2009-2017年江苏省手足口病病原谱及柯萨奇A16型的分子流行病学研究

摘要

目的 描述2009-2017年江苏省手足口病(HFMD)病原谱及柯萨奇A16型(CVA16)的流行病学、基因变异及遗传进化特征.方法 对2009-2017年江苏省手足口病发病资料和病原学检测情况进行统计分析,选取120株CVA16病毒分离株进行VP1区全长基因序列测定,并对核苷酸及氨基酸序列进行同源性比较及系统进化分析.结果 2009-2017年江苏省共报告手足口病1 013 771例.其中,手足口病肠道病毒阳性病例37 389例,主要病原构成为EV71(39.85％)和CVA16(30.13％);重症病例中,以EV71为主要病原,CVA16及其他肠道病毒引起的重症病例较少.CVA16在每年的3～7月和9～11月出现流行高峰,主要感染1～4岁年龄段儿童,男性比例高于女性.江苏省地区流行的CVA16毒株属于B1a亚型和B1b亚型,其中B1b亚型为优势流行基因亚型.120株CVA16病毒分离株VP1区核苷酸及编码氨基酸序列同源性分别为87.5％～100％、97％～100％.结论 2009-2017年,江苏省地区流行的CVA16具有明显的时间、人群分布特征;120株CVA16分离株属于B1a亚型和B1b亚型.CVA16分离株核苷酸序列变异较大,但氨基酸同源性较高,推断存在一定的同义突变.