分子流行病学

摘要： 目的 研究近年江苏省人源与猪源戊型肝炎病毒(HEV)流行病学特征和分子进化特征。方法 对2015—2020年江苏省戊型肝炎病例特征进行描述性分析。收集南通如皋县、盐城东台市、淮安清浦区、无锡宜兴市4个监测点报告的戊型肝炎患者标本和当地猪胆汁标本,采用ELISA法进行HEV-IgM抗体检测,采用荧光定量PCR、巢式PCR对HEV RNA进行特异性扩增,阳性标本进行测序,所得基因序列开展进化分析,包括基因型及亚型分析、同源性分析等。结果 2015—2020年,江苏省共报告戊型肝炎病例15 955例,均为散发,年均发病率3.32/10万;报告2例死亡,病死率为1.25/万。下辖13个设区市中,病例数徐州市最多(占15.92%),常州市(占1.95%)最少;发病率南通市(4.96/10万)最高,无锡市(1.08/10万)最低,发病率差异有统计学意义(χ^(2)=75.89,P<0.01)。年均发病率男性(4.76/10万)高于女性(2.36/10万),差异有统计学意义(χ^(2)=7.35,P<0.01)。病例主要集中在40~59岁(占44.72%)和≥60岁(占41.16%)年龄组;职业主要为农民(占61.27%)。1—4月为发病主高峰(占41.25%),8月为次高峰(占8.37%)。共采集387份急性戊型肝炎病例血清样本和5 588份猪胆汁样本,得到109条人源HEV及78条猪源HEV序列,其中人源HEV均为基因4型,包含4种亚型;猪源HEV同样均为基因4型,包含2种亚型;人源与猪源HEV核苷酸序列的同源性范围为81%~100%。结论 江苏省近年基因4型HEV在戊肝患者中占绝对优势,人源与猪源HEV核苷酸序列高度同源,提示HEV有在人与猪之间传播的可能性。

摘要： 本研究旨在通过对成都地区家养猫细小病毒(feline parvovirus,FPV)的分子检测,了解FPV在成都地区的流行及遗传变异情况。2017-2021年分别从四川成都地区采集168份家养猫的腹泻粪便样本,用PCR方法对168份样本进行FPV检测,并选取13份阳性样本进行VP2基因全长的克隆和测序,用MegAlign软件分析FPV核苷酸和氨基酸序列的同源性及变异,通过MEGA 7.0软件用邻近法构建系统进化树分析成都地区FPV的遗传进化情况。结果表明,168份猫样本中检出FPV阳性样本118份,阳性率为70.2%。本研究获得的13株FPV VP2基因与参考毒株之间的同源性为97.1%~100%。VP2蛋白氨基酸分析表明,SMU-D18和SMU-D14毒株序列与new CPV-2a一致,为猫源犬细小毒株。有趣的是,本研究中SMU-D46毒株在第293和297位氨基酸均出现了独特的由Ser(S)到Phe(F)的替换。此外,系统进化分析显示,国内外FPV毒株在进化树中聚类为3个基因群(G1、G2和G3),本研究获得的毒株分别位于G1和G3群中,值得注意的是,商品化的FPV疫苗株位于G2群中,与我国流行的FPV毒株亲缘关系较远。本研究表明,成都市猫群中FPV的流行十分普遍,急需重新评估现有的商品化疫苗的保护效率。

