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基于拓扑结构和随机森林算法预测蛋白质复合物功能

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本文基于具有相似的拓扑结构的蛋白质复合物具有相似的生物学功能这一假定,采用随机森林算法构建了蛋白质复合物功能预测系统.在该系统中,蛋白质复合物被模拟为具有点和线组成的图形.基于图论,蛋白质复合物的拓扑结构描述符被计算,并且被用于表征蛋白质复合物.采用随机森林算法和一对其余策略构建蛋白质复合物功能预测模型.基于训练集和预测集的结果表明构建的模型具有优良的泛化性能.

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来源
《第十二届全国计算（机）化学学术会议》|2013年|59-60|共2页
会议地点苏州
作者
Zhanchao Li; 李占潮; Yanhua Lai; 赖燕华; Lili Chen; 陈丽丽; Yun Xie; 谢韵; Zong Dai; 戴宗; Xiaoyong Zou; 邹小勇;
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作者单位

中国化学会;

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会议组织
正文语种
原文格式 PDF
中图分类 Q51:Q502;
关键词
蛋白质复合物; 功能预测系统; 拓扑结构; 随机森林算法; 相互作用网络;

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