏国清
    • 摘要: 桑黄是一种具有极高药用价值的真菌,但其分类及鉴定较为混乱.本研究克隆并测定了桑黄Y1菌株的rDNA ITS序列,对该序列的碱基组成、碱基替换数及序列同源性等进行分析;用Mega7.0软件邻接法(neighbor-joining,NJ)构建了基于桑黄rDNA ITS的系统发育树.结果 表明:桑黄Y1菌株的rDNA ITS序列总长度为709 bp,rDNA ITS1和rDNA ITS2序列具有很多变异位点,存在序列多态性,其中rDNA ITS1序列的碱基替换数比rDNA ITS2的碱基替换数明显增多;系统发育分析表明木层孔菌属真菌可分为3个类群,桑黄属于鲍姆木层孔菌(Phellinus baumii),与裂蹄木层孔菌(Phellinus linteus)亲缘关系较近.研究结果可为桑黄的分类及鉴定提供一定的依据.
    • 刘赛赛; 刘泽宇; 蒋朴莹; 陆维; 张全启; 程洁
    • 摘要: RNA干扰(RNA interfering,RNAi)是广泛存在于动植物等生物中的一种高度保守、序列特异的RNA降解机制.Argonaute蛋白是RNAi途径的关键组成部分,其结构、功能和进化模式在无脊椎动物中已得到广泛研究,但在脊椎动物特别是硬骨鱼中的报道还十分有限.本研究从已测序物种的基因组中鉴定了12种哺乳动物和15种硬骨鱼的Argo-naute家族基因.通过拷贝数、系统发生和共线性分析,本文验证了在脊椎动物中存在两个保守的Argonaute亚家族,即miRNA/siRNA介导的AGO亚家族和piRNA介导的PIWI亚家族.硬骨鱼类多样的繁殖发育方式是其生殖能力最大化的适应机制.为比较硬骨鱼中piRNA途径和miRNA/siRNA途径的功能和进化差异,本文对硬骨鱼(包括花鲈)和哺乳动物中的piRNA途径基因进行了全面的分子进化分析,并将这些基因与miRNA/siRNA途径中的Ago基因进行比较.结果表明硬骨鱼类的piRNA途径具有快速进化的特征,这可能适应了硬骨鱼基因组转座子数量大、种类多的特点.通过转录组分析,我们进一步证实了piRNA途径基因在四种硬骨鱼中的生殖特异性表达,预示其可能在配子发生过程中发挥作用.本研究为进一步解析硬骨鱼中piRNA途径基因的进化模式及其在鱼类生殖发育中的调控作用提供理论基础.
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