摘要： 目的 探讨盐城市近年手足口病(hand foot and mouth disease, HFMD)和疱疹性咽峡炎病原学特征,以及柯萨奇病毒A组4型(Coxsackievirus A4,CVA4)、10型(CVA10)分离株VP1区序列分子进化规律。方法 收集全市哨点监测医院诊断为HFMD和疱疹性咽峡炎病例标本,采用实时荧光RT-PCR进行肠道病毒核酸检测,选取鉴定为CVA4和CVA10阳性标本开展VP1区序列测序,应用生物信息学软件构建系统进化树,分析核苷酸和氨基酸同源性和氨基酸变异位点。结果 2018—2019年,盐城市累计采集和检测1 289份病例标本,总体病毒核酸阳性检出率59.2%,HFMD和疱疹性咽峡炎阳性检出率分别为59.7%和57.1%,差异无统计学意义(χ^(2)=0.48,P=0.51);CVA6阳性检出率为31.3%,为优势血清型,EV71型、CVA16型、CVA6型、CVA10型、CVA4型样本阳性检出率差异均有统计学意义(P值均<0.05)。共分离12株CVA4型和31株CVA10型毒株,基因型均为F型和C型;分离毒株间核苷酸同源性分别为99.3%~100.0%和96.0%~100.0%,氨基酸同源性分别为91.3%~100.0%和99.3%~100.0%,亲缘关系较近;分别存在2个和4个氨基酸易变异位点。结论 盐城市2018—2019年HFMD和疱疹性咽峡炎病原体主要为CVA6型肠道病毒;CVA4和CVA10分离株流行基因型分别为F型和C型。

摘要： 为了解河南省猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)的流行及变异情况,对2020年采集于河南的401份PRRSV感染疑似病料进行TaqMan荧光定量PCR(FQ-PCR)检测。结果显示,共检测出100份阳性样品,阳性率为24.9%。对其中18株PRRSV流行毒株ORF5基因进行测序、同源性比对和遗传进化分析。同源性比对结果显示,18株PRRSV流行毒株ORF5基因核苷酸序列同源性在83.4%以上,与参考毒株同源性为82.9%~99.7%。遗传进化分析结果显示,18株PRRSV流行毒株序列均为美洲株,分属于1、5、8三个谱系,其中2株属于以JXAl为代表的谱系8,1株属于以VR2332为代表的谱系5,15株属于以NADC30为代表的谱系1。氨基酸比对结果显示,HN-TH1-2020、HY-PY1-2020、HN-XY1-2020毒株的13位以及HN-XC1-2020毒株的151位氨基酸毒力相关位点发生了不同程度的突变。

摘要： 为了解吉林省牛瑟氏泰勒虫病感染情况,本试验根据牛瑟氏泰勒虫18S rRNA基因序列设计引物,应用聚合酶链式反应(PCR)方法对吉林省珲春、通化、安图、舒兰、龙井、辽源、白山共7个县市采集的247份血液样本进行了牛瑟氏泰勒虫病分子流行病学调查,并进行不同地区、不同饲养方式、不同性别及不同年龄之间的比较。结果显示,牛瑟氏泰勒虫总体阳性率为39.68%(98/247),其中通化阳性率最高为70.00%(14/20),龙井阳性率最低为20.00%(8/40),地区之间除安图和白山差异不显著(P>0.05)外,其他各地区之间均差异显著(P0.05);1岁以内牛阳性率为56.67%(34/60),1~3岁牛阳性率为42.22%(38/90),3岁以上牛阳性率为26.80%(26/97),不同年龄间差异显著(P<0.05)。结果表明,吉林省牛瑟氏泰勒虫感染的情况普遍存在。本次调查为吉林省牛瑟氏泰勒虫病的有效防控提供了科学依据。

摘要： 为初步调查河北省部分地区猪伪狂犬病野毒(pseudorabies virus, PRV)流行情况,于2021年3-10月从河北邢台及周边地区采集疑似感染PRV猪病料样品共114份,采用real-time PCR法检测样品中PRV-gE核酸存在情况,并统计阳性率;对部分阳性样品PRV-gE基因序列进行扩增、测序与分析,初步分析该地区流行PRV野毒基因型及遗传变异情况。结果发现,共16份样品检测为PRV-gE核酸阳性,平均阳性率为14.04%(16/114),且不同地区和季节阳性率存在较大差异。3份样品PRV-gE序列全长成功扩增,其核苷酸和对应氨基酸序列与国内2012年后流行PRV变异株同源性较高,且进一步遗传进化分析结果发现以上3个毒株序列与国内流行变异株亲缘关系最近,提示研究获得的PRV毒株均属于变异株。

