蛋白质结构

摘要： 本实验将绿豆蛋白在40、55、70、85、100°C的条件下热处理15、30、45、60、120 min,制备绿豆蛋白-高酰基结冷胶乳液凝胶,分析了凝胶的硬度、持水性、色度、溶解度、蛋白质二级结构及凝胶微观结构,以探究绿豆蛋白热变性对其形成乳液凝胶的性质影响。研究表明:随着热处理温度提高,热处理时间延长,凝胶硬度、持水性先增大后减小,在85°C、30 min达到最大值,分别为1403.91±12.05 N、99.715%±0.022%。热处理显著降低了凝胶亮度L*(P<0.05),提高了红度值a*。凝胶溶解度结果表明,形成此凝胶的主要分子间作用力为疏水键及氢键。当热处理温度升高,热处理时间延长,形成凝胶的键先增多后减少,在85°C、30 min时达到最大值,其疏水键及氢键浓度分别为10.87±0.02 mg/g、4.03±0.02 mg/g。凝胶二级结构相对含量结果显示:热处理会导致凝胶二级结构发生显著变化(P<0.05)。凝胶微观结构证明:持水性及硬度高的凝胶具有更致密的网络结构。综合来看,85°C、30 min的热处理条件改善凝胶特性的效果最好。本研究为提高绿豆蛋白-高酰基结冷胶乳液凝胶的性能改善和进一步开发利用提供理论依据。

摘要： 2021年,由《环球科学》杂志评选的十大科学新闻最新出炉:中国空间站建造全面开启;多国火星探测项目取得进展;缪子g-2实验结果公布;中国科学家首次实现从头合成淀粉;新冠德尔塔和奥密克戎毒株带来新挑战;人工智能算法准确预测蛋白质结构;COP26落幕,中国积极推进“双碳”行动;发现海量快速射电暴;抗新冠特效药相继问世;首个人猴嵌合体胚胎引争议。

摘要： 2021年度十大科学突破北京时间2021年12月17日,《科学》杂志网站公布了其评选的2021年度十大科学突破结果。1人工智能预测蛋白质结构2021年7月,世界知名人工智能团队深度思维宣布,已经利用AI智能软件程序——阿尔法折叠预测了人类表达的几乎所有蛋白质的结构,以及其他20种生物几乎完整的蛋白质组。AI预测蛋白质结构将实现广泛应用,提供对基础生物学的见解并揭示潜在的药物靶点。

摘要： 蛋白质作为生命活动的执行者,其功能往往体现在与其他蛋白质的相互作用中,研究蛋白-蛋白相互作用对于人们深入了解和预防传染病、靶向治疗多基因疾病、阐明蛋白质的分子作用机制及各种复杂的生命现象具有重要意义。目前,有多种技术被用来研究蛋白间的相互作用,研究难点在于实时捕获瞬时或弱蛋白质间的相互作用,质谱技术(mass spectrometry,MS)可在某种程度上解决该难点。由于质谱技术可研究简单的蛋白质复合物再到大规模的蛋白质组实验,基于质谱技术研究蛋白质间相互作用被越来越多地应用于科学研究中。综述了蛋白质间相互作用检测方法的研究进展,重点介绍了氢氘交换质谱法和化学交联质谱法研究蛋白质间相互作用的优缺点及其应用,最后对基于质谱技术研究蛋白质间相互作用进行了总结与展望,以期为深入开展相关研究提供借鉴。

摘要： 荞麦蛋白质含量高、氨基酸组成合理、具有降血脂、降血压、降血糖、抗菌、抗肿瘤等多种生理功能,此外还具有碳排放量低的特性。荞麦蛋白质作为动物蛋白质的优质替代源之一,正受到蛋白质科学领域越来越多的关注。目前国内外有关荞麦的研究主要集中在荞麦蛋白质提取、组成特性、生理活性和功能特性等方面。结合荞麦蛋白质国内外研究现状,该文旨在综述荞麦蛋白质的提取工艺、亚基组成、二级结构、营养品质、生理活性成分及功能特性以及这些特性之间的关联性。

