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WRKY转录因子

WRKY转录因子的相关文献在2003年到2022年内共计209篇,主要集中在农作物、分子生物学、园艺 等领域,其中期刊论文159篇、会议论文2篇、专利文献21489篇;相关期刊83种,包括生物技术通报、西北植物学报、农业生物技术学报等; 相关会议2种,包括全国西瓜甜瓜科研学术研讨会、2018湖南茶业科技创新论坛等;WRKY转录因子的相关文献由868位作者贡献,包括刘迪秋、葛锋、王自娥等。

WRKY转录因子—发文量

期刊论文>

论文:159 占比:0.73%

会议论文>

论文:2 占比:0.01%

专利文献>

论文:21489 占比:99.26%

总计:21650篇

WRKY转录因子—发文趋势图

WRKY转录因子

-研究学者

  • 刘迪秋
  • 葛锋
  • 王自娥
  • 李珊
  • 郑锂蕾
  • 陈虹均
  • 普丽梅
  • 丁博
  • 李明
  • 王海华
  • 期刊论文
  • 会议论文
  • 专利文献

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排序:

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    • 刘子刚; 田佩耕; 王宁; 翟鑫娜; 张云帅; 刘毅强; 武佳颖; 田再民; 魏东
    • 摘要: 【目的】探明马铃薯StWRKY转录因子的生物信息学特征及其在不同组织、低温和盐胁迫下的表达模式,揭示StWRKY转录因子在逆境下的调控规律,为进一步研究此转录因子的功能奠定基础。【方法】本试验以冀张薯12号马铃薯组培苗为材料,从马铃薯中克隆获得StWRKY基因,并对其进行生物信息学分析和功能的初步研究。【结果】StWRKY基因长度为747 bp,由172个氨基酸编码而成,相对分子量19921.58,理论等电点9.22,带负电残基总数21,带正电残基总数28,不稳定系数40.56。该蛋白质二级结构以无规曲线为主占40.1%,α-螺旋为37.4%、伸展链为15.1%、β-折叠为7.6%,是不稳定蛋白,属于亲水蛋白。通过进化树分析,与番茄同源性最高,为97.1%;利用RT-qPCR分析表明,表达谱分析中StWRKY基因的表达量在叶片中最高;功能初步分析,StWRKY基因的表达量在经过低温胁迫和盐胁迫处理6和7 h表达量显著增加,说明可能参与马铃薯对盐胁迫和低温的响应路径。【结论】StWRKY能够不同程度响应盐胁迫和低温胁迫,说明在马铃薯逆境反应机制中发挥不同作用,初步揭示了马铃薯StWRKY转录因子的功能,为进一步研究其功能提供依据。
    • 朱峥; 王田幸子; 陈悦; 刘玉晴; 燕高伟; 徐珊; 马金姣; 窦世娟; 李莉云; 刘国振
    • 摘要: 白叶枯病是一种严重影响水稻产量的细菌性病害。Xa21是第一个克隆的抗白叶枯病基因,具有广谱抗性,在水稻抗病育种中被广泛应用。转录因子的鉴定对解析Xa21介导的水稻抗白叶枯病分子机制具有重要意义。本研究构建了Xa21背景下的WRKY68-RNAi转基因水稻。与受体材料4021相比,转基因水稻中WRKY68蛋白质丰度下调,接种白叶枯病菌(Xanthomonas oryzae pv.oryzae,Xoo)后抗病性下降,证明WRKY68基因在Xa21介导的抗白叶枯病反应中发挥正调控作用。此外,转基因受体材料4021和感病对照TP309接种后不同时期和部位叶片中WRKY68的蛋白质丰度没有显著差异,表明WRKY68蛋白质的表达不受抗病基因Xa21和病原物Xoo诱导,推测其功能主要是调控下游基因的表达。WRKY68-RNAi转基因水稻接种后,PR1A、PR5、PR10A、PR-pha和PAL1等病程相关蛋白质表达丰度发生变化,表明相关基因可能在WRKY68基因的调控下参与下游抗病反应。
