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一种鉴定耐药基因和/或耐药基因突变位点的宏基因组数据分析方法及系统

摘要

本发明涉及一种鉴定耐药基因和/或耐药基因突变位点的宏基因组数据分析方法及系统。本发明所述数据分析方法和系统基于blast算法,将样本的宏基因组测序序列与耐药基因数据库的耐药基因或耐药基于突变位点序列信息进行比对,获得耐药基因和/或耐药基因突变位点的初步鉴定结果;之后,过滤可信度不高的初步鉴定结果,获得最终鉴定结果。本发明所述方法和系统能够快速、准确地鉴定耐药基因和耐药突变位点,获得样本的全局耐药性,并结合物种鉴定结果,映射到报告检出物种,获得具体的耐药微生物菌株;进一步地,本发明所述方法和系统在鉴定耐药基因时对耐药基因数据准确性的兼容性强,减少耐药基因数据库序列两端的注释不准确的缺陷。

著录项

法律信息

  • 法律状态公告日

    法律状态信息

    法律状态

  • 2019-05-21

    实质审查的生效 IPC(主分类):G16B30/10 申请日:20180419

    实质审查的生效

  • 2019-04-26

    公开

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