胎儿游离DNA

摘要： 目的使用高通量测序用外周血胎儿染色体非整倍体(T21、T18和T13)国家参考品,评价国内的胎儿染色体非整倍体21三体、18三体和13三体检测试剂盒(高通量测序法)的质量。方法依据企业各自的注册产品标准或产品技术要求,使用不同的试剂盒检测国家参考品。提取国家参考品的血浆游离DNA,通过接头连接等步骤构建文库。将文库纯化后,使用不同原理的测序仪进行检测。然后将测序数据按照试剂盒配套的软件进行分析,获得染色体非整倍体的检测结果。结果染色体正常或其他染色体异常的国家阴性参考品,结果均不是21、18和13三体。胎儿游离DNA 5%浓度的国家检测限参考品结果均是相应染色体三体;3.5%浓度的国家检测限参考品,准确检出率均不低于96%(>48/50)。70%和30%嵌合比例的国家嵌合体参考品结果均为相应染色体三体。国家微缺失微重复参考品中18号染色体微重复参考品结果均是18三体,其余参考品结果均不是21、18和13三体。结论抽检的胎儿染色体非整倍体21三体、18三体和13三体检测试剂盒均符合各自产品技术要求中阴性参考品符合率、微缺失微重复参考品符合率、嵌合体参考品符合率和检测限的要求,符合国家体外诊断试剂监督抽验的要求。

摘要： 目的探讨胎儿游离DNA高通量测序在产前诊断中的应用价值。方法抽取2020年1月-2021年6月该院施行无创DNA检测孕妇共21705例为研究对象,评估其检测结果。结果21705例孕妇中,DNA筛查异常共279例,占比1.29%;介入产前诊断共221例,85例出现染色体核型异常。结论在产前诊断中,胎儿游离DNA高通道测序技术的运用,可有效筛查是否为染色体异常,杜绝不必要介入性产前诊断。

摘要： 无创产前检测(non-invasive prenatal testing,NIPT)是通过抽取孕妇外周血并从中提取出胎儿游离DNA,利用二代测序技术并结合生物信息学分析来诊断胎儿染色体异常,本文结合产前筛查技术的发展历程、无创产前基因检测的原理、目前高通量测序技术主流平台间的比较,讨论无创产前基因检测的临床应用与局限性,给产前诊断带来的新问题及展望.

摘要： 目的 探究应用母血浆中胎儿游离DNA进行无创性产前诊断的临床价值情况.方法 选择2017年9月至2019年9月来本院产前诊断中心接受产检的1708例孕妇为研究对象,对其开展游离DNA检测以及羊水染色体核型分析工作.结果 在所有母血胎儿游离DNA测试结果中,共计28例染色体异常,风险率为1.64％.其中,2例染色体多态、8例18-三体高危、16例21-三体高危以及4例性染色体高危与最终羊水染色体核型分析结果相同.有2例经测序结果证实为47,某受试者通过羊水染色核型分析结果正常.对此次试验判定为低风险者进行妊娠结局随访,没有发现漏诊、误诊案例,准确率达到了99.99％.结论 在受试者孕中期,为其开展无创性母血胎儿游离DNA检测,对于检出腹内胎儿染色体非整倍体情况结果可靠.但值得注意的是,其在测定染色体非正位体胎儿无创性检查方面有假阳性可能,因此还需要进一步完善有关试验方法,以全面提升检测精准率.

摘要： 目的 分析孕中期高危孕妇外周血中胎儿游离DNA(Cell-free fetal DNA,cffDNA)与高危产前诊断指征相关性.方法 研究对象为2018年7月-2019年7月在遂宁市中心医院产前诊断中心接受外周血cffDNA筛查的3176例孕中期高危孕妇,记录高危产前诊断指征、cffDNA检测结果,分析不同高危产前诊断指征的孕中期高危孕妇外周血cffDNA筛查结果,以染色体核型检查结果为对照,分析孕中期高危孕妇外周血中cffDNA的筛查价值.结果 3176例孕中期高危孕妇的产前诊断指征分别为高龄(年龄≥35岁)33.63％(1068/3176)、血清学筛查临界风险31.30％(994/3176)、血清学筛查高风险18.29％(581/3176)、不良孕产史2.90％(92/3176)、B超软指标异常2.39％(76/3176)、B超提示胎儿结构异常0.22％(7/3176)、其他11.30％(359/3176).cffDNA检查结果显示57(1.79％)例孕妇外周血cffDNA检查结果为高风险,以B超提示胎儿结构异常的孕妇外周血cffDNA检测高风险相对比例最高,为28.57％,血清学筛查高风险(2.75％)、不良孕产史(2.17％)、高龄(1.97％)、血清学筛查临界风险(1.21％)、其他(1.12％).57例孕妇外周血cffDNA高风险患者中,56.14％的孕妇染色体核型分析染色体核型异常,cffDNA高风险预测21三体的准确率最高(82.60％).结论 孕中期高危孕妇外周血中 cffDNA与高危产前诊断指征存在一定关系,孕中期开展外周血cffDNA筛查期较高的灵敏度、特异度,具有无创、准确率高的特点,尤其是对T21的筛查具有较高的准确度.

