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T3DNA连接酶和T4RNA连接酶2在检测N

摘要

本发明公开了一种连接酶在检测N

著录项

  • 公开/公告号CN106755306A

    专利类型发明专利

  • 公开/公告日2017-05-31

    原文格式PDF

  • 申请/专利权人 陕西师范大学;

    申请/专利号CN201611020857.5

  • 发明设计人 李正平;严景丽;刘伟亮;

    申请日2016-11-21

  • 分类号C12Q1/68;C12Q1/25;

  • 代理机构西安永生专利代理有限责任公司;

  • 代理人高雪霞

  • 地址 710062 陕西省西安市长安南路199号

  • 入库时间 2023-06-19 02:23:20

法律信息

  • 法律状态公告日

    法律状态信息

    法律状态

  • 2019-08-20

    授权

    授权

  • 2017-06-23

    实质审查的生效 IPC(主分类):C12Q1/68 申请日:20161121

    实质审查的生效

  • 2017-05-31

    公开

    公开

说明书

技术领域

本发明属于生物分析技术领域,具体涉及两种对N6甲基腺嘌呤(m6A)敏感的连接酶,以及基于该连接酶建立的连接-聚合酶链式反应定量检测RNA中m6A百分比含量的方法。

背景技术

随着抗体-高通量测序方法的发展,科学家揭示了m6A在生物体内重要的生物功能,然而m6A的作用机制还不是很清楚。为了更好的研究m6A的作用机制,建立简便、快速、灵敏、具有单碱基分辨率的特定位点m6A分析检测方法具有重要的意义。

由于m6A和腺嘌呤(A)具有相似的化学结构,精确定位m6A的位点具有挑战性。目前存在的m6A的分析方法大部分是高通量测序法,这些方法大部分只能给出m6A在RNA上的大概位置,而不能给出m6A的精确位点。特异位点裂解-同位素标记-连接辅助的薄层色谱法(SCARLET)的发现,使得特定位点的m6A的定位分析变为现实,然而此方法不仅过程复杂,耗时长,还用到了同位素,使得它的应用受到了限制。2007年,科学家发现相比A,m6A对G有一定的识别能力,如果m6A的识别序列对应的碱基为G时可以在一定程度上抑制T4>

发明内容

本发明所要解决的技术问题在于为T3 DNA连接酶和T4 RNA连接酶2提供一种在RNA上m6A百分比含量的定量分析中的新应用。

解决上述技术问题所采用的技术方案由下述步骤组成:

1、根据含有待测位点的RNA序列设计合成左探针、右探针,其中左探针是DNA探针,其从5′端到3′端依次为检测识别区、PCR引物区,且其序列的5′端修饰磷酸基团,右探针是DNA探针,其从5′端到3′端依次为PCR引物区、检测识别区,所述左探针和右探针的检测识别区是与含有待测位点的RNA序列互补的8~40个碱基序列。

2、将步骤1左探针、右探针的检测识别区与含有待测位点的RNA序列杂交,然后加入连接酶进行连接反应。

3、以步骤2的连接产物为模板进行聚合酶链式反应,并加入SUPER Green I荧光染料,实时检测荧光信号,根据实时荧光曲线计算出待测位点A的含量。

4、在待测位点附近选择一个不含m6A的位点作为参比位点,根据含有参比位点的RNA序列按照步骤1设计合成左探针、右探针。

5、将步骤4左探针、右探针的检测识别区与含有参比位点的RNA杂交,然后通过连接酶将左探针和右探针连接起来。

6、以步骤5的连接产物为模板进行聚合酶链式反应,并加入SUPER Green I荧光染料,实时检测荧光信号,根据实时荧光曲线计算出参比位点A的含量。

7、根据步骤6计算出的参比位点A的含量减去步骤3计算出的待测位点A的含量,得到待测位点m6A的含量,待测位点m6A的含量除以待测位点A和m6A的总和,就得到m6A的百分比含量。

