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2016~2017年胶东地区商品肉鸡H9N2亚型禽流感病毒HA基因序列分析

         

摘要

为了解山东胶东地区商品肉鸡H9N2亚型禽流感病毒(AIV)分离株的遗传变异情况,采用RT-PCR技术对13株从不同肉鸡饲养场分离的H9N2亚型禽流感病毒的HA基因进行扩增、克隆和测序,并对所获得的HA全序列进行同源性和遗传进化分析.结果显示,13个分离株的裂解位点均为RSSR ↓ GLF,符合低致病性禽流感病毒的分子特征;有6~8个潜在糖基化位点;受体结合位点除198位有变异,其他位点均较保守;234位氨基酸均为L,具有与哺乳动物唾液酸α,2-6受体结合的特征;13个分离株HA基因核苷酸同源性为94.1%~99.8%,氨基酸同源性为94.3%~100%.13个分离株同属于欧亚分支中的A/Chicken/Beijing/1/1994亚群,同属于近几年在中国鸡群中流行的以A/chicken/Zhejiang/HJ/2007为代表的G57分支.

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