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基于cfDNA的测序及数据分析的癌症相关生物标记及其在cfDNA样品分类中的应用

摘要

本发明公开了一种基于cfDNA的测序及数据分析的癌症相关生物标记及其在cfDNA样品分类中的应用,本发明运用新方法从血浆cfDNA(cfDNA)中寻找癌症新生物标记,通过对癌症患者和健康人的cfDNA样本的测序和生物信息学分析,鉴定了相关表观遗传标记和遗传标记,通过机器学习分析表观遗传标记建立了支持向量模型,可准确进行cfDNA样品的分类,即充分DNA样品是来自癌症个体还是来自健康个体。本发明的标记或称标志物为癌症的诊断、预后和治疗提供了新的分子生物标志物。此外,本发明为通过SALP‑seq和机器学习相结合从cfDNA寻找新的癌症分子标记提供了一条新的方法。

著录项

  • 公开/公告号CN111254194A

    专利类型发明专利

  • 公开/公告日2020-06-09

    原文格式PDF

  • 申请/专利权人 东南大学;

    申请/专利号CN202010035114.5

  • 发明设计人 王进科;刘世财;

    申请日2020-01-13

  • 分类号C12Q1/6886(20180101);C12Q1/6869(20180101);G16B30/00(20190101);G16B40/00(20190101);

  • 代理机构32204 南京苏高专利商标事务所(普通合伙);

  • 代理人孙斌

  • 地址 211102 江苏省南京市江宁区东南大学路2号

  • 入库时间 2023-12-17 08:55:38

法律信息

  • 法律状态公告日

    法律状态信息

    法律状态

  • 2020-07-03

    实质审查的生效 IPC(主分类):C12Q1/6886 申请日:20200113

    实质审查的生效

  • 2020-06-09

    公开

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