摘要： 目的建立检测新疆喀什地区羊肝组织中细粒棘球绦虫的分子生物学方法,提高包虫病的早期诊断水平。方法对羊肝组织内获取棘球蚴囊,将囊内容物离心沉淀提取DNA,以细粒棘球绦虫线粒体cytochrome b基因为靶基因设计引物进行PCR扩增,引物设计考虑简并碱基。结果建立的简并引物q-PCR法特异性好,与常见的宿主动物(羊、驴和犬)基因组无交叉扩增现象,与肝内的常见寄生虫(肝片吸虫和莫尼茨绦虫)基因组无交叉扩增。梯度稀释的基因组DNA:10 ng、1 ng、100 pg、10 pg进行qPCR实验均能得到标准的S型曲线。PCR体系R^(2)=0.984,效率:92.6%,符合qPCR的相关要求。结论线粒体基因组的cytochrome b基因分析是棘球蚴病诊断和分型的有力工具。喀什地区首次应用简并引物q-PCR法检测细粒棘球绦虫,灵敏度高,特异性好,为下一步对该地区进行包虫病分子流行病调查提供了技术支撑。

摘要： 目的了解西藏昌都地区儿童急性腹泻病毒分子流行病学特征。方法收集2018年11月至2020年11月于西藏昌都市人民医院就诊的96例急性腹泻患儿的粪便标本,检测腺病毒、诺如病毒、星状病毒、札如病毒、轮状病毒,并测序分析其基因型别。结果腺病毒、诺如病毒、星状病毒、札如病毒、轮状病毒5种病毒总阳性率为39%(37/96),其中星状病毒阳性率最高(16例,17%),诺如病毒次之(9例,9%),轮状病毒、腺病毒、札如病毒阳性率分别为8%(8例)、7%(7例)、5%(5例)。这5种病毒在不同年龄组的阳性率差异均无统计学意义(P>0.05)。不同季节间仅星状病毒阳性率差异有统计学意义(P<0.05)。腺病毒中F41型6例,C2型1例;诺如病毒GⅠ.36例,GⅠ.71例,GⅡ.31例,GⅡ.4 Sydney_2012型2例;星状病毒均为HAstrV-1型;札如病毒散发GⅠ.21例,GⅠ.61例,GⅡ.11例,2例未知分型;轮状病毒G9[P8]6例。结论星状病毒和诺如病毒是西藏昌都地区急性腹泻儿童的重要病原体。腺病毒、诺如病毒、星状病毒、札如病毒、轮状病毒阳性率均与年龄无关,仅星状病毒阳性率有明显季节性;腺病毒的基因型别以F41型为优势株,诺如病毒优势株为GⅠ.3,星状病毒优势株为HAstrV-1,札如病毒散发GⅠ.2、GⅠ.6、GⅡ.1,轮状病毒优势株为G9[P8]。

摘要： 为了解四川南充地区养殖场牛病毒性腹泻病的感染情况,通过随机采集来自8个县(市、区)的不同规模养殖场、不同用途、不同饲养方式等牛的血清共计1,000份,进行牛病毒性腹泻抗体水平检测。结果显示,牛血清抗体平均阳性率为18.53%,证实南充地区调查牛场牛群普遍存在牛病毒性腹泻病感染。由此初步了解了本地区牛病毒性腹泻病感染和流行病学特点,为该病防控提供理论依据,逐步实现该疫病净化的目的。

摘要： 目的分析重症监护病房(ICU)临床来源耐碳青霉烯肺炎克雷伯菌(CRKP)的分子特征及流行情况,为感染控制及药物治疗提供实验室数据。方法收集2018年7月—2020年7月某院ICU分离的51株CRKP,采用微量肉汤稀释法测定最低抑菌浓度,多位点序列分型和脉冲场凝胶电泳分析菌株同源性,检测菌株耐药和毒力基因,接合试验验证质粒的转移性。结果药敏试验显示,CRKP对头孢他啶/阿维巴坦全部敏感,对替加环素耐药率最低(3.9%),其次是阿米卡星(49.0%)、多粘菌素(64.7%),对亚胺培南(96.1%)、美罗培南(98.0%)、左氧氟沙星(98.0%)和头孢他啶(100.0%)均高度耐药。51株CRKP中,mCIM试验阳性菌株49株(96.1%),eCIM试验阳性菌株1株(2.0%)。碳青霉烯酶基因blaKPC-2阳性菌株占96.1%。所有分离株中,高黏液表型阳性4株(7.8%),毒力基因阳性情况分别为:uge 100.0%,mrkD 94.1%,kpn 94.1%,fim-H 72.5%,aero 2.0%,rmpA 2.0%。ST11 CRKP在ICU中占98.0%(50/51),ST1373占2.0%(1/50)。检出1株ST1373的高毒力肺炎克雷伯菌。携带blaKPC-2基因菌株的接合试验成功率为12.2%。结论ICU存在产KPC-2的ST11 CRKP单克隆传播,同时携带一定的毒力基因。携带blaKPC-2基因的质粒可通过接合水平传播。头孢他啶/阿维巴坦对CRKP有较高的敏感性,可供临床治疗选择使用。