    • 乔刚; 李莉; 姜山
    • 摘要: WRKY作为最先在植物中发现的转录因子,在植物生长发育等过程中发挥重要作用。为了更好地研究小立碗藓WRKY蛋白的结构与功能,该文以Pfam数据库中WRKY基因家族数据(登录号为PF03106)为材料,分析了小立碗藓(Physcomitrella patens)WRKY基因家族成员的理化性质、蛋白质的二级结构预测、染色体定位、内外显子分布及系统进化关系。结果表明:(1)小立碗藓WRKY基因家族成员共有38个基因,根据WRKY保守结构域个数和锌指结构类型分成Ⅰ、Ⅱ两大类,不含第Ⅲ类(锌指结构为C2HC型),其中部分基因WRKY保守结构域发生变异。(2)WRKY蛋白氨基酸长度在216~775 aa之间、相对分子质量在24.5~82.8 kDa之间,亚细胞定位显示WRKY家族成员蛋白质定位于细胞核中。(3)WRKY蛋白的二级结构以α-螺旋、延伸链、β-转角、无规卷曲四种构成元件构成,除PpWRKY11(α-螺旋为主)外,其余无规卷曲占比高达70%。(4)与拟南芥的系统进化关系表明,植物在进化过程中WRKY家族成员的数目与进化方式发生改变,WRKY基因家族成员外显子的个数为3~7个。(5)小立碗藓WRKY基因家族成员无规则分散于21条染色体上,并未形成基因簇。该研究通过分析WRKY基因家族的基本结构与性质,能为后续深入研究WRKY转录因子的功能奠定基础。
    • 张苗; 周生财; 吴梦洁; 童再康; 韩潇; 张俊红; 程龙军
    • 摘要: 【目的】在闽楠全基因组范围内鉴定WRKY家族成员,分析基因和蛋白序列结构特点及在闽楠幼苗缺磷胁迫下的表达特征,筛选响应缺磷逆境的WRKY基因,为进一步研究它们在楠木磷饥饿响应分子途径中的功能以及耐低磷胁迫分子辅助育种提供参考。【方法】利用WRKY蛋白序列的隐马尔科夫模型(pfam03106),经hmmsearch在闽楠蛋白数据库中检索,筛选WRKY基因。对获得的PbWRKYs利用Protaram、GSDS2.0、MEGA、Batch CD-Search、TBtools和ClustalX等软件进行基因结构、定位分析,蛋白理化性质、序列特征分析以及进化树构建。提取3年生闽楠植株的根、韧皮部和形成层、木质部和叶的RNA,进行转录组测序,分析PbWRKYs在不同组织中的表达特点。对半年生闽楠植株进行缺磷水培处理,60天后,分别取缺磷处理和对照的叶和根进行磷含量测定和转录组测序,分析磷缺乏条件下PbWRKYs表达特征,并对差异表达基因进行qPCR验证。【结果】鉴定到68个WRKY基因,命名为PbWRKY1-68,在各染色体上均有分布,第3号染色体上数量最多,内含子数目在1~28个之间,蛋白分子质量在19.09~115.56 kDa之间。所有PbWRKY均含有WRKY结构域及其特有的锌指结构。根据WRKY结构域数量及其所含锌指结构类型,分为3个亚类:亚类Ⅰ含2个WRKY结构域,锌指结构类型为C2H2型,共14个成员;亚类Ⅱ含1个WRKY结构域和1个C2H2型锌指结构,共47个成员,进化分析表明该亚类又分为5个经典子组Ⅱa、Ⅱb、Ⅱc、Ⅱd、Ⅱe,但其中PbWRKY37与上述子组进化上距离较远,独立成组;亚类Ⅲ含1个WRKY结构域和1个C2HC型锌指结构,共7个成员。