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武定鸡NPY基因、IGF-1基因多态性与产蛋性能关系的研究

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1引言

1.1武定鸡概况

1.2家禽数量性状的选择方法

1.3遗传标记

1.4 IGF-I的研究进展

1.6 研究目的及意义

2实验材料和方法

2.1 实验材料

2.2基因组DNA提取和质量检测

2.3引物设计

2.4 PCR扩增

2.5 遗传学统计分析

3结果和分析

3.1基因组DNA提取结果

3.2 PCR 扩增产物结果

3.3 PCR-RFLP检测结果

3.4参试鸡群的产蛋性能状况

3.6 NPY、IGF-1基因与武定鸡产蛋性能的关联分析

3.7不同基因型与产蛋性能不同指标之间的关联分析

4 讨论

4.1 高质量DNA的提取

4.2 武定鸡 NPY基因和 IGF-I 基因的 SNPs 分析

4.3 武定鸡 NPY 基因和 IGF-I 基因群体遗传分析

4.4 NPY 基因和 IGF-I 基因多态性与武定鸡产蛋性能的关联分析

5 结论

参考文献

致谢

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摘要

胰岛素样生长因子-1是一种对动物生长、发育、繁殖、营养代谢以及组织细胞的增殖、分化、凋亡和癌变有直接影响的多功能生物活性肽,是调节动物生命活动的最重要的几个多肽生长因子之一。神经肽Y功能也十分广泛,参与食物摄入量的控制,调节性激素释放、性行为、新陈代谢、血压、生理节律以及繁殖等方面,另外还通过研究发现,NPY是一种重要的饱食因子,这对提高家畜品质有重要的意义。本实验以武定鸡为研究对象,利用PCR-RFLP方法探讨候选基因NPY基因、IGF-1基因多态性与武定鸡的产蛋性能相关性,旨在为动物遗传资源多样性保护、利用以及培育符合社会需要的产品提供合理的科学依据。研究结果如下:
  1、PCR-RFLP分析表明,在武定鸡的NPY基因TSS区和exon2区分别存在DraⅠ和Psp1406Ⅰ酶切位点,DraⅠ位点存在4个碱基的缺失,Psp1406Ⅰ位点存在一个A→G突变,该多态位点从未见报道。IGF-1基因5’UTR区存在HinfⅠ酶切位点,该位点存在C→T突变。
  2、对NPY基因和IGF-1基因上所检测到的多态性片段分别做了基因频率和基因型频率统计。DraⅠ位点的等位基因A频率为0.7,等位基因B频率为0.3;Psp1406Ⅰ位点的等位基因C频率为0.16,等位基因D为0.84;HinfⅠ位点的等位基因E频率为0.53,等位基因F频率为0.47。经χ2检验,武定鸡此两个基因三个酶切位点均处于Hardy-Weinberg平衡状态。
  3、对NPY基因的基因型效应进行差异显著性分析,NPY(TSS)基因DraⅠ酶切多态位点与武定鸡的开产蛋重、240日龄和39周龄的产蛋数和蛋重有相关性。AB基因型个体的开产蛋重最大,极显著高于AA和BB基因型的个体(P<0.01)。在240日龄产蛋数及39周龄的产蛋数和蛋重中,AA和AB基因型个体极显著低于BB基因型的个体(P<0.01)。在240日龄蛋重中,AA和AB基因型个体显著低于BB基因型的个体(P<0.05)。NPY(exon2)基因Psp1406Ⅰ酶切位点多态位点与武定鸡的开产蛋重、39周龄的产蛋数有相关性。DD基因型个体的开产蛋重极显著低于CD基因型的个体(P<0.01),CD基因型个体在39周龄的产蛋数显著低于DD基因型的个体(P<0.05)。
  4、对IGF-1基因的基因型效应进行差异显著性分析,IGF-1(5’UTR)基因HinfⅠ酶切位点多态位点与武定鸡的开产蛋重、240日龄的产蛋数和蛋重和39周龄的产蛋数和蛋重有相关性。EE基因型个体的开产蛋重最大,显著高于EF和FF基因型的个体(P<0.05),EE和FF基因型个体在240日龄产蛋数和蛋重要极显著高于EF基因型的个体(P<0.01),在39周龄产蛋数中,EE基因型个体极显著高于EF基因型个体(P<0.01),而EE基因型个体与FF基因型个体之间存在显著差异(P<0.05)。

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