摘要： 目的：了解广东口岸结核分枝杆菌复合群(MTBC)主要流行菌株及输入性菌株的分子流行病学特征. 方法：采用熔解曲线间隔区寡核苷酸分型(melting curve spoligotyping,McSpoligotyping)技术对广东口岸558株MTBC菌株进行基因分型,将分型结果与SITVITWEB数据库进行比对,获取间隔区寡核苷酸国际型别(spoligotype international type,SIT)编号,并用BioNumerics7.6进行聚类分析. 结果：558株MTBC菌株共分为107种基因型,其中66种归属于8种基因家族及4种家系.家系2和家系4共占菌株总数的86.38％(482/558).6个主要流行簇分别为SIT1、SIT53、SIT52、SIT50、SIT190和SIT19,其中SIT1为最大流行簇.17株输入性MTBC包含北京家族、拉丁美洲和地中海(Latin American and Mediterranean,LAM)、East African Indian(EAI)、T、Africanum(AFRI)及未定义的基因家族,其中包含23.53％(4/17)的新基因型.北京家族菌株耐药率为27.25％(106/389),非北京家族菌株耐药率为23.81％(40/168),差异无统计学意义(x2=0.72,P=0.40).典型北京家族菌株耐药率为26.03％(95/365),非典型北京家族菌株耐药率为45.83％(11/24),差异有统计学意义(x2=4.46,P=0.03). 结论：广东口岸以家系2和家系4MTBC为主要流行菌株,输入性菌株以来源地区流行的基因家族和新基因型为主,应加强对主要流行菌株及输入性菌株的分子流行病学监测.非典型北京家族菌株与耐药性具有相关性.

摘要： 梅毒的分子流行病学:多采用arp,tpr/中0548三基因分型法。除个别报告外，中国大陆地区流行的梅毒螺旋体株均以14d或14d/f为主，动态观察上海地区2007-2011流行的梅毒螺旋体株也以14d/f为主。英国伦敦的研究14d/g为主要的类。台湾地区则最常见的为14f/f，而9f/f,l0b/a是新的基因型别，提示在台湾地区流行的梅毒螺旋体可能不同于其他国家和中国其他地区的型别。目前尚未发现梅毒螺旋体对青霉素产生明确耐药，但已发现在使用推荐剂量的青霉素治疗后，病人的体液、CSF、内耳、脾脏等处仍可发现病原体持续存在。

摘要： 2016年美国报道了一种可引起猪皮炎肾病综合征、母猪繁殖障碍、呼吸道及高热等多系统炎症的新型病毒猪圆环病毒3型(porcine circovirus type3,PCV3).为更多了解中国PCV3的感染情况,本研究针对PCV3保守区设计一对特异性引物,对10个省106份样品进行PCR检测,并把PCR产物进行测序分析.结果表明:10个省中6个省为阳性,阳性率60％;66个场中感染PCV3的场为12个,阳性率为18.2％;106个样品中检测PCV3阳性的样品为19例,阳性率为18.0％.此研究也将为更多了解PCV3在中国感染情况提供数据基础.

