应用关联规则筛选疾病相关的SNP位点及其组合的分析方法

摘要

目的 探讨应用关联规则(association rules)挖掘技术筛选对疾病表型相关的基因SNP位点的分析方法.方法 应用关联规则挖掘技术,从中国肺癌病例对照研究的核苷酸切除修复通路(nucleotide exicision repair,NER)基因SNP位点筛选与肺癌有关联的SNP位点及其组合,作为logistic回归模型的待选解释变量作进一步确认性研究.结果 发现与肺癌易感性可能相关的基因变异位点,并且发现位点ERCC1-rs3212951和ERCC1-rs3212955之间可能存在交互作用.结论 关联规则挖掘技术可以作为疾病相关的SNP位点及交互作用的初筛手段,有效地找到肺癌等复杂性状疾病相关的基因多态位点和交互作用项.