摘要： 在第九届"中国胎儿医学大会"上,来自南京医科大学附属妇产医院副院长许争峰教授从技术角度出发,带来了"减少NIPS检测失败率及假阴性-胎儿游离DNA富集技术"主题演讲。许教授从NIPS中存在的问题—假阴性及检测失败出发,分析了假阴性和检测失败的原因,提出了"胎儿游离DNA富集技术"。之后详细介绍了富集方法,通过建立不同片段大小区间,回顾性分析10000例男性胎儿NIPS测序数据,建立了提高胎儿浓度的富集方法。

摘要： 目的:探究双胎妊娠孕妇甲状腺功能及外周血胎儿游离DNA水平.方法:选取2018年2月-2020年2月本院收治的妊娠期双胎孕妇,其中甲状腺功能异常52例为观察组,功能正常52例为对照组;采用血浆基因组DNA磁珠法抽提孕妇外周血中胎儿游离DNA检测其浓度,酶法检测血糖以及血脂水平,比较两组妊娠期出现高血压、贫血、糖尿病以及胎儿发育不良和早产的发生率.结果:观察组外周血胎儿游离DNA水平,总胆固醇、三酰甘油、低密度脂蛋白胆固醇以及血糖水平均高于对照组(P＜0.05);两组高密度脂蛋白胆固醇水平无差异(P＞0.05);观察组出现高血压、贫血、糖尿病以及胎儿发育不良等总发生率(26.9％)及早产率(19.2％)均高于对照组(11.5％、1.9％)(P＜0.05).结论:妊娠期双胎孕妇外周血胎儿游离DNA能够反映孕妇甲状腺功能、血糖、血脂水平,甲状腺功能异常的双胎孕妇并发症较多且妊娠结局不理想.

摘要： 目的 对孕妇外周血胎儿游离DNA(cell-free fetal DNA,cffDNA)无创产前检测的失败原因及妊娠结局进行分析,探讨检测失败病例的处理方案.方法 对5898例妊娠12～22周的单胎孕妇进行外周血cffDNA检测,设定严格的质控标准,首次检测不达标者在知情同意后选择二次采血或直接进行产前诊断.结果 首次采血检测失败率为0.5％(32/5898),其中17例cffDNA％未达质控标准,10例两次建库检测均提示染色体数据波动,5例可能存在无法鉴别的性染色体异常.32例首次采血检测失败的病例中,2例直接接受了羊水细胞染色体核型分析,结果均未见异常;30例接受了重新采血,其中24例在二次采血后发放了检测报告,最终失败率为0.1％ (8/5898).二次采血共报告21三体、18三体、13三体高风险各1例,经羊水细胞染色体核型分析证实均为假阳性.6例二次采血检测失败病例中,1例产前诊断未见异常;1例产前诊断为mos45,X[32]/46,XY[18];4例未进行产前诊断,目前生长发育未见异常.结论 cffDNA比例低是检测失败的主要原因,但二次采血成功率较高,可有效增加最终检测成功率,减少侵入性检测数量,首次检测失败的孕妇在充分知情的前提下可考虑重新采血检测.

摘要： 胎盘滋养层细胞具有凋亡细胞和胚胎的双重特性,其释放的游离DNA (cell free DNA,cfDNA)存在于孕妇的外周血中,其过程也受到母体因素的影响.妊娠相关的疾病包括子痫前期、妊娠期糖尿病、先兆早产、巨大儿、胎儿生长受限等对产妇生命或妊娠结局造成了严重的威胁,早期筛查和及时干预对降低这类风险具有重要意义.本文就通过产妇外周血cfDNA筛查妊娠相关疾病的研究进展作一综述.