PbWRKYs蛋白所含WRKY结构域氨基酸序列特征大部分为“WRKYGQK”型,但PbWRKY62的WRKY结构域变异为“WRKYGKK”。与其他植物相比,PbWRKYs蛋白中WRKY结构域的变异率较低。PbWRKYs的组织特异性表达模式可分为5类:韧皮部和形成层中相对表达量较低;木质部中表达量高而叶片中表达量较低;韧皮部和形成层表达量较高同时叶片中表达量较低;根中表达量相对较高;叶片中表达量高而根中表达量低。闽楠幼苗缺磷处理60天后,叶和根中表达差异达到2倍以上的PbWRKY基因共21个。它们在叶片中被强烈诱导,可能参与低磷条件下叶片中磷元素的运输及再分配过程;其中,PbWRKY52、PbWRKY55、PbWRKY56、PbWRKY65和PbWRKY665个基因的表达还在根中被抑制,表明它们除了参与低磷条件下叶片中磷元素再分配,还可能参与了根部磷的吸收和转运。【结论】闽楠中WRKY基因家族成员共有68个,其蛋白序列中WRKY结构域较保守。缺磷处理60天时,有21个PbWRKY基因参与磷胁迫响应,大部分基因可能主要在叶片中参与低磷条件下磷的运输和分配。PbWRKY52、PbWRKY55、PbWRKY56、PbWRKY65和PbWRKY66除了在叶片中发挥功能外,还可能参与低磷条件下根部对磷的吸收和转运。
    • 王东姣; 张畅; 阙蓓蓓; 尤垂淮; 罗俊; 苏亚春
    • 摘要: 从甘蔗栽培种R570基因组数据库中挖掘到60个ShWRKY(ShWRKY1~ShWRKY600)基因,分布于10条染色体上,每条染色体上有3~13个ShWRKY基因.系统进化树分析表明60个ShWRKY蛋白中,属于Ⅰ、Ⅱ和Ⅲ类的分别有10、32和18个.所有ShWRKY家族成员皆为亲水性核定位蛋白,且除ShWRKY13为稳定蛋白外,其余家族成员都不稳定.ShWRKY基因家族的外显子数目为1~5个,保守基序数目为3~7个.启动子区域序列预测显示,ShWRKY基因包含多个与胁迫、生长发育和激素响应相关的顺式作用元件.表达谱分析显示,ShWRKY基因在甘蔗不同组织中差异表达,且参与对黑穗病菌胁迫的响应过程.RT-qPCR检测结果显示,接种黑穗病菌7 d后,ShWRKY37基因在2个甘蔗抗病品种和1个感病品种中上调表达,而在另外1个感病品种中下调表达;ShWRKY51基因则在抗病品种中下调表达,而在感病品种应答早期(1 d)上调表达.
    • 丁祥青; 胡敏杰; 向双; 赖兴凯; 乐易迅; 刘仲健; 邹双全
    • 摘要: WRKY蛋白在植物胁迫响应和应答过程中发挥着重要作用。秋茄生长环境恶劣,生存压力使其进化出极强的胁迫响应能力,对各种胁迫的响应是决定秋茄逆境生存的重要因素。目前,关于秋茄WRKY基因家族的研究报道较少。对秋茄WRKY基因家族进行全面的研究,共鉴定出71个KcWRKY基因。结构域分析和进化分析结果表明,KcWRKY基因高度保守且分为3组。保守基序分析结果表明,同组的KcWRKY基因基序分布一致而组间差异显著,说明同组的KcWRKY基因可能具有相似的功能。染色体定位和复制关系表明,71个KcWRKY基因不均匀分布在秋茄基因组18条染色体上,存在4对串联重复基因和大量片段复制基因,这些基因可能在秋茄胁迫响应进化历程中发挥了重要作用。根据KcWRKY基因在不同器官的表达模式推测KcWRKY71参与调节编码线粒体和叶绿体蛋白的胁迫响应,KcWRKY66参与秋茄叶和果衰老的调节。本研究揭示了秋茄WRKY转录因子的基本结构与性质,研究结果能为后续深入研究秋茄WRKY转录因子的功能奠定基础。