摘要： 为了解犬呼吸道冠状病毒(Canine respiratory coronavirus,CRCoV)的致病特点和在北京地区的流行病学状况,本研究自2015年12月至2017年3月,采用RT-PCR方法,对采集的487份犬咽鼻拭子进行了CRCoV检测,同时,对部分样本进行了犬副流感病毒(Canine parainfluenza virus,CPIV)_犬腺病毒Ⅱ型(Canine adenovirus type2,CAV-2)、犬瘟热病毒(Canine distemper virus,CDV)等病毒的混合感染情况调查,结果显示:CRCoV的致病力较弱，单一感染犬常表现为无明显或轻度呼吸道症状，与其他呼吸道病毒混合感染时多出现轻度或中至重度呼吸道症状。该病毒在冬春季节更易流行;其感染率和年龄无显著关系。

摘要： 来源于临床的研究是最有价值的研究。以结核感染及发病为例，探讨MTB与宿主的相互作用。开展基于临床数据的病原体层面的研究：高床结核病分子流行病学研究，3种MTB检测方法的诊断效能评价，建立中国西部地区MTB分型与临床菌株生物库。

摘要： 由肺炎克雷伯菌亲缘关系分析可知，本次研究中分离出的肺炎克雷伯菌均与ST11型有较近的亲缘关系.ST11型首次被发现是在沿海城市，结合本研究所在地的地理位置，可推断本研究中肺炎克雷伯菌由沿海地区的ST11型演变而来。

摘要： 目的：了解2016年山东省沿海地区副溶血弧菌腹泻病例分离株的病原学和分子流行病学特征. 方法：对51株分离株进行血清分型以及耐热直接溶血毒素基因(TDH)、耐热相关溶血毒素基因(TLH)、不耐热溶血毒素基因(TRH)的PCR检测,并进行脉冲场凝胶电泳(PFGE)分型,用BioNumerics分析软件对图谱进行聚类分析,以此追溯菌株间的同源性. 结果：671份粪便标本分离出副溶血性弧菌51株,阳性分离率为7.6％.51株副溶血性弧菌分为4种不同的血清型,其中03∶K6型为优势血清型,所占比例为90.2％.全部菌株TLH基因阳性;TDH基因存在于大部分菌株中,所占比例为98.04％;只有1株菌TRH基因阳性.51株副溶血弧菌分成37种PFGE型别,在90％的相似性水平,共有17种不同的群,带型分散,无明显聚集性. 结论：山东沿海地区地区腹泻病例副溶血弧菌分离株以O3∶K6型为主.毒力基因tlh和tdh携带率高.PFGE结果提示果提示山东沿海地区副溶血弧菌存在遗传多样性.

摘要： 目的：分析和探讨聚集性新布尼亚病毒感染病例的传播途径.方法：方法对一起由新型布尼亚病毒引起的发热伴血小板减少综合征聚集病例、密切接触者及周围人群进行流行病学调查,并对分离到的新布尼亚病毒(SFTSV)进行序列比对分析,探索该新发传染病的流行病学特征.结果：经流行病学调查发现患者之间有相关性,均接触首发病例血液;3株分离到的SFTSV经序列相似性比较,发现其亲缘关系较近;其他6名密切接触者IgM抗体均阳性;周围人群9名IgM抗体阳性.结论：此次聚集性疫情疑为血液传播,患者居住地外环境中可能存在SFTSV的自然存储宿主.

摘要： 中国兽医药品监察所国家猪瘟参考实验室是由农业部2002年发布的第一批国家参考实验室,是国内最早开展猪瘟研究的权威实验室之一.2017年6月1日,世界动物卫生组织(OIE)确认中国兽医药品监察所标准物质研究室成为中国的OIE猪瘟参考实验室.按照国家重大动物疫病防控的需求以及OIE参考实验室职能的要求,该实验室近年来承担了22项国家和省部级的研究课题,研究经费达2000万,开展了中国猪瘟的分子流行病学研究、猪瘟流行病学监测和信息系统数据库建设、猪瘟新型诊断试剂的研发、猪瘟标准品和参照品的制备和标定、猪瘟新型疫苗的研发、相关基础研究和猪瘟综合防控和净化技术研究.