摘要： 通过测定色差与肌红蛋白相对含量探究八角提取液对热处理中鸭腿色泽的影响,进一步通过荧光光谱、热重分析、粒径以及傅里叶变换近红外光谱分析等方法,探究不同质量比八角主效成分莽草酸与肌红蛋白的作用机制。结果表明,八角提取液能一定程度改善鸭腿色泽。当莽草酸与肌红蛋白质量比为1∶10000且热处理30 min时,莽草酸能与肌红蛋白铁卟啉环以及色氨酸充分结合,且肌红蛋白表面粒径由756 nm变成183 nm。与空白组相比,处理组蛋白质α-螺旋相对含量增加了14.55%,无规卷曲结构相对含量由46.61%降至31.63%。综上所述,添加适量八角莽草酸能有效维持肌红蛋白结构稳定性,进而改善鸭腿色泽。

摘要： 为了研究不同氧化/冷冻条件对乳清蛋白结构的影响,将乳清蛋白分别在羟自由基氧化体系中氧化2 h和4 h后再分别置于-18°C和-40°C条件下冷冻2 d和4 d,结果表明:乳清蛋白经过先氧化再冷冻处理,其羰基和巯基含量增加,粒径变大,浊度和表面疏水性指数上升.结合多种表征结果来看,氧化2 h的乳清蛋白在-18°C冷冻2 d后的变化最大;红外光谱结果显示,此条件下蛋白质的二级结构由无规则卷曲向α-螺旋转变,且发现在-40°C冷冻条件下蛋白质结构的打开度比在-18°C冷冻条件下更小.这说明低温速冻对氧化后的乳清蛋白的结构起到保护作用,这也与扫描电子显微镜表征乳清蛋白的微观结构结果一致.本研究为含乳清蛋白食品先氧化再冷冻后的组织结构变化及品质优化提供了理论参考.

摘要： 甘油作为水溶液中蛋白质的稳定剂,研究其存在时蛋白质的结构变化对蛋白质相关研究和应用具有重要意义。本研究以牛血清白蛋白(BSA)为模型蛋白,采用离子淌度质谱(IM-MS)法和动态光散射法考察在近似生理条件下低浓度甘油对蛋白质结构的影响。在一定浓度范围内,甘油可引起BSA平均电荷和碰撞截面积(CCS)的增加,单个电荷状态也经历了CCS值的增加,还可导致BSA水化半径的增加,表明低浓度甘油可引起溶液中蛋白质结构松散。此外,含0.5%甘油的BSA去折叠的开始电压较高,且去折叠过渡发生在更宽的电压范围内,表明低浓度甘油可提高蛋白质的稳定性。本工作可为甘油稳定蛋白质的机制研究提供参考。

摘要： 以猪肉肌原纤维蛋白为研究对象,在羟自由基氧化体系中添加不同浓度(0、0.1、0.2、0.5、1.0、2.0 mmol/L)表没食子儿茶素没食子酸酯(epigallocatechin gallate,EGCG),以未加EGCG和氧化剂的肌原纤维蛋白溶液作为空白对照组,研究肌原纤维蛋白侧链结构以及蛋白凝胶水分分布的变化规律。结果表明,EGCG降低了肌原纤维蛋白游离巯基和总巯基含量,0.1 mmol/L~2.0 mmol/L EGCG组显著低于空白对照组(P<0.05);肌原纤维蛋白侧链形成的羰基和二聚酪氨酸含量随EGCG浓度的增加而逐渐下降,2.0 mmol/L EGCG组下降最明显。凝胶储能模量(G')随EGCG浓度的增加而升高。随EGCG浓度的增加,凝胶保水性逐渐升高,凝胶中不易流动水含量增加,自由水含量降低,2.0 mmol/L EGCG组降低效果最显著。相关性分析表明,EGCG浓度与蛋白质侧链羰基含量、游离氨基含量和表面疏水性呈极显著负相关(P<0.01),凝胶保水性与游离巯基含量、总巯基含量、羰基含量、表面疏水性呈极显著负相关(P<0.01)。

摘要： 类毒液过敏原蛋白(VAP)是一类高度保守的线虫分泌物,在线虫侵染寄主植物早期发挥重要作用.运用生物信息学方法在松材线虫(Bx)基因组中共鉴定出14个VAP家族成员,对其理化性质、保守基序和二、三级结构等生物学特性进行分析,并构建了系统发育进化树.结果显示:不同Bx-VAPs的氨基酸组成数量和相对分子质量存在很大差异;14个Bx-VAPs基因的进化相对保守,所有蛋白均含有代谢产物活化蛋白(CAP)结构域;该家族成员有明显的胞外蛋白形态特征,属于分泌蛋白.研究结果可为揭示松材线虫入侵、定殖和致病的机制奠定一定理论基础.

