PLUG引物和IT引物在顶芒山羊草分子标记建立中的通用性分析

摘要

分子标记是检测和追踪小麦背景中近缘物种染色体的重要手段.依据禾本科物种基因共线性原则,基于基因序列设计的引物在不同物种中可能具有通用性.本研究对水稻PLUG引物和簇毛麦IT引物在顶芒山羊草中的通用性进行了分析,并建立了顶芒山羊草染色体特异IT标记.供试的397对PLUG引物和841对IT引物对小麦-顶芒山羊草双二倍体与中国春的扩增结果显示,377对(95.0％)PLUG引物和593对(70.5％)IT引物可以在供试材料中扩增出清晰条带.因此,PLUG引物在顶芒山羊草中的通用性优于IT引物.相比小麦对照,PLUG引物和IT引物能在小麦-顶芒山羊草双二倍体中扩增出多态性条带的引物数分别有17对和5对,分别占供试PLUG引物和IT引物的4.3％和0.6％.利用获得的IT多态性引物对一套小麦-顶芒山羊草附加系和一套小麦-卵穗山羊草附加系进行扩增,结果发现仅引物CINAU1060、CINAU1465和CINAU1517能在相应附加系中扩增出大小分别约为300、480 bp和320 bp的多态性标记,为小麦背景中顶芒山羊草染色质的鉴定提供了新的检测手段.然而,本研究中IT引物建立顶芒山羊草分子标记的比率仅为0.4％,低于我们之前用PLUG引物建立顶芒山羊草分子标记的比率(8.9％).