摘要： 目的：在规范化的结核分枝杆菌数目可变串联重复序列多态性(15-VNTR)基因分型的基础上,构建涵盖我国31个省的VNTR数据库,每个省份优化出一套(VNTR)位点组合,为我国结核病预防控制提供科学依据. 方法：对2007-2008年全国结核病耐药性基线调查的结核分枝杆菌4116株行第15位点VNTR(15-VNTR)基因分型.采用分辨率指数(Hunter-Gaston Index,HGI)分析每个位点的分辨率.据此,依据谱系流行特征,以分辨率高和稳定性强为原则,为31个省设计一套12-VNTR、10-VNTR、8-VNTR、5-VNTR组合并加以评价. 结果：完成了3966株结核分枝杆菌完整的15-VNTR图谱,涵盖率为96.36％(3966/4116).通过各个位点HGI的中值比较发现,Qub-11b、MIRU26、Mtub21、Mtub04、QuB26、MIRU31、MIRU10属于高分辨率位点;Qub26、MIRU16、Mtub21、Qub-11b在部分地区呈现较差遗传稳定性.内蒙古,重庆,黑龙江地区的最优组合为10-VNTR,其他地区用8-VNTR作为最优组合. 结论：该数据库的建立,推动了结核分枝杆菌传染源全国范围的追踪和簇调查;一系列优化VNTR组合的推出助推各省通过分析成簇率实现当地疫情的监测和进行群体遗传学的研究.

摘要： 公开了一种检测SARS病毒的流行病阶段的方法，该方法包括步骤：检测SARS病毒的核酸序列，与SEQ ID NO：1的序列对比，其中不同的核苷酸突变可表示SARS病毒所处的不同流行阶段(果子狸、早早期、早期、中期I型、中期II型和晚期型)。本发明还公开了具有SEQ ID NO：1的序列并具有上述突变的SARS病毒核酸序列以及用于该方法的试剂盒。

摘要： 公开了一种检测SARS病毒的流行病阶段的方法，该方法包括步骤：检测SARS病毒的核酸序列，与SEQ ID NO：1的序列对比，其中不同的核苷酸突变可表示SARS病毒所处的不同流行阶段(果子狸、早早期、早期、中期I型、中期II型和晚期型)。本发明还公开了具有SEQ ID NO：1的序列并具有上述突变的SARS病毒核酸序列以及用于该方法的试剂盒。

摘要： 本发明提出一种基于病例登记和搜索引擎的罕见病流行病学数据库构建方法和系统，包括：获取多种罕见病及其对应的查询关键词，根据查询关键词分析搜索引擎的查询信息，得到罕见病搜索的查询日志，并根据查询日志统计提取各罕见病在搜索引擎中的搜索特征，且搜索特征包括各时间点和/或地区对应的搜索患者人数、搜索患者人数排名和搜索增长率排名；统计提取各罕见病在病例登记系统数据中的确诊特征，且确诊特征包括罕见病在各时间点和/或地区对应的确诊患者人数、确诊患者人数排名和确诊增长率排名；比对融合搜索特征、确诊特征和病例登记系统数据，得到罕见病流行病学数据库。通过上述内容，本发明丰富完善了罕见病病例登记系统。

摘要： 本发明公开了一种流行病学调查智能同步方法，涉及突发公共卫生事件流行病学调查技术领域。本方法包括以下步骤：步骤一：构建流行病学调查的软件系统和硬件设备；步骤二：此时流调现场调查人员穿戴好防护装备及音频设备和视频设备，打开设备，此时后台指挥处调试好与音频设备和视频设备的连接。本发明通过音频硬件和对应匹配软件整合并将其配套使用的设计，解决传统流行病学调查方法流程繁琐，耗费时间长，同步协查滞后等不足，通过简化流行病学调查流程、缩短流行病学调查时间、准确抓取重要信息等方式实现现场流行病学调查和后台多部门指挥部同步进行流行病学调查报告的撰写，进而达到提高突发公共卫生事件处置效率的目的。

摘要： 本发明涉及一种检测和监测细菌爆发的方法，包括预测如果其基因组距离低于第一预定阈值，则采集的菌株和来自数据库的菌株属于细菌爆发；如果其基因组距离高于第二预定阈值，所述第二阈值严格高于第一阈值，则采集的菌株和数据库的菌株不属于细菌爆发；如果其基因组距离在第一与第二预定阈值之间，则采集的菌株和数据库菌株可能属于细菌爆发。所述第一阈值大于或等于第三阈值，从而基因组距离低于所述第三阈值的两个菌株属于细菌爆发的预测具有最大特异性。所述第二阈值小于或等于第四阈值，从而基因组距离高于所述第四阈值的两个菌株不属于细菌爆发的预测具有最大灵敏度。