摘要： 研究和明确挤压组织化过程中蛋白质分子结构的变化，可为控制挤压组织化过程中的蛋白质变性提供理论依据。通过分析相关文献，从蛋白质组分及其分子量、蛋白质分子作用力、蛋白质自由巯基和二硫键含量、蛋白质二级结构四个方面分析了蛋白质结构在挤压过程中发生的变化。结果认为，挤压后，贮藏性蛋白，特别是含硫氨基酸的组分含量降低，生理活性蛋白含量提高。蛋白质的亚基分布呈现向低分子量转变的趋势。维持挤出物空间结构的主要是一些弱的相互作用，包括氢键、疏水作用和二硫键等，没有异肽键的参与。氢键、疏水作用和二硫键贡献的大小与挤压温度、水分含量等因素有关。低温挤压（≤160 °C）后，自由巯基和二硫键含量没有显著变化，但二硫键在由1%SDS和50 mmol/L磷酸钠溶液组成的提取剂（pH 6.9）中的提取率显著降低。环境pH 和水分含量对自由巯基和二硫键含量变化有重要影响。挤压后，蛋白质有序二级结构含量降低，但当温度低于160 °C时，植物蛋白不会完全线性化，或完全变为无规则卷曲结构。

摘要： 针对中国白色玉米朊产品生产以及使用单位无检验标准可依的不足,本文采用传统化学分析、溶解性试验以及紫外-可见光,红外和圆二色光谱等分析方法,从产品的化学组成与卫生指标;色泽与蛋白质变性程度;分子量分布以及二、三级结构等多层次,对商用白色玉米朊产品进行全面的质量评价.结果表明,白色玉米朊产品中蛋白质含量上升至98.67％,重金属含量低于2ppm,以上检测指标可满足国家药典的基本要求.白色玉米朊色泽洁白,色素含量仅为黄色玉米朊的22.18％;溶解性实验表明,白色玉米朊产品无明显变性现象.以上两参数可作为白色玉米朊产品的特征性检测指标.白色玉米朊产品的主要组成是α-玉米朊,脱色前后的玉米朊分子量分布无显著差异,主要集中在19kD(Z19)和23kD(Z22)附近;酰胺Ⅰ、Ⅱ和Ⅲ带等处的特征吸收峰均发生一定程度的蓝移;二级结构组成中α-螺旋含量由56.4％上升至60.4％,β-折叠含量由10.5％降低至5.9％;三级结构中苯丙氨酸与酪氨酸的近紫外吸收峰峰值略有升高.造成上述结果的原因是脱色处理后产品中β-玉米朊、色素和变性蛋白质含量降低,纯度显著提高.白色玉米朊生产企业与使用单位,可根据实际需要,采用一般化学分析、紫外-可见光谱分析与溶解性试验、蛋白质结构分析等三个层次进行该产品的质量评价.

摘要： 矿物粉尘是大气颗粒物的重要组成部分,与心血管和呼吸系统空气污染疾病密切相关.PM2.5及更细的纳米颗粒物(NPs)已成为国际大气污染研究领域的热点和前沿.目前国内外对PM2.5以及更细的颗粒物如纳米物质的生物效应、颗粒物—生物体系界面作用特征等的研究较少。本文采用SEM、FTIR和ICP-AES等手段研究了2种超细高硅钙质大气矿物颗粒物及其NPs与培养条件下人体常见菌中的表皮葡萄球菌的界面作用，其中包括矿物表面响应和微生物表面响应。研究结果表明，表葡与矿物颗粒物作用后细菌表面形貌出现了明显的凹陷、皱缩等现象；与表葡作用后，纳米二氧化硅团聚现象更明显，方解石表面发生溶蚀、圆化，棱角消失，但石英表面溶蚀现象不明显。另外，纳米碳酸钙颗粒物由球状变成了片层状，这一变化经共培养体系中Ca2+浓度动力学变化证实是由碳酸钙溶解后再结晶所形成。面蛋白的酰胺一带分峰证据表明，与石英作用后蛋白质二级结构中β-折叠和α-螺旋含量的比例显著降低。表明细菌表面蛋白质结构发生变化，从而可能影响细菌的生理活动。α-螺旋和β-折叠在维持蛋白质二级结构稳定性上起着重要作用，而蛋白质二级结构与蛋白质生理活性过程密不可分。总之，石英和方解石均能对表葡菌体表面多糖、磷脂和蛋白质造成影响，而石荚的影响更加显著，其造成了表葡菌体表面蛋白分子二级结构稳定性的降低，从而引起细菌表面结构和形貌发生变化。

