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表型分析

表型分析的相关文献在1994年到2022年内共计186篇,主要集中在分子生物学、基础医学、园艺 等领域,其中期刊论文135篇、会议论文10篇、专利文献178149篇;相关期刊102种,包括菌物学报、生物技术通报、生物学杂志等; 相关会议10种,包括2016年中国观赏园艺学术研讨会 、第九届全国遗传病诊断与产前诊断学术交流会暨产前诊断和医学遗传学新技术研讨会、北京放射肿瘤学术论坛等;表型分析的相关文献由833位作者贡献,包括乔治·G·达布尔、于长青、何堃等。

表型分析—发文量

期刊论文>

论文:135 占比:0.08%

会议论文>

论文:10 占比:0.01%

专利文献>

论文:178149 占比:99.92%

总计:178294篇

表型分析—发文趋势图

表型分析

-研究学者

  • 乔治·G·达布尔
  • 于长青
  • 何堃
  • 李莉
  • 王宁
  • 王红
  • 王铸钢
  • 玛赛拉·基亚里
  • 赛利姆·昂鲁
  • A.卡门
  • 期刊论文
  • 会议论文
  • 专利文献

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排序:

年份

    • 许双双; 安玉兰; 温梦梅; 胡克玲; 杨咏; 甘德芳
    • 摘要: 【目的】探究黄瓜CsMADS08基因及其下游调控基因的功能,为黄瓜新品种选育提供参考。【方法】以拟南芥agl8纯合突变体为材料,农杆菌介导法导入黄瓜CsMADS08基因,经筛选获得转CsMADS08抗性植株,比较agl8突变体植株、转CsMADS08植株及野生型拟南芥植株的表型变化,观察不同类型植株茎生叶的显微结构,并用实时荧光定量PCR方法分析CsMADS08及其下游调控基因SHP1、SHP2、ALC、IND在根、茎、莲座叶、茎生叶、花、果实中的表达情况。【结果】agl8突变体植株、转CsMADS08植株及野生型拟南芥根长、株高、莲座叶的数目及形状差异不明显;与野生型植株相比,agl8突变体植株抽薹及开花时间延迟,CsMADS08基因在agl8突变体植株花中的表达量无显著变化;而转CsMADS08植株抽薹及开花时间较agl8突变体植株提早4~6 d,且CsMADS08基因在花中表达量显著增加。野生型、agl8突变体及转CsMADS08拟南芥植株茎生叶数量、形状及侧枝数、果实均有明显差异,其中转CsMADS08植株叶片小而密集,形状接近圆形,果荚长且饱满,无提前开裂现象。茎生叶显微观察结果显示,与野生型植株相比,转CsMADS08植株叶片细胞变大,排列整齐,维管束细胞增加,叶片变厚。实时荧光定量PCR检测结果显示,CsMADS08基因在转CsMADS08植株各组织中均有表达,且在茎生叶中表达量最高;与agl8突变体植株相比,SHP1、SHP2、ALC、IND基因只在转CsMADS08植株花中上调表达,而在其他组织中均下调表达,且在茎生叶中降幅最大。【结论】CsMADS08基因具有促进开花、增加侧枝、调控叶片形态及果实发育等的功能。
    • 王艳玮; 曾凡云; 漆艳香; 丁兆建; 谢艺贤; 张欣; 彭军
    • 摘要: 香蕉枯萎病是由尖孢镰刀菌古巴专化型(Fusarium oxysporum f.sp.cubense,Foc)引起的香蕉毁灭性土传病害,其中4号生理小种(Foc4)能感染几乎所有的香蕉品系,危害最严重。本研究克隆鉴定Foc4比卡菌素聚酮合酶编码基因(bikaverin PKS-encoding gene,Bik1)Foc4Bik1,编码一个由2036个氨基酸组成的多功能酶,具有I型PKS聚酮合酶的保守结构域,包含酰基转移酶功能域[acyl-carrier protein(ACP)transacylase,SAT],β-酮脂酰合成酶功能域(β-ketoacyl synthase,KS),丙二酰酰基转移酶功能域(acyltransferase,AT),脱氢酶(dehydratase,DH)以及硫酯酶(thioesterase,TE)等多个保守蛋白结构域。采用Split-marker同源重组技术获得基因敲除突变体ΔFoc4Bik1,通过比较突变体和野生菌株生长速度、产孢量、致病力等差异,证明ΔFoc4Bik1突变体仅影响次生代谢产物比卡菌素的生物合成,不影响病原菌的其他生理表型及致病力;其次,ΔFoc4Bik1突变体摇培后菌液呈白色,与野生型Foc4的暗红色形成鲜明对比,说明Foc4Bik1基因符合作为内源报告基因的条件。