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用于判断样本配对或污染的位点组合及其筛选方法和应用

摘要

本发明公开了用于判断样本是否配对和/或是否存在污染的位点及其筛选方法和应用。其中,所述筛选方法包括以下步骤:获得待判断样本来源物种的SNP位点数据;将获得的SNP位点进行HWE检验,筛选出HWE检验的SNP位点;筛选出符合以下条件的位点:①在至少20%的样本中检出该SNP位点对应的突变型;②在具有该SNP位点对应的突变型的样本中,至少70%的样本其突变频率分布于0.4至0.6之间。利用本发明的位点,即可用于判断样本的配对情况,又可用于判断疾病单样本的污染情况,从而可以实现疾病‑正常样本均受到污染时能够预测其污染情况的功能。

著录项

  • 公开/公告号CN115394357A

    专利类型发明专利

  • 公开/公告日2022-11-25

    原文格式PDF

  • 申请/专利权人 杭州链康医学检验实验室有限公司;

    申请/专利号CN202211064680.4

  • 申请日2022-09-01

  • 分类号G16B20/20;G16B20/50;G16B30/10;G16B40/00;

  • 代理机构杭州信与义专利代理有限公司;

  • 代理人万景旺

  • 地址 310018 浙江省杭州市杭州经济技术开发区白杨街道6号大街260号1幢2楼西

  • 入库时间 2023-06-19 17:45:13

法律信息

  • 法律状态公告日

    法律状态信息

    法律状态

  • 2022-11-25

    公开

    发明专利申请公布

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