摘要： 本发明涉及流行病学调查技术领域，具体为一种新冠肺炎流行病学调查方法，包括以下步骤：S1，培训专业调查人员：主要以流行病学调查人员为主，范围可适当扩大至单位应急机动队成员；S2，调查目的与调查对象；S3，调查内容；S4，组织与实施；S5，信息上报与分析；通过该新冠肺炎流行病学调查方法能够将调查目的、调查对象和调查内容进行全面概括，并且将疑似病例和确诊病例填报分类调查记录，调查单位能够迅速成立现场调查组，根据制定的调查计划，明确调查目的，确定调查组人员组成和各自的职责与分工，使新冠肺炎流行病学调查更加便捷和前面，提高调查工作效率和质量。

摘要： 本发明公开了一种基于流行病学的疫情数学建模与预测方法，包括：S1：染病者总数I(t)的获得；S2：对R(t)与N(t)进行互相关确定T的值；S3：利用公式确定包含I(t)、N(t)和R(t)的曲线表达式，根据曲线表达式得到新感染者的极值和医院所需的最大收容值以及对应的日期。本发明提出数学模型和直接用几何曲线拟合的方式相比，是基于流行病学原理而建立的。和SIR模型所选择的“群体免疫”措施相比，本发明的模型中不需要易感者S，因为这一参数在“抑制平衡”措施中属于无效变量。因此将SIR模型中三个变量降低为两个变量，不仅模型结构简单，而且还符合R(t)＝N(t‑T)的统计守恒原，所以本模型更适合于表征“抑制平衡”措施下的流行病发展过程。

摘要： 本发明公开了一种流行病学本体数据库建立方法，自定义本体数据库模块，用于储存流行病学本体数据；数据库调用模块，用于将自定义本体数据库模块加载至调查表单中，为特定字段设置相应的本体数据库，实现在调查过程中或数据输入过程中，在对应字段内进行自定义本体数据库模块的实时调用与检索；即时标记模块，通过基于JSON格式的数组查找功能实时获取并匹配与输入内容相符的本体数据，用本体数据对输入的原始数据进行即时标记和匹配；数据储存管理模块，将即时标记模块标注好的本体数据存储在自定义本体数据库模块中，实现本体数据的标准化质控。本发明实现方式简单、高效，便于研究者广泛应用，对提升流行病学研究工作中数据标准化质量具有重要作用。

摘要： 本发明提供了一种地中海贫血分子流行病学调查信息数据分析方法和系统，其中方法包括：获取患者个人信息并建立与所述个人信息对应的样本编号；将所述样本编号与所述患者的生化检测结果进行关联；所述生化检测结果包括血常规和电泳检测结果，以及基因检测结果；根据所述样本编号导入患者的生化检测结果；调取所述生化检测结果中出现异常结果的患者并进行分析和测序。本发明通过对血常规检测结果、电泳检测结果和基因检测结果三个生化检测结果进行整合，从而进行流行病学的调查和研究，可更好的对地中海贫血进行确诊，为地中海贫血的流行病学研究提供了数据基础。

摘要： 本实用新型涉及采集设备技术领域，且公开了一种具备防止异物进入分子流行病学实验标本采集装置，包括采集瓶，所述采集瓶的顶部活动安装有瓶盖，所述采集瓶的内部活动安装有一端贯穿并延伸至瓶盖上方的采集管，采集管的内部固定安装有过滤层，所述瓶盖的内部开设有与采集管相适配的安装孔。该具备防止异物进入分子流行病学实验标本采集装置，通过设置往复弹簧，当采集瓶内的标本采集完成后，采集管抽离，往复弹簧恢复弹性形变从前后推动活动密封板向中间移动，将安装孔密封起来，实现了采集瓶的快速封口，能够有效防止异物进入到采集瓶内，确保标本不受到污染，保证了实验研究的精准性，有利于流行病学的分子机制研究。