从SNP数据中发现与复杂疾病相关SNP组的方法

摘要

本发明公开了一种从SNP数据中发现与复杂疾病相关SNP组的方法。以解决现有技术不能从复杂疾病SNP数据中发现易感疾病的多个可能致病原因及每一原因所涉及的SNP组合问题。其实现步骤是：对复杂疾病的SNP数据集进行预处理；根据SNP组的关联性测度，搜索预处理后的数据集中候选疑似致病原因的SNP组；计算所有候选疑似致病原因的SNP组关联性的稳定性测度；将关联性的稳定性测度最大的SNP组作为疑似致病原因加入到与复杂疾病相关的SNP组的集合；输出与复杂疾病相关的SNP组的集合中的SNP组，并用关联性的稳定性接近1的程度评价这些SNP组是疑似致病原因的程度。本发明能同时发现数据中隐藏的多个原因性SNP组，可用于对复杂疾病的致病机理研究、早期诊断和生物药物研制。