本研究以Foc4Bik1为内源靶标基因,利用水稻恶苗病菌(F.fujikuroi)的基因编辑载体pUC-fFuCas9-HTBNLS-hph,尝试以质粒体内表达Cas9和sgRNA的方式探索Foc4中CRISPR/Cas9编辑的可行性。gRNA序列由在线网站设计,构建的sgRNA162导入质粒构建靶向Foc4Bik1的pUC-fFuCas9-HTBNLS-hph-Foc4Bik1基因编辑载体,与供体质粒pUC19-Foc4Bik1-HDR一起导入原生质体通过同源重组修复(homology directed repair,HDR)的方式进行基因编辑。经过潮霉素抗性筛选获得的ΔFoc4Bik1(HDR)基因编辑后的敲除转化子进行PCR检测和摇培,白色菌液表型与PCR检测阳性的敲除转化子相互对应,证实了Foc4基因编辑的可行性。此外,Foc4Bik1可作为香蕉枯萎菌Foc4内源报告基因并评估探索新的分子生物学技术在香蕉枯萎菌上应用的可能性。
    • 杨淳; 李晓瑞; 吴亦丁; 吴舒瑶; Xu Ping; 明凤
    • 摘要: 月季被誉为“花中皇后”,在城市绿化、园林景观等应用中有着重要的作用。白粉病是月季生产中的第一大病害,严重影响月季观赏价值和经济价值。笔者以6个月季品种为研究对象,对其抗白粉病特性进行比较、评价和分析,为月季白粉病抗性品种的选育提供一定的参考。综合6个月季品种在白粉病菌侵染后的表型,DAB、NBT和台盼蓝染色情况,抗病相关基因表达量以及考马斯亮蓝R-250染色分析,表明:‘男爵’‘艾弗的玫瑰’‘诺瓦利斯’可能是通过NPR1介导的信号途径诱导RcPR1基因的表达来实现对白粉病菌不同程度上的抗性;‘月月粉’对白粉病菌表现出易感性;‘安吉拉’和‘蓝色风暴’对白粉病有较强的抗性,这两个品种的抗病机理又存在一定差异;‘安吉拉’叶片表面白粉病菌很难附着、萌发,说明其可能主要通过叶片表面物理或化学的防御机制抵御白粉病菌的入侵;‘蓝色风暴’可能通过SA抗病防卫基本信号通路上游的调控来保证其抗性。
    • 王梓阳; 杨林; 王嘉阳; 李姣
    • 摘要: 目的:对基于电子病历的表型分析流程、主要方法、应用现状进行总结梳理,为后续相关研究提供借鉴。方法:通过关键词检索、参考文献回溯等方法在PubMed数据库中检索并经人工筛选后获得53篇文献,在此基础上总结了表型分析的一般流程,对表型定义及表型算法开发、验证和共享进行了综述,最后归纳了表型分析在临床研究中的应用现状。结果:表型分析的数据来源丰富,包括开放医学资源、结构化和非结构化电子病历数据等,表型算法开发的方法逐渐从基于规则开发向无监督学习开发转变,但目前电子病历数据的利用仍有很多挑战和困难有待解决。结论:今后应继续致力于提高数据的可信度,增加数据来源和种类以提升表型算法的效果,同时还应加强表型分析相关研究的共享和传播、扩大表型分析在临床研究中的应用。
    • 吴阳; 陈曦; 谭飞
    • 摘要: 精准水肥灌溉是设施农业的重要组成部分,由于不同品种的作物对水肥需求不同,以及同种作物处于不同生长期时的需求也不同,精准水肥灌溉结合作物的自身生长状况及生长环境参数,通过模型耦合作物与环境信息,智能决策作物的需求状况。文章介绍了精准水肥灌溉技术的相关概念,分析了实行精准灌溉的必要性,并从灌溉系统、营养液调配策略、基于作物需水量计算和基于作物表型分析两种方式的灌溉策略等方面分析了研究现状,指出了现阶段研究的不足。建立了水肥灌溉量与作物动态表型和环境参数的关系预测模型,展望了建立精准灌溉决策系统的两阶段。
    • 朱怡航; 张小斌; 沈颖越; 顾清; 金群力; 郑可锋
    • 摘要: 金针菇Flammulina filiformis作为国内产销量大、工厂化生产程度高的食用菌种类之一,其育种工作因表型信息采集效率低下而受到限制.本研究以金针菇子实体可见光图像为信息来源,基于育种工作对表型信息的需求,利用图像识别技术和深度学习模型,提出了金针菇高通量表型信息采集分析方法,并开发了相应分析系统软件.利用该套方法结合金针菇子实体的可见光扫描图像,可以自动化大批量计算金针菇子实体的菌盖形状、面积、着生位置、颜色和菌柄长度、宽度、颜色等表型信息.本研究提出的金针菇表型采集与分析方法操作便捷,能大幅减少观测误差,提高表型信息可靠性,提升育种工作效率,可一定程度上应用于其他外形相近的食用菌或作物育种工作;同时获得的数据有助于金针菇表型信息的定量化分析和标准化表型数据集的建立.