上述步骤1和4中,优选右探针是3′端修饰两个RNA碱基的DNA探针。

上述步骤1和4中,进一步优选左探针和右探针的检测识别区是与含有待测位点的RNA序列互补的10~20个碱基序列。

本发明首次发现T3 DNA连接酶和T4 RNA连接酶2对m6A敏感,与A相比,m6A可以抑制T3>6A的RNA)为模板,建立了基于连接-聚合酶链式反应定量测定m6A百分比含量的方法。该方法首先确定RNA上的待测位点(待测位点是腺嘌呤,可能含有部分N6甲基腺嘌呤,当待测位点是m6A时,连接酶T3>6A的A位点作为参比位点,用相应的标准曲线定量该参比位点A的含量,然后用参比为点A的含量减去待测位点A的含量得到待测位点m6A的含量,用待测位点m6A的含量除以待测位点A和m6A的总和,即可得到该待测位点m6A的百分比含量。

本发明操作简单、灵敏度高、特异性好,能够用于信使RNA(mRNA),长非编码RNA(lncRNA),核糖体RNA(rRNA),转运RNA(tRNA)和小RNA(microRNA)等RNA中的m6A的百分比含量测定,为m6A生物功能的研究和其在癌症中作用的研究提供了新的方法。

附图说明

图1是实施例1中基于连接-聚合酶链式反应定量检测MALAT1 2577位点m6A百分比含量的原理示意图。

图2是实施例1中不同浓度的RNA2577-A及85ng>+RNA的MALAT1>

图3是实施例1中CT值随着RNA2577-A浓度变化的标准曲线图。

图4是实施例1中不同浓度RNA2488-A及85ng>+RNA的MALAT1>

图5是实施例1中CT值随着RNA2488-A浓度变化的标准曲线图。

图6是实施例2中不同浓度RNA2577-A及106ng HCT116poly>+RNA的MALAT1>

图7是实施例2中CT值随着RNA2577-A浓度变化的标准曲线图。

图8是实施例2中不同浓度RNA2488-A及106ng HCT116poly>+RNA的MALAT1>

图9是实施例2中CT值随着RNA2488-A浓度变化的标准曲线图。

图10是用连接酶区分A和m6A的原理示意图。

图11是相同浓度的RNA2577-A和RNA2577-m6A荧光强度随着循环次数变化的实时荧光曲线图。

图12是基于相同浓度的RNA2577-A和RNA2577-m6A产生的PCR聚合产物的凝胶电泳图。

图13是相同浓度的RNA2577-A和RNA2577-m6A荧光强度随着循环次数变化的实时荧光曲线图。

图14是基于相同浓度的RNA2577-A和RNA2577-m6A产生的PCR聚合产物的凝胶电泳图。

图15是相同浓度的RNA2577-A和RNA2577-m6A荧光强度随着循环次数变化的实时荧光曲线图。

图16是基于相同浓度的RNA2577-A和RNA2577-m6A产生的PCR聚合产物的凝胶电泳图。

图17是相同浓度的RNA2577-A和RNA2577-m6A荧光强度随着循环次数变化的实时荧光曲线图。

图18是基于相同浓度的RNA2577-A和RNA2577-m6A产生的PCR聚合产物的凝胶电泳图。

具体实施方式

下面结合附图和实施例对本发明进一步详细说明,但本发明的保护范围不仅限于这些实施例。

实施例1

T3 DNA连接酶在检测HeLa细胞中长非编码RNA(lncRNA,MALAT1)2577位点m6A含量的应用,检测原理如图1所示,具体检测方法如下:

1、根据含有MALAT1的2577位点的RNA序列(RNA2577-A)5'-CUUAAUGUUUUUGCAUUGGACUUUGAGUUAAGAUUAUUUUUUAAAUCCUGAGGACUAGCAUUAAUUGAC-3'(画下划线的碱基是2577位点,在HeLa细胞中MALAT1的2577位点一部分是A,一部分为m6A)设计合成左探针(LigaseL2)和右探针(Ligase>4CCAATGCAAAAA-3'(画下划线的部分为检测识别区、斜体部分为PCR引物区,由宝生物工程(大连)有限公司提供),Ligase R2的碱基序列为5'-CTTAACTCAAArGrU-3'(画下划线的部分为检测识别区、斜体部分为PCR引物区,由宝生物工程(大连)有限公司提供)。

2、在200μL离心管中加入1.0μL水、1.0μL 200 nM Ligase L2水溶液和1.0μL200nM Ligase R2水溶液、1.0μL 5×的T3 DNA连接酶反应缓冲溶液(330mM Tris-HCl、50mMMgCl2、5>+RNA水溶液(同时作空白对比实验,空白是加入1.0μL水来代替RNA2577-A),混合均匀,作为溶液A。在200μL离心管中加入3.9μL水、1.0μL>2、5mM二硫苏糖醇、5mM腺嘌呤核苷三磷酸,pH=7.6,25℃)、0.1μL>

