基于NGS读段搜索实现序列延伸的虚拟PCR方法

摘要

本发明公开了一种基于NGS读段搜索实现序列延伸的虚拟PCR方法。该方法首先基于NGS测序技术对试验样品全基因组进行一次深度较高的高通量测序，获得覆盖全基因组的海量测序读段(reads)；再结合生物信息学方法，搜索测序读段，根据搜索结果在程序中实现序列延伸，从而建立序列片段重叠群(contig)，继而实现目的基因在虚拟程序中的扩增。该方法的扩增片段更长，远高于Wet Lab PCR中酶与反应体系的限制；扩增周期更短，通常只需要半天即可完成5k碱基的延伸；无需实际操作PCR实验，在程序中即可获得目的基因的序列信息，成本低；可一次性扩增几十甚至于几百条序列，效率高。