    • 尹梦莹; 蔚亚楠; 杜光辉; 桂敏; 黎志彬; 鲍锐; 龚亚菊; 吴丽艳
    • 摘要: 【目的】克隆蒜芥茄WRKY1基因(SsWRKY1),并分析其在黄萎病病原菌胁迫下的表达模式,为探究WRKY1基因在野生蒜芥茄黄萎病抗性中的调控机制提供理论参考。【方法】利用染色体步移技术克隆SsWRKY1基因,通过在线生物信息学软件进行序列分析及构建系统发育进化树;采用GFP融合蛋白表达法对WRKY1蛋白进行亚细胞定位,利用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)检测SsWRKY1基因在不同组织及接种黄萎病病原菌后不同时间的相对表达量。并分析9种野生茄材料接种黄萎病病原菌后的病情指数与WRKY1基因表达变化量的相关性。【结果】克隆获得的SsWRKY1基因(GenBank登录号MZ846202)ORF序列长度为1224 bp,编码407个氨基酸残基,蛋白相对分子量为44.87 kD,理论等电点(p I)为6.91,属于亲水性不稳定蛋白,亚细胞定位于细胞核,符合转录因子特征。SsWRKY1蛋白含有2个WRKY保守结构域和C2H2型锌指结构,属于Ⅰ类WRKY转录因子,其二级结构主要由α-螺旋(7.13%)、β-折叠(4.67%)、无规则卷曲(73.71%)和延伸链(14.50%)组成。SsWRKY1蛋白与番茄、野生潘那利番茄、野生番茄、马铃薯WRKY1蛋白的亲缘关系较近。SsWRKY1基因在根和茎的相对表达量显著高于叶中的相对表达量(P<0.05,下同)。黄萎病病原菌接种后不同时间,SsWRKY1基因的相对表达量均低于对照组(无菌水接种),但仅在24 h时二者差异达显著水平。9种野生茄材料接种黄萎病病原菌后的病情指数与接种前后WRKY1基因表达变化量间呈显著正相关。【结论】SsWRKY1属于第Ⅰ类WRKY转录因子,序列高度保守,在细胞核中表达,其基因具有组织表达特异性,黄萎病菌胁迫后该基因的表达下调,推测WRKY1在野生茄黄萎病抗性中起负调控作用。
    • 韩立军; 刘宝玲; 李润植; 薛金爱
    • 摘要: WRKY转录因子参与植物生长发育以及胁迫响应等生命活动的调控。尽管棉花GhWRKY的研究已有报道,但有关GhWRKYⅠ亚家族成员的功能还知之甚少。研究聚焦陆地棉(Gossypium hirsutum)GhWRKYⅠ亚家族成员的全基因组鉴定,以期筛选到参与棉花种子萌发调控的GhWRKY成员;基于陆地棉基因组数据库,应用组学工具对陆地棉GhWRKYⅠ亚家族成员进行鉴定,分析基因结构、蛋白保守基序、保守结构域和蛋白理化性质以及进化关系;基于转录组数据分析GhWRKYⅠ成员在不同组织和5种非生物胁迫下的表达谱;定量PCR(qPCR)检测候选GhWRKY在发育种子的表达特性。结果表明,从陆地棉基因组共鉴定到35个GhWRKYⅠ亚家族基因,不均匀分布于A和D亚基因组的19条染色体上;GhWRKYⅠ蛋白由331~769个氨基酸组成,均为亲水性蛋白并定位于细胞核;GhWRKYⅠ亚家族基因具有3~6个外显子和2~5个内含子。GhWRKY3、GhWRKY6、GhWRKY7、GhWRKY11、GhWRKY12和GhWRKY15未检测到5'-UTR,其余29个GhWRKYⅠ亚家族基因则含有5'-UTR和3'-UTR。仅发现GhWRKY11蛋白C端WRKY保守结构域WRKYGQK序列突变为WRNYGQK,GhWRKYⅠ亚家族成员存在着3种不同的进化方向。转录组数据分析表明,GhWRKYⅠ家族成员在不同组织以及应对不同非生物胁迫呈现差异化表达模式。qPCR分析揭示,GhWRKY24在棉籽萌发72 h内持续上调表达,预示着GhWRKY24可能参与调控棉籽萌发过程。