3、取步骤2中2.0μL连接反应产物加入到8.0μL聚合酶链式反应(PCR)混合溶液中,其中PCR反应混合溶液由5.2μL灭菌水、0.2μL 2.5unit/μL JumpStartTM>TM>2,0.01%(w/v)明胶)、1.0μL>T值(每个反应管内的荧光信号到达设定的域值时所经历的循环数)与RNA2577-A浓度对数值的线性关系曲线,结果如图3所示,并由此曲线公式计算出HeLa细胞中MALAT1的2577位点A的量。

从图2可以看出,随着RNA2577-A浓度的增加PCR反应速度逐渐加快,也就是说随着RNA2577-A浓度的增加,基于连接反应产生的PCR聚合产物越多,且不同浓度梯度之间可以相互区分,同时,从图3可以看出,CT值与RNA2577-A浓度的对数值呈现良好的线性关系,线性相关方程式为CT=-8.65-3.07lgCRNA2577-A,相关系数R2=0.998。据此线性相关方程可以计算出85ng>+RNA中MALAT1的2577位点A的量为0.721amol。

4、在MALAT1的2577位点附近选择一个不含m6A的2488A位点作为参比位点,根据含有MALAT1的2488位点的RNA序列(RNA2488-A)5'-UAGAAGAAUUUGGAAGGCCUUAAAUAUAGUAGCUUAGUUUGAAAAAUGUGAAGG-3'(画下划线的碱基是2488位点,此碱基只能为A)设计合成左探针(Ligase>4ATATTTAAGG-3'(画下划线的部分为检测识别区、斜体部分为PCR引物区,由宝生物工程(大连)有限公司提供);Ligase R1的碱基序列为5'-AACTAAGCTArCrU-3'(画下划线的部分为检测识别区、斜体部分为PCR引物区,由宝生物工程(大连)有限公司提供)。

5、在200μL离心管中加入1.0μL水、1.0μL 200nM Ligase L1水溶液和1.0μL 200nMLigase R1水溶液、1μL5×的T3 DNA连接酶反应缓冲溶液(330mM Tris-HCl、50mM MgCl2、5mM二硫苏糖醇、5mM腺嘌呤核苷三磷酸、37.5%聚乙二醇PEG6000,pH=7.6,25℃)、1.0μL不同浓度RNA2488-A水溶液或1.0μL>+RNA水溶液(同时作空白对比实验,空白是加入1.0μL水来代替RNA2488-A),混合均匀,作为溶液A′。在200μL离心管中加入3.9μL水、1μL>2、5mM二硫苏糖醇、5mM腺嘌呤核苷三磷酸,pH=7.6,25℃)、0.1μL>

6、取步骤5中2.0μL连接反应产物加入到8.0μL PCR反应混合溶液中进行PCR反应,其中PCR反应混合溶液与步骤3中相同,混合均匀后立刻放到Step One实时定量PCR系统中(Applied Biosystems,美国),在94℃下加热2min,然后进行45个热循环,每个热循环94℃20s、60℃30s;同步监测荧光信号,间隔1个循环采集一次实时荧光强度信号,结果如图4所示。根据RNA2488-A的实时荧光曲线,绘制检测RNA2488-A的CT值(每个反应管内的荧光信号到达设定的域值时所经历的循环数)与RNA2488-A浓度对数值的线性关系曲线,结果如图5所示,并由此曲线公式计算出HeLa细胞中MALAT1的2488位点A的量。

从图4中可以看出,随着RNA2488-A浓度的增加PCR反应速度逐渐加快,也就是说随着RNA2488-A浓度的增加,基于连接反应产生的PCR聚合产物越多,且不同浓度梯度之间可以相互区分,同时,从图5中可以看出,CT值与RNA2488-A的浓度的对数值呈现良好的线性关系,线性相关方程式为CT=-6.95-3.22lgCRNA2488-A,相关系数R2=0.997。据此线性相关方程可以计算出85ng>+RNA中MALAT1的2488位点含A的量为3.79amol。

7、根据步骤6计算出的HeLa>+RNA中MALAT1的2488位点A的含量(3.79amol)减去步骤3计算出的HeLa>+RNA中MALAT1的2577位点A的含量(0.721amol),得到2577位点m6A的含量为3.07amol,2577位点m6A的含量除以2577位点A和m6A的总和,得到HeLapoly>+RNA中MALAT1的m6A的百分比含量为80.9%。

