从古DNA数据中过滤现代DNA污染的方法及其应用

摘要

本申请公开了一种从古DNA数据中过滤现代DNA污染的方法及其应用。本申请过滤现代DNA污染的方法，包括对古DNA的Illumina二代测序原始数据进行古DNA特征过滤，具体包括根据古DNA脱氨基特征对Illumina二代测序原始数据进行现代DNA污染过滤，即过滤后保留古DNA脱氨基造成的5’端至少N个C‑>T突变，和/或3’端至少M个C‑>T突变的读长。本申请的方法，能对目前广泛使用的Illumina平台数据进行处理，本申请采用最适合于古DNA的对比对算法和参数，在适合的N和M值下，能使过滤后的污染率达到0，是目前为止过滤强度最大的方法之一，为后续的古DNA的深入研究奠定了基础。