摘要： 目的了解掌握浙江省金华市不同医疗机构采集孕妇外周血开展胎儿游离DNA无创产前检测的现状,为进一步合理设置产前筛查机构,方便孕妇接受无创产前检测服务提供有效的参考依据。方法通过全国医疗机构联网查询注册系统,查询并核实金华市核准有妇产科并开展B超检查等常规产检的医疗机构22家,对在该院进行产检的高龄孕妇(35周岁及以上)进行电话随访,了解是否接受外周血采集开展胎儿游离NDA检测等相关情况。结果22家医院中,4家具备产前筛查资质的医疗机构孕妇接受外周血采集开展胎儿游离DNA检测的占比52.5%,不具备产前筛查资质的18家医疗机构中有13家存在推荐采集外周血开展胎儿游离DNA检测的情况,调查112名对象,有48人接受了外周血采集检测,占比42.85%,两者差异无显著性(X^(2)=0.75,P>0.05)。结论产检机构医务人员推荐孕妇采集外周血开展胎儿游离DNA无创产前检测筛查染色体非整倍体疾病现象较为普遍,筛查机构设置少、区域设置不平衡不能满足孕妇检测需求,亟需从政策层面上进行调整,合理设置产前筛查采血点,切实方便孕产妇采血筛查,提高人口出生质量。

摘要： 1997年孕妇外周血中胎儿游离DNA的发现,为无创产前诊断的发展开辟了新篇章.本文对胎儿游离DNA进行了简要的介绍,并对其在无创染色体非整倍体检测、无创胎儿染色体微缺失/重复检测、单基因遗传病等领域的应用进行了探讨.

摘要： 1997年孕妇外周血中胎儿游离DNA的发现,为无创产前诊断的发展开辟了新篇章.本文对胎儿游离DNA进行了简要的介绍,并对其在无创染色体非整倍体检测、无创胎儿染色体微缺失/重复检测、单基因遗传病等领域的应用进行了探讨.

摘要： 1997年孕妇外周血中胎儿游离DNA的发现,为无创产前诊断的发展开辟了新篇章.本文对胎儿游离DNA进行了简要的介绍,并对其在无创染色体非整倍体检测、无创胎儿染色体微缺失/重复检测、单基因遗传病等领域的应用进行了探讨.

摘要： 本发明公开一种提高孕妇血浆游离DNA测序文库中胎儿游离DNA占比的方法，步骤如下：提取孕妇血浆游离DNA；在孕妇血浆游离DNA的两端添加特异性序列标签获得具有孕妇个体识别标记的血浆游离DNA；对具有孕妇个体识别标记的血浆游离DNA进行PCR扩增，获得该孕妇个体血浆游离DNA的原始文库；在选定长度范围内，对孕妇该原始文库进行回收，获得用于高通量测序的回收文库或者将多个不同个体孕妇所述孕妇原始文库进行混合后构建回收文库。可对孕妇外周血胎儿游离DNA含量过低的样本进行准确检测，而且降低了每个样本的测序数据量，提高了一次测序反应的样本通量，降低了检测成本，有利于大规模推广。

摘要： 本发明提供了利用孕妇血浆游离DNA进行胎儿基因型鉴定的方法，具体地本发明的方法使用高精确性的二代测序平台，避免对目标区域富集、建库等繁琐操作，克服了现有基于直接测序的检测技术操作复杂、费用昂贵、准确性不高的缺陷，是一种简单快速、低成本、高精确性的血浆游离DNA胎儿基因型的检测技术，在无创产前诊断等领域将会有广泛的应用前景。

摘要： 本发明公开一种提高孕妇血浆游离DNA测序文库中胎儿游离DNA占比的方法，步骤如下：提取孕妇血浆游离DNA；在孕妇血浆游离DNA的两端添加特异性序列标签获得具有孕妇个体识别标记的血浆游离DNA；对具有孕妇个体识别标记的血浆游离DNA进行PCR扩增，获得该孕妇个体血浆游离DNA的原始文库；在选定长度范围内，对孕妇该原始文库进行回收，获得用于高通量测序的回收文库或者将多个不同个体孕妇所述孕妇原始文库进行混合后构建回收文库。可对孕妇外周血胎儿游离DNA含量过低的样本进行准确检测，而且降低了每个样本的测序数据量，提高了一次测序反应的样本通量，降低了检测成本，有利于大规模推广。