摘要： 泛素结合酶(E2)是泛素/26S蛋白酶体途径中3个关键酶之一,在靶蛋白识别、与泛素连接酶(E3)互作等蛋白的泛素依赖性水解和N-末端规则依赖性水解途径的关键环节中起重要作用.采用Solexa测序技术获得了一条普通油茶E2的全长eDNA序列,命名为UBE2-J2,该基因编码239AA,与其它物种的E2具有较高的一致性和相似性;同源建模的结果表明普通油茶UBE2-J2蛋白具有泛素结合酶催化位点(UBCc),第8～122位氨基酸碱基为其泛素结合酶基因家族的保守区域,第75～122位氨基酸残基区域中有17个可与泛素形成硫酯键中间产物的残基,其中87位的半胱氨酸残基是该酶活性中心位点,另有5个残基是与E3酶相互作用的位点.UBE2-J2具有C端延伸结构,故普通油茶UBE2-J2蛋白属于Ⅱ类E2基因家族成员.

摘要： 本实验采用荧光分光光度、圆二色光谱(cD)以及NMR光谱等手段与方法,对BSA进行压力处理条件下测定它的的结构变化.随着压力的增高无发现可逆性的光谱变化.最大荧光波长,从100-200MPa附近开始短波长方向转移.之后加压的同时开始长波长方向移动.但在400MPa范围之内BSA达不到变性状态.随着巨大分子量的变化、未能引起分子会合,仍维持折叠结构,1H-NMR光谱和全面积强度中无发现变化.本研究对新机能性高压食品开发等方面有着可喜的前景.

摘要： 本实验采用荧光分光光度、圆二色光谱(cD)以及NMR光谱等手段与方法,对BSA进行压力处理条件下测定它的的结构变化.随着压力的增高无发现可逆性的光谱变化.最大荧光波长,从100-200MPa附近开始短波长方向转移.之后加压的同时开始长波长方向移动.但在400MPa范围之内BSA达不到变性状态.随着巨大分子量的变化、未能引起分子会合,仍维持折叠结构,1H-NMR光谱和全面积强度中无发现变化.本研究对新机能性高压食品开发等方面有着可喜的前景.

摘要： 本实验采用荧光分光光度、圆二色光谱(cD)以及NMR光谱等手段与方法,对BSA进行压力处理条件下测定它的的结构变化.随着压力的增高无发现可逆性的光谱变化.最大荧光波长,从100-200MPa附近开始短波长方向转移.之后加压的同时开始长波长方向移动.但在400MPa范围之内BSA达不到变性状态.随着巨大分子量的变化、未能引起分子会合,仍维持折叠结构,1H-NMR光谱和全面积强度中无发现变化.本研究对新机能性高压食品开发等方面有着可喜的前景.

摘要： 本实验采用荧光分光光度、圆二色光谱(cD)以及NMR光谱等手段与方法,对BSA进行压力处理条件下测定它的的结构变化.随着压力的增高无发现可逆性的光谱变化.最大荧光波长,从100-200MPa附近开始短波长方向转移.之后加压的同时开始长波长方向移动.但在400MPa范围之内BSA达不到变性状态.随着巨大分子量的变化、未能引起分子会合,仍维持折叠结构,1H-NMR光谱和全面积强度中无发现变化.本研究对新机能性高压食品开发等方面有着可喜的前景.

