FMDV O/HK/2001株基因组编码区的基因克隆与序列分析

摘要

本研究参考GenBank中O型FMDV全基因序列,分段设计了9对引物,应用RT-PCR技术对O/HK/2001株的基因组编码区序列进行了克隆和序列测定,获得了该病毒株基因组编码区的核苷酸序列并推导出氨基酸序列.并将O/HK/2001株与14株不同O型FMDV进行序列比较分析,结果表明,该毒株与以HKN/2002株为代表的猪毒群的7个毒株的同源性较高,与香港HKN/2002株遗传关系最近,而与属于泛亚毒的7个毒株同源性较低,其遗传关系也较远.本研究为开展FMD分子流行病学调查及FMDV各基因的功能、分子致病基础研究奠定了基础.