一种基于SMRT高通量测序技术的菌群多样性组成谱数据分析方法

摘要

本发明公开的一种基于SMRT高通量测序技术的菌群多样性组成谱数据分析方法，包括如下步骤：(1)对SMRT高通量测序的原始下机数据根据序列质量进行初步筛查，并进行CCS序列的校正过滤；(2)通过质量初筛的序列按照引物和Barcode信息，识别分配入对应样本，并去除嵌合体序列；(3)对获得的序列进行OTU归并划分，每个OTU的代表序列用于分类地位鉴定以及系统发育学分析；(4)根据OTU在不同样本中的丰度分布，评估每个样本的多样性水平，并通过稀疏曲线反映测序深度是否达标；(5)对各样本在不同分类水平的具体组成进行分析并检验组间是否具有统计学差异；(6)通过多变量统计学分析工具，进一步衡量不同样本间的菌群结构差异及与差异相关的物种；(7)根据物种在各样本中的组成分布，构建互作关联网络。