摘要： 本文从PMWS患猪分离PCV2 48285株，采用定点突变技术对蛋白质进行序列分析，突变株和亲本株的感染性克隆转染到PK-15细胞中后，通过间接免荧光技术计算了PCV2阳性细胞数目，并在不同时间点收集了上清。通过病毒滴度测定和抗原捕获ELISA技术测定了感染性病毒颗粒数目及上清中的PCV2 Cap蛋白量。16株特异识别48285株的单克隆抗体被用于测试与突变体的反应性。结果：在转染后12小时即可检测到突变体病毒阳性细胞，并在36小时后迅速增加到最高值。转染后12-48小时，突变体病毒和亲本株之间复制能力差异并不显著。但在上清中的病毒数量，突变体病毒明显少于亲本病毒株(P<0.05)。通过抗原捕获ELISA可发现突变体病毒的OD450值明显低于亲本株(P<0.05)。从第二到第七代，突变体病毒滴度逐渐下降直到检测不到而亲本株病毒滴度则逐渐上升。突变体病毒与上述16株单抗均可发生反应。结论：97RIRKVKV 103是PCV2在PK 15细胞中的复制的关键基序。

摘要： 本文从PMWS患猪分离PCV2 48285株，采用定点突变技术对蛋白质进行序列分析，突变株和亲本株的感染性克隆转染到PK-15细胞中后，通过间接免荧光技术计算了PCV2阳性细胞数目，并在不同时间点收集了上清。通过病毒滴度测定和抗原捕获ELISA技术测定了感染性病毒颗粒数目及上清中的PCV2 Cap蛋白量。16株特异识别48285株的单克隆抗体被用于测试与突变体的反应性。结果：在转染后12小时即可检测到突变体病毒阳性细胞，并在36小时后迅速增加到最高值。转染后12-48小时，突变体病毒和亲本株之间复制能力差异并不显著。但在上清中的病毒数量，突变体病毒明显少于亲本病毒株(P<0.05)。通过抗原捕获ELISA可发现突变体病毒的OD450值明显低于亲本株(P<0.05)。从第二到第七代，突变体病毒滴度逐渐下降直到检测不到而亲本株病毒滴度则逐渐上升。突变体病毒与上述16株单抗均可发生反应。结论：97RIRKVKV 103是PCV2在PK 15细胞中的复制的关键基序。

摘要： 由下述氟树脂形成了与蛋白质或包含蛋白质的组合物接触的表面的容器及用于制造蛋白质或包含蛋白质的组合物的器材具有显著的低蛋白质吸附性，其中，所述氟树脂为选自四氟乙烯‑六氟丙烯系共聚物及四氟乙烯‑全氟烷基乙烯基醚系共聚物中的至少1种氟树脂，并且，所述氟树脂的熔点为320°C以下，所述氟树脂中的相对于每1×10

摘要： 本发明提供能减小使用了特异性地结合的物质的测定中的由肝型脂肪酸结合蛋白质引起的测定值的变动幅度的肝型脂肪酸结合蛋白质制剂、评价该制剂的方法、制作肝型脂肪酸结合蛋白质的校准曲线的方法、以及定量该蛋白质的方法。一种用使用了用10mM的氧化剂在25°C下进行1小时的氧化处理的肝型脂肪酸结合蛋白质制剂的测定值与使用了未进行上述氧化处理的肝型脂肪酸结合蛋白质制剂的测定值的比表示的氧化变动系数设定为1.4以下的肝型脂肪酸结合蛋白质制剂、用于该制剂的肝型脂肪酸结合蛋白质、编码该蛋白质的DNA、由该DNA转化得到的细胞、该蛋白质的制造方法、评价该制剂的方法、抑制使用该制剂的测定中的测定值的变动幅度的方法、制作该蛋白质的校准曲线的方法、以及定量该蛋白质的方法。

摘要： 本发明提供一种糖化蛋白质测定试剂，其至少包含Trinder’s试剂、4‑氨基安替比林、蛋白酶、蛋白酶的稳定剂以及亚铁氰化物，其中，至少Trinder’s试剂包含在含有Trinder’s试剂的部分组合物中，至少4‑氨基安替比林包含在含有4‑氨基安替比林的部分组合物中，蛋白酶的稳定剂是使亚铁氰化物与该蛋白酶的稳定剂混合后的氧化还原电位大于0.058V的稳定剂，氧化还原电位是包含蛋白酶的稳定剂和亚铁氰化物、不包含糖化蛋白质的反应体系的氧化还原电位。

