基于高通量测序技术的溃疡性结肠炎患者肠道菌群多样性研究

摘要

目的 探讨溃疡性结肠炎(U C)肠道菌群结构、丰度与多样性的变化规律.方法 收集13例溃疡性结肠炎患者及42例健康人群的粪便样本,提取基因组DNA并对细菌16S rRNA基因V4区进行PCR扩增,应用Illumina Miseq平台进行高通量测序并进行生物信息学分析.结果 溃疡性结肠炎患者肠道菌群多样性较健康对照人群显著下降(P<0.05),两组人群肠道菌群结构均存在明显个体差异.厚壁菌门在溃疡性结肠炎患者的肠道菌群中丰度显著降低(P<0.01),变形菌门和梭杆菌门在溃疡性结肠炎患者肠道菌群中的丰度相比于健康人群显著增高(均P<0.01).属水平上:溃疡性结肠炎组梭菌属、乳杆菌属、梭杆菌属和动弯杆菌属丰度明显增高(均P<0.05),而Dialister菌属、Faecali-bacterium菌属、粪球菌属、毛螺旋菌属和普雷沃氏菌属的丰度与对照组相比显著下降(均P<0.05).结论 溃疡性结肠炎患者肠道菌群多样性、构成及丰度与健康对照人群比较均存在显著差异,溃疡性结肠炎患者肠道菌群结构明显失衡,可能与溃疡性结肠炎的发病和发展有关.