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基于微藻蛋白质特征序列标签匹配的蛋白质快速检测方法及系统

摘要

基于微藻蛋白质特征序列标签匹配的蛋白质快速检测方法及系统,包括采集微藻样品,获得其蛋白质序列集,转换成标准蛋白质序列集,并进行拆分配置处理,将其转换为对于一个给定序列片段的键/值对列表,将键/值对列表进行汇总后做交集运算,当结果非空,则确定该数据集某条数据含有特征蛋白质序列。其系统主要包括检测数据输入模块、键/值对列表模块、检测识别模块、特征值交集运算模块、输出模块。本发明通过蛋白质序列检索以判断蛋白质的同源性和相似性程度,较传统逐条数据进行对比的方式,算法的鉴定准确率和效率有显著提高,大大提升了检索效率,不仅具有良好的实用性,而且算法的时间复杂度低,性能高,对于蛋白质组学的研究具有重要意义。

著录项

  • 公开/公告号CN106709273A

    专利类型发明专利

  • 公开/公告日2017-05-24

    原文格式PDF

  • 申请/专利权人 国家海洋局第一海洋研究所;

    申请/专利号CN201611162740.0

  • 发明设计人 王帅;郑立;陈军辉;

    申请日2016-12-15

  • 分类号G06F19/18(20110101);G06F19/22(20110101);

  • 代理机构37201 青岛海昊知识产权事务所有限公司;

  • 代理人张中南;邱岳

  • 地址 266061 山东省青岛市崂山区仙霞岭路6号

  • 入库时间 2023-06-19 02:16:22

法律信息

  • 法律状态公告日

    法律状态信息

    法律状态

  • 2019-06-18

    授权

    授权

  • 2019-05-07

    著录事项变更 IPC(主分类):G16B20/30 变更前: 变更后: 申请日:20161215

    著录事项变更

  • 2017-06-16

    实质审查的生效 IPC(主分类):G06F19/18 申请日:20161215

    实质审查的生效

  • 2017-05-24

    公开

    公开

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