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一种基于双向GRU和注意力机制的RNA二级结构预测算法

摘要

本发明涉及一种基于双向GRU和注意力机制的RNA二级结构预测算法,该方法首先获取到RNA二级结构数据集;然后进行数据预处理,即将RNA序列信息进行向量化,得到矩阵形式表示的特征信息,并按固定维度进行特征矩阵拼接;设计融合了加权向量、标志向量,在双向GRU神经网络的基础上,增加了注意力机制,增强了网络的预测能力;然后将特征矩阵输入到网络中对RNA二级结构进行预测,充分的利用了前后碱基的信息,预测结果较为准确,而且能够处理变长的RNA序列,同时,可以有效地处理正负样本不平衡的问题,有助于预测出更精准的RNA二级结构。

著录项

  • 公开/公告号CN114121149A

    专利类型发明专利

  • 公开/公告日2022-03-01

    原文格式PDF

  • 申请/专利权人 天津理工大学;

    申请/专利号CN202111450840.4

  • 发明设计人 陈宇;沈丛;肖峰;陈胜勇;

    申请日2021-12-01

  • 分类号G16B15/20(20190101);G06N3/04(20060101);G06N3/08(20060101);

  • 代理机构42276 湖北创融蓝图知识产权代理事务所(特殊普通合伙);

  • 代理人樊坤

  • 地址 300384 天津市西青区宾水西道391号天津理工大学

  • 入库时间 2023-06-19 14:19:02

法律信息

  • 法律状态公告日

    法律状态信息

    法律状态

  • 2022-03-01

    公开

    发明专利申请公布

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