    • 付家旭; 闫亚丽; 谢小文; 张心悦; 温鹏飞; 关小康; 王同朝; 卫丽
    • 摘要: 为了挖掘玉米抗旱相关WRKY转录因子,对干旱-复水处理下差异表达的玉米WRKY基因进行鉴定,并对其蛋白质理化性质、系统进化、染色体分布和复制关系、基因结构和蛋白质保守基序、启动子区顺式作用元件及干旱-复水条件下的表达量等进行分析。结果表明,共鉴定筛选出51个差异表达的玉米WRKY基因,编码氨基酸数目介于99~729个,分子质量介于11.22~78.73 ku,等电点介于4.58~12.26;WRKY基因分为Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ组,其中Ⅱ又分为Ⅱa、Ⅱb、Ⅱc、Ⅱd、Ⅱe 5个亚组;WRKY基因不均等分布在10条染色体上,存在2对串联复制和16对片段复制;外显子数目为1~12个,大部分WRKY基因(41个)含有2~4个保守基序,且同一组中的WRKY成员具有相似的基序组成;启动子区含有ABRE、AuxRR-core、TCA-element、TC-rich repeats、TGACG-motif、LTR、MBS、TATC-box、P-box、CGTCA-motif、GC-motif、TGA-element、GARE-motif等植物激素及非生物胁迫相关的顺式作用元件。干旱-复水处理下,51个玉米WRKY基因呈现出不同表达模式,其中ZmWRKY1、ZmWRKY10、ZmWRKY16、ZmWRKY28、ZmWRKY30、ZmWRKY33、ZmWRKY42、ZmWRKY65、ZmWRKY68、ZmWRKY78、ZmWRKY96、ZmWRKY99、ZmWRKY100、ZmWRKY102和ZmWRKY111等15个基因正向响应干旱胁迫,ZmWRKY87负向响应干旱胁迫,它们是今后深入研究玉米WRKY家族响应干旱的候选基因。
    • 易小哲; 王梦月; 邬兰; 刘霞; 刘佳伟; 农熠瑛; 陈士林; 师玉华
    • 摘要: 艾(Artemisia argyi)是常用的中草药和灸用原料植物,具有重要的药用和经济价值,然而其药用活性成分的合成调控研究鲜有报道。WRKY转录因子家族是植物中最大的转录因子家族之一,在植物生长发育、抗逆以及次生代谢合成调控等方面发挥重要作用。本研究基于转录组数据系统鉴定艾的WRKY家族转录因子,分析其蛋白理化性质、进化关系和保守基序等特性,并研究该家族基因在茉莉酸胁迫下的表达模式。实验结果表明,从转录组水平共鉴定到37个AarWRKY转录因子,其氨基酸数目为119-547个,分子量为13.4-59.8 kDa,理论等电点为4.86-10.03。根据拟南芥WRKY家族分类,34个AarWRKY蛋白归类在I、II、III三组,而3个蛋白未归类。AarWRKY蛋白均具有保守的WRKY结构域,且同一组蛋白具有相似的保守基序。基因表达谱分析以及利用qRT-PCR方法检测基因表达差异发现,外源茉莉酸甲酯处理后,6个AarWRKY基因的表达发生了显著差异,其中3个基因上调表达,3个基因下调表达。进一步蛋白互作网络预测发现这些差异表达的AarWRKY基因可能参与JA响应和萜类化合物的生物合成调控等途径。本研究为艾WRKY家族基因的功能研究及其在艾叶活性成分累积中的调控作用解析奠定基础。
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