    • 李昂; 王辉; 邵玉乐; 许曼; 张子博; 田璐; 史鑫琪; 孟庆文; 陈洪岩
    • 摘要: TRIM30α作为TRIM蛋白家族成员,在天然免疫系统中发挥重要作用.为了研究TRIM30α基因的特性及功能,本研究在小鼠TRIM30α基因第一段编码区选择一段作为靶序列,合成了2条sgRNA,构建了重组质粒pUC19-TRIM30α-sgRNA1/2并体外转录后分别与体外转录并加poly(A)尾的pT7-SpCas9-SV40混合后经显微注射至C57BL/6近交系小鼠的受精卵中,获得第一代(F0代)TRIM30α基因敲除的小鼠并经PCR鉴定.将其与野生型(WT)小鼠合笼繁育出TRIM30α+/-小鼠(F1代),经PCR鉴定后再通过全同胞交配的方式获得TRIM30α基因敲除的纯合子(TRIM30α-/-)小鼠(F2代).通过PCR和测序在DNA水平鉴定TRIM30α-/-小鼠各组织(心、肝、脾、肺、肾、脑、肌肉)TRIM30α基因的敲除情况;经RT-PCR检测TRIM30α-/-小鼠上述各组织TRIM30α基因mRNA的转录水平;利用PCR分别扩增小鼠中的3个高频脱靶位点(Trim30d、D6WSu163e、Sbk1)后经T7E1酶切检测TRIM30α-/-小鼠的脱靶效应.结果显示,分别获得了缺失了4 bp和7 bp片段的两种TRIM30α基因缺失的F0代小鼠(TRIM30α+/-),选择缺失7 bp的TRIM30α+/-小鼠繁育获得F1、F2代小鼠.PCR鉴定结果显示,共获得了7只TRIM30α-/-纯合子小鼠;从DNA水平和mRNA转录水平鉴定结果显示,TRIM30α-/-小鼠各组织的基因组DNA扩增条带均小于WT小鼠的扩增条带;且其体内未检测到TRIM30α基因的mRNA;TRIM30α-/-小鼠体内也未检测到其他位点的脱靶编辑;TRIM30α-/-小鼠的生长发育、血常规、血生化指标与WT小鼠相比均无显著差异.以上结果表明TRIM30α-/-小鼠模型构建成功.本研究为探究DNA病毒介导的天然免疫应答中TRIM30α所发挥的作用提供了实验材料和研究依据.
    • 李佳皓; 谢敏秋; 万传银; 左瑞洁; 鲁黎明; 李立芹
    • 摘要: 初探StTCP13基因在盐胁迫方面的功能,为StTCP13在马铃薯非生物逆境响应的功能研究奠定基础.采用同源克隆策略获得StTCP13基因编码区全长,利用生物信息学分析蛋白结构域并构建系统进化树,qRT-PCR技术分析该基因表达模式,双酶切法构建StTCP13-pGEX6P1原核表达载体,利用大肠杆菌BL21表达StTCP13-GST标签融合蛋白,观察转StTCP13大肠杆菌BL21在盐胁迫培养基上的表型.结果显示,从马铃薯品种费乌瑞它中克隆得到了StTCP13基因,成功构建了StTCP13-GST标签融合蛋白的pGEX-6P-1原核表达载体,并在大肠杆菌BL21中诱导表达了目的蛋白.生物信息学分析结果表明,该基因CDS全长669 bp,编码一个由222个氨基酸组成的蛋白质,该蛋白质含有1个保守的TCP结构域,融合蛋白大小约为51 ku.系统进化树结果显示,马铃薯StTCP13与潘那利番茄SpTCP13、甜椒CaTCP13亲缘关系较近.表达分析结果显示,该基因在根中表达量最高,在芽眼中表达量最低,其表达受高盐胁迫诱导.盐胁迫表型分析结果表明,StTCP13能提高大肠杆菌对高盐胁迫的耐受性.综上,说明StTCP13在响应盐胁迫逆境中发挥一定功能.
    • 张晶; 陆俊宇; 闫学德; 苏凯; 曹冬梅; 章卫平
    • 摘要: 目的:探讨小肠上皮细胞中转录因子碳水化合物反应元件结合蛋白(ChREBP)在果糖耐受中的作用.方法:利用Cre/loxP系统,构建了ChREBP基因的肠道特异性敲除(ChGO)小鼠模型,并利用RT-qPCR、Western blot和免疫组化等技术,在基因组、mRNA和蛋白水平对该模型的基因敲除效率和组织特异性进行了鉴定分析.结果:表型分析显示,高果糖饮食可导致ChREBP敲除小鼠出现体重降低、摄食量减少和严重肠胀气等果糖不耐受的表现.机制研究发现ChREBP-β和Max样蛋白X(Mlx)可以协同促进小肠上皮细胞果糖特异性转运子葡萄糖转运蛋白5(GLUT5)编码基因Slc2a5的转录,而ChREBP缺陷导致高果糖饮食对Slc2a5基因的转录激活作用丧失.结论:ChREBP是果糖激活小肠上皮细胞Slc2a5基因转录所必需的转录因子,对维持机体的果糖耐受性至关重要.
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