摘要： 本发明公开了一种以孕妇游离DNA评估胎儿DNA浓度的方法，属于生物信息技术领域。该方法包括以下步骤：S101：对孕妇游离DNA样本的二态性位点进行测序得到DNA数据S；S102：获取S中满足预定要求的位点集X’；S103：根据公式I计算位点集X'上某一个位点的概率P；S104：采用极大似然值法得到点集X'的累计概率h最大时的pmax；S105：胎儿DNA的浓度N=2pmax。本方法可以以孕妇游离DNA评估胎儿DNA浓度，在亲子鉴定时，可根据评估值判断是否需要检测孕妇的白细胞，是否需要重新送检；进而提升亲子鉴定的准确性。

摘要： 本发明公开了一种孕妇游离及本身DNA评估胎儿DNA浓度的方法及应用，属于生物信息技术领域。该方法包括以下步骤：S101：对孕妇白细胞DNA样本和孕妇游离DNA样本的二态性位点进行测序分别得到DNA数据M和S；S102：获取S中满足预定要求的位点集X’；S103：根据公式I计算位点集X'上某一个位点的概率P；S104：采用极大似然值法得到点集X'的累计概率h最大时的pmax；S105：胎儿DNA的浓度N=2pmax。本方法可以评估胎儿DNA浓度，在亲子鉴定时，可根据评估值判断是否需要检测孕妇的白细胞，是否需要重新送检；进而提升亲子鉴定的准确性。

摘要： 本发明属于遗传学技术领域，公开了一种基于孕妇外周血中胎儿游离DNA的亲子鉴定方法。本发明首先提取4周以上孕妇外周血中的游离DNA，然后给游离DNA连接含有UMI序列的接头，进而构建测序文库；通过测序及过滤后聚类分析，推断胎儿的生物学父亲，并计算亲权指数。本发明通过引入UMI标签序列，及对测序数据进行聚类，可对来源于同一模板的不同测序数据进行对比分析，进而分析SNP信息。本发明可实现较低含量的SNP的检测，解决了在进行4～6周孕妇外周血中胎儿游离DNA的SNP检测时，难以区分SNP是来源于建库、测序步骤引入的错误，还是原始样本中真实存在的技术问题，使亲子鉴定结果更准确。

摘要： 本发明公开了一种通过孕妇外周血游离DNA检测胎儿染色体平衡性结构变异的方法，包括核心家系单体型模型的构建和胎儿结构变异检测。通过收集染色体结构重排变异携带夫妇的家系，对其进行SNP基因分型，明确结构重排染色体和结构正常染色体的单体型，构建全基因组单体型模型。对孕妇外周血游离DNA进行捕获测序，根据隐马尔可夫模型对游离DNA中胎儿基因型和单体型加以推算分析，通过分析胎儿是否携带结构重排染色体断裂点区域附近的单体型来对胚胎染色体结构重排进行预测。本发明首次提出通过孕妇外周血cfDNA进行胎儿平衡性染色体结构异常的检测，为染色体病预防和诊断提供重要指导。

摘要： 本申请涉及分子诊断领域。具体而言，本申请利用多重不对称PCR扩增和多色探针熔解曲线分析，建立了一种检测母亲来源的样品与父亲来源的样品的SNP位点的方法。进一步的，本申请结合数字PCR系统，开发了一种检测孕妇样品中胎儿游离DNA存在或比例的方法和试剂盒。与现有技术相比，本申请的方法及试剂盒能够实现自动化检测，人工操作步骤少，检测周期短，并且检测准确，灵敏度高。

摘要： 本发明提供一种检测胎儿游离DNA含量的数字PCR检测试剂盒及其方法，所述试剂盒包括分别用于检测胎儿标志物基因的含CpG岛区域、内参基因含甲基化敏感的限制性内切酶酶切位点区域和所述内参基因不含甲基化敏感的限制性内切酶酶切位点区域的数字PCR检测试剂。本发明试剂盒及其方法定量准确，没有性别选择性，是一个普适的母体血浆中胎儿游离DNA检测试剂和方法。

摘要： 本实用新型公开了一种用于孕期亲子鉴定的胎儿游离DNA提取装置，包括主体，所述主体为水平放置的凹形板状，所述主体底部固定连接有支撑板，且同一水平的支撑板为一组，所述主体的内底部设有置物板，所述主体表面的两侧均通过铰链铰接有箱门，所述主体内右侧面固定连接有安装板，所述安装板底部左侧固定连接有支撑柱，且支撑柱同一水平的支撑柱为一组。本实用新结构简单、操作简便，在使用时，当伺服电机带动转动轴上的固定卡盘进行转动时，通过准转动板和和凹槽，使试管在保持高速转动的同时，不会因为转速提高或降低，导致试管脱落，提高了工作效率和检测的精准度，通过凹槽和玻璃板，方便使用人员进行观测记录。