实施例2

T3 DNA连接酶在检测HCT116细胞中长非编码RNA(lncRNA,MALAT1)2577位点m6A含量的应用,具体检测方法如下:

利用实施例1中针对RNA2577-A设计的探针Ligase L2和Ligase R2检测HCT116细胞中长非编码RNA(lncRNA,MALAT1)2577位点A含量,检测方法是用106ng/μL HCT116的polyA+RNA替代HeLa的poly>+RNA,其他实验步骤与实施例1相同,并分别测量其实时荧光曲线,检测结果如图6所示。根据RNA2577-A的实时荧光曲线,绘制检测RNA2577-A的CT值(每个反应管内的荧光信号到达设定的域值时所经历的循环数)与RNA2577-A浓度对数值的线性关系曲线,结果如图7所示,并由此曲线公式计算出HCT116细胞中MALAT1的2577位点腺嘌呤(A)的量。

从图6中可以看出,随着RNA2577-A浓度的增加PCR反应速度逐渐加快,也就是说随着RNA2577-A浓度的增加,基于连接反应产生的PCR聚合产物越多,且不同浓度梯度之间可以相互区分,同时,从图7中可以看出,CT值与RNA2577-A的浓度的对数值呈现良好的线性关系,线性相关方程式为CT=-9.22-3.07lgCRNA2577-A,相关系数R2=0.998。据此线性相关方程可以计算出106ng/μL HCT116poly>+RNA中MALAT1的2577位点含A的量为0.605amol。

利用实施例1中针对RNA2488-A设计的探针Ligase L1和Ligase R1检测HCT116细胞中长非编码RNA(lncRNA,MALAT1)2488位点A含量,检测方法是用106ng/μL HCT116的polyA+RNA替代HeLa的poly>+RNA,其他实验步骤与实施例1相同,并分别测量其实时荧光曲线,结果如图8所示。根据RNA2488-A的实时荧光曲线,绘制检测RNA2488-A的CT值(每个反应管内的荧光信号到达设定的域值时所经历的循环数)与RNA2488-A浓度对数值的线性关系曲线,结果如图9所示,并由此曲线公式计算出HCT116细胞中MALAT1的2488位点A的量。

从图8中可以看出,随着RNA2488-A浓度的增加PCR反应速度逐渐加快,也就是说随着RNA2488-A浓度的增加,基于连接反应产生的PCR聚合产物越多,且不同浓度梯度之间可以相互区分,同时,从图9中可以看出,CT值与RNA2488-A的浓度的对数值呈现良好的线性关系,线性相关方程式为CT=-7.42-3.13lgCRNA2488-A,相关系数R2=0.997。据此线性相关方程可以计算出106ng HCT116poly>+RNA中MALAT1的2488位点含A的量为1.59amol。

根据计算出的2488位点A的含量(1.59 amol)减去计算出的2577位点A的含量(0.605amol),得到2577位点m6A的含量为0.985amol,2577位点m6A的含量除以2577位点A和m6A的总和,得到HCT116细胞中MALAT1的2577位点m6A的百分比含量为61.9%。

为了证明T3 DNA连接酶和T4 RNA连接酶2能用于检测特定位点m6A的含量,发明人进行了大量的实验室研究试验,试验原理如图10所示,具体试验情况如下:

1、3'端修饰两个RNA碱基的DNA探针作为右探针时,用T3 DNA连接酶区分m6A和A

(1)根据含有MALAT1的2577位点的RNA序列5'-CUUAAUGUUUUUGCAUUGGACUUUGAGUUAAGAUUAUUUUUUAAAUCCUGAGGACUAGCAUUAAUUGAC-3'(RNA2577-A,画下划线的碱基是2577位点)和5'-CUUAAUGUUUUUGCAUUGGm6ACUUUGAGUUAAGAUUAUUUUUUAAAUCCUGAGGACUAGCAUUAAUUGAC-3'(RNA2577-m6A,画下划线的碱基是2577位点)设计合成左探针(Ligase>4CCAATGCAAAAA-3'(画下划线的部分为检测识别区、斜体部分为PCR引物区,由宝生物工程(大连)有限公司提供);Ligase R2的序列为5'-CCTTAACTCAAArGrU-3'(画下划线的部分为检测识别区、斜体部分为PCR引物区,由宝生物工程(大连)有限公司提供)。

