2021年河南南阳地区猪繁殖与呼吸综合征病毒ORF5基因遗传进化分析

摘要

为了解2021年河南南阳地区猪繁殖与呼吸综合征病毒ORF5基因遗传变异情况,通过RT-PCR方法对从南阳地区采集的临床疑似猪繁殖与呼吸综合征样品进行检测,然后对阳性样品进行ORF5基因扩增和测序,应用DNA Star和Mega软件对所测序列进行同源性和遗传进化分析。结果显示,从患病仔猪的病料中扩增出8份阳性样品,分别命名为THX01、THX02、THX03、THX04、XYX05、XYX06、XYX07、XYX08。系统发育树分析表明,该8株流行株均为美洲型毒株;其中THX02株与以HUN4为代表的高致病性毒株处于同一分支属于Subgroup V,其余7株与以NADC30为代表的变异毒株处于同一分支,属于Subgroup I。PRRSV GP5推导氨基酸序列分析显示,在非中和表位aa27~aa30中,发生V27A、A29T、L28F突变;和非中和表位aa180~aa197中,发生V185A、I189V、I189L、R191K、V192I、Q196R突变。在中和表位aa37~aa45,发生L39I、L41S、N44K突变。这些研究表明河南南阳地区存在2种PRRSV毒株,且以Subgroup I型为主,GP5抗原表位存在一定变异,这些位点的突变可能会导致GP5蛋白的免疫原性和毒株毒力改变。本研究揭示了南阳地区PRRSV的流行情况,为该地区防控PRRS提供参考。