摘要： 本发明提供能够以优异的安全性将蛋白质导入到细胞中的蛋白质导入方法。通过使目标蛋白质承载在由粘土矿物构成的蛋白质导入用载体上并将其添加到细胞中，可以将所述目标蛋白质导入到所述细胞内中。所述粘土矿物优选为层状粘土矿物，可以使用蒙脱石、蛭石、伊利石等。

摘要： 本发明涉及与粉碎或切断洋葱等植物时发生催泪成分的生成有关的表现出将1－丙烯次磺酸转变为催泪成分的作用的蛋白质或多肽、编码该蛋白质或多肽的DNA(催泪成分合成酶基因)、使用用于属于葱属植物的催泪成分合成酶基因分离的引物以及使用该引物分离该基因的方法、含有上述DNA的重组载体、包含含有上述DNA的重组载体的转化体、对用含有上述DNA的重组载体转化的宿主细胞进行培养制造具有催泪成分合成酶活性的蛋白质或多肽的方法、具有催泪成分合成酶活性的蛋白质或多肽、以及具有抑制具有催泪成分合成酶活性的蛋白质或多肽的mRNA翻译的功能的核酸分子。

摘要： 由具有糖蛋白生成抑制活性的序列表中序列1记载的氨基酸序列构成的蛋白质、其变异体蛋白质、由序列表中序列2记载的核苷酸序列组成的DNA、其DNA变异体以及使用上述蛋白质和DNA的糖蛋白异常症(例如囊性纤维化症)的包括基因治疗在内的治疗药。

摘要： 预测蛋白质结构的方法和装置。该方法和装置可以包括获得构成蛋白质的多个氨基酸的序列信息；以及基于序列信息，通过使用预训练的模型来预测蛋白质上的二面角，分子动力学应用于该二面角。

摘要： 本发明提供一种蛋白质结构预测方法、蛋白质结构预测装置及介质。蛋白质结构预测方法，应用于计算机设备，计算机设备包括CPU和至少一个GPU，包括：获取待预测蛋白质结构的目标蛋白质序列。在CPU中，根据目标蛋白质序列的序列长度，确定目标蛋白质序列对应匹配序列的比对数量阈值。根据比对数量阈值，将目标蛋白质序列与预置的蛋白质序列库中的多个蛋白质序列进行比对，确定目标蛋白质序列对应的匹配序列。在预置的蛋白质结构数据库中，确定匹配序列对应的匹配结构。将匹配序列和匹配结构输入至预置在GPU中的蛋白质结构预测模型中进行蛋白质结构预测，得到目标蛋白质序列对应的蛋白质预测结构。能够减少GPU内存的占用，提高GPU的运算速度，加快预测速率。

摘要： 本申请实施例提供的蛋白质结构预测模型的训练方法和蛋白质结构预测方法，涉及计算机技术领域。本申请实施例提供的蛋白质结构预测方法和蛋白质结构预测方法，训练数据集中的每个氨基酸序列样本均具有第一表征矩阵和第二表征矩阵，基于各个氨基酸序列样本的第一表征矩阵和第二表征矩阵，并采用知识蒸馏的方法，借助辅助训练的分类网络对蛋白质结构预测模型包含的特征增强网络和结构预测网络进行联合训练，得到的蛋白质结构预测模型，可以基于待处理蛋白质的低质量的特征表征矩阵，对待处理蛋白质的结构进行预测，获得精度较高的蛋白质结果预测结果，提高蛋白质结构预测的预测精度。

摘要： 本发明公开了一种基于蛋白质三维结构图像鉴定蛋白质结构域的方法及系统，本发明基于结构相似性鉴定蛋白质结构域，能够有效解决当序列一致性不高时，蛋白质多序列比对错误导致的蛋白质结构域识别错漏；本发明构建基于动态图卷积神经网络的点云分割模型，可通过整合全局结构特征与局部结构特征，同时完成蛋白质结构域的分割和蛋白质结构域语义标签的获取。