(2)在200μL离心管中加入1.0μL水、1.0μL 200nM Ligase L2水溶液和1.0μL200nM Ligase R2水溶液、1.0μL 5×的T3 DNA连接酶反应缓冲溶液(330mM Tris-HCl、50mMMgCl2、5mM二硫苏糖醇、5mM腺嘌呤核苷三磷酸,37.5%聚乙二醇PEG6000,pH=7.6,25℃)、1.0μL>6A水溶液(同时作空白对比实验,空白是加入水来代替RNA2577-A水溶液或RNA2577-m6A水溶液),混合均匀,作为溶液A。在200μL离心管中加入3.9μL水、1.0μL>2、5mM二硫苏糖醇、5mM腺嘌呤核苷三磷酸,pH=7.6,25℃)、0.1μL>6A与Ligase>6A充分杂交,再向溶液A中加入溶液B,35℃孵育15min进行连接反应,反应结束后立即放在冰上。

(3)取步骤(2)中2.0μL连接反应产物加入到8.0μL聚合酶链式反应(PCR)混合溶液中进行PCR反应,其中PCR反应混合溶液由5.2μL灭菌水、0.2μL 2.5unit/μL JumpStartTMTaq>TM>2,0.01%(w/v)明胶)、1.0μL>

从图11中可以看出,RNA2577-A和RNA2577-m6A的浓度相同时,RNA2577-A和RNA2577-m6A的CT相差5.0个循环数,也就说明了基于RNA2577-m6A产生的PCR聚合产物要比基于RNA2577-A产生的PCR聚合产物少。从图12中可以看出,基于RNA2577-m6A产生的PCR聚合产物比基于RNA2577-A产生的PCR聚合产物少,假设基于RNA2577-A产生的PCR聚合产物的量为100%,基于RNA2577-m6A产生的PCR聚合产物的量大约为2.56%。这证明T3>6A敏感,m6A可以基本完全抑制T3>

2、DNA探针作为右探针时,用T3 DNA连接酶区分m6A和A

将上述试验1中的Ligase R2替换为Ligase R2-D(碱基序列为5'-CTTAACTCAAAGT-3'),200pM>6A水溶液替换为20nM>6A水溶液。用T3>6A,实时荧光强度信号结果如图13所示,把PCR聚合产物进行凝胶电泳分析,结果如图14所示。

从图13中可以看出,RNA2577-A和RNA2577-m6A的浓度相同时,RNA2577-A和RNA2577-m6A的CT相差3.6个循环数,也就说明了基于RNA2577-m6A产生的PCR聚合产物要比基于RNA2577-A产生的PCR聚合产物少。从图14中可以看出,基于RNA2577-m6A产生的PCR聚合产物比基于RNA2577-A产生的PCR聚合产物少,假设基于RNA2577-A产生的PCR聚合产物的量为100%,基于RNA2577-m6A产生的PCR聚合产物的量大约为24.5%。这证明当右探针完全为DNA时,T3>6A具有一定的敏感,m6A可以大部分抑制T3>

3、3'端修饰两个RNA碱基的DNA探针作为右探针时,用T4 RNA连接酶2区分m6A和A

将上述试验1中的T3 DNA连接酶替换为T4 RNA连接酶2,5×的T3 DNA连接酶缓冲溶液替换为5×的T4 RNA连接酶2缓冲溶液(250mM Tris-HCl、10mM MgCl2、5mM二硫苏糖醇、2mM腺嘌呤核苷三磷酸,pH=75,25℃),连接反应条件为37℃孵育30min,200pM RNA2577-A水溶液替换为20nM RNA2577-A水溶液;200pM>6A水溶液替换为20nM>6A水溶液。其他步骤与试验1相同,实时荧光强度信号结果如图15所示,把PCR聚合产物进行凝胶电泳分析,结果如图16所示。

从图15中可以看出,RNA2577-A和RNA2577-m6A的浓度相同时,RNA2577-A和RNA2577-m6A的CT相差2.4个循环数,也就说明了基于RNA2577-m6A产生的PCR聚合产物要比基于RNA2577-A产生的PCR聚合产物少。从图16中可以看出,基于RNA2577-m6A产生的PCR聚合产物比基于RNA2577-A产生的PCR聚合产物少,假设基于RNA2577-A产生的PCR聚合产物的量为100%,基于RNA2577-m6A产生的PCR聚合产物的量大约为30.5%。这证明当右探针为Ligase>6A具有一定的敏感,m6A可以大部分抑制T4>

