LOC100859070和LOC421441基因表达量及启动子多态性对蛋壳品质的影响

摘要

以洛岛白母鸡为试验鸡群，根据210288天产蛋记录，结合产蛋率(＞80%)、破蛋率分为正常组与实验组。结合家系记录，选择试验群体内鸡蛋破损率＞20%的8只个体作为实验组，破损率为＜1%的8只个体作为对照组，组成两尾群体。采取翅静脉采集血液(ACD抗凝)用于提取基因组DNA。采集产蛋后18h的子宫组织(液氮保存)用于提取组织总RNA。根据启动子(转录起始位点上游1.5-2 KB)的序列，每个基因设计3-4对引物，采用直接PCR测序法对16个个体的两个基因启动子分别进行Sanger测序。利用Mega5.1软件来分析基因启动子区域多态性。采用双标准曲线法分析基因mRNA表达差异。使用SAS 9.1软件分析基因启动子区域多态性与蛋壳品质、基因mRNA表达量的关系。通过分析发现，本试验选取的两尾群体母鸡所产蛋的蛋壳强度和蛋壳厚度差异极显著。通过定量PCR试验发现正常组中LOC100859070和LOC421441两个基因的mRNA表达量都显著低于破蛋组 ,说明这两个性状可能与LOC100859070和LOC421441基因的表达有关。通过对这两个基因启动子区1-2Kb多态位点分析发现，在两尾群体中并没有影响mRNA表达量差异的共有变异，说明研究的启动子区变异不是导致这两个基因表达差异的直接原因。直接PCR测序法结果发现，LOC100859070基因在破蛋组第三个个体中的突变位点较多，但不是特定的某一种类型的突变。根据在线网站SofrBerry对LOC421441基因和LOC100859070基因的启动子区进行预测，只在LOC421441基因启动子区的一1470位置预测出TATA增强子元件。