烟草NtHMGR1基因的克隆和表达分析

摘要

3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A还原酶(HMGR)是MVA萜类合成途径的第一个关键酶,在烟草萜类物质的生物合成过程中起到重要的作用.本研究基于转录组数据,从烟草幼叶中克隆出1815 bp、可编码604个氨基酸的HMGR 1基因完整开放阅读框(ORF).经生物信息学分析显示,该基因编码的蛋白序列与番茄相似性最高;该蛋白序列无信号肽,2个区域有跨膜结构域,结构特征为膜外非分泌不稳定疏水蛋白;蛋白质二级结构由α螺旋、延伸链、β转角和不规则卷曲组成,三级结构为同源四聚体.与此同时,运用Real-time PCR对NtHMGR 1基因在烟草不同组织的表达差异性进行检测,结果表明,根<茎<上部叶<中部叶<下部叶.经SA,MEJA,ABA,GA处理后,NtHMGR 1基因的表达峰值出现时间以及在各时间点波动均存在差异性.