4、DNA探针作为右探针时,用T4 RNA连接酶2区分m6A和A

将上述试验3中的Ligase R2替换为Ligase R2-D(碱基序列为5'-CTTAACTCAAAGT-3'),用T4>6A,实时荧光强度信号结果如图17所示,把PCR聚合产物进行凝胶电泳分析,结果如图18所示。

从图17中可以看出,RNA2577-A和RNA2577-m6A的浓度相同时,RNA2577-A和RNA2577-m6A的CT相差2.3个循环数,也就说明了基于RNA2577-m6A产生的PCR聚合产物要比基于RNA2577-A产生的PCR聚合产物少。从图18中可以看出,基于RNA2577-m6A产生的PCR聚合产物比基于RNA2577-A产生的PCR聚合产物少,假设基于RNA2577-A产生的PCR聚合产物的量为100%,基于RNA2577-m6A产生的PCR聚合产物的量大约为32.1%。这证明当右探针为Ligase>6A具有一定的敏感,m6A可以大部分抑制T4>

核 苷 酸 或 氨 基 酸 序 列 表

[0001]

序 列 表

<110> 陕西师范大学

<120> T3 DNA连接酶和T4 RNA连接酶2在检测N6甲基腺嘌呤中的应用

<160> 12

<210> 1

<211> 69

<212> RNA

<213> 人工序列

<221> misc_feature

<223> RNA 2577-A序列

<400> 1

CUUAAUGUUUUUGCAUUGGACUUUGAGUUAAGAUUAUUUUUUAAAUCCUGAGGACUAGCAUUAAUUGAC 69

<210> 2

<211> 32

<212> DNA

<213> 人工序列

<221> misc_feature

<223> 根据待测RNA 2577-A序列设计的探针Ligase L2,以用作连接反应构建DNA模板

<400> 2

CCAATGCAAAAACTCTATGGGCAGTCGGTGAT 32

<210> 3

<211> 33

<212> DNA

<213> 人工序列

<221> misc_feature

<223> 根据待测RNA 2577-A序列设计的探针Ligase R2,以用作连接反应构建DNA模板

<400> 3

CCATCTCATCCCTGCGTGTCCTTAACTCAAArGrU 33

<210> 4

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<221> misc_feature

<223> FP,作为聚合酶链式反应(PCR)扩增反应正向引物

<400> 4

CCATCTCATCCCTGCGTGTC 20

<210> 5

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<221> misc_feature

<223> RP,作为聚合酶链式反应(PCR)扩增反应反向引物

<400> 5

ATCACCGACTGCCCATAGAG 20

<210> 6

<211> 54

<212> RNA

<213> 人工序列

<221> misc_feature

<223>RNA 2488-A序列

<400> 6

UAGAAGAAUUUGGAAGGCCUUAAAUAUAGUAGCUUAGUUUGAAAAAUGUGAAGG 54

<210> 7

<211> 30

<212> DNA

<213> 人工序列

<221> misc_feature

<223> 根据待测RNA 2488-A序列设计的探针Ligase L1,以用作连接反应构建DNA模板

<400> 7

ATATTTAAGGCTCTATGGGCAGTCGGTGAT 30

<210> 8

<211> 32

<212> DNA

<213> 人工序列

<221> misc_feature

<223> 根据待测RNA 2488-A序列设计的探针Ligase R1,以用作连接反应构建DNA模板

<400> 8

CCATCTCATCCCTGCGTGTCAACTAAGCTArCrU 32

<210> 9

<211> 69

<212> RNA

<213> 人工序列

<221> misc_feature

<223> RNA 2577-m6A序列

<400> 9

CUUAAUGUUUUUGCAUUGGm6ACUUUGAGUUAAGAUUAUUUUUUAAAUCCUGAGGACUAGCAUUAAUUGAC 69

<210> 10

<211> 33

<212> DNA

<213> 人工序列

<221> misc_feature

<223> 根据待测RNA 2577-A序列设计的探针Ligase R2-D,以用作连接反应构建DNA模板

<400> 10

CCATCTCATCCCTGCGTGTCCTTAACTCAAAGT 33

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