高通量测序在中草药研究中的应用

摘要

中草药在我国已有上千年的应用历史,研究人员从中草药中已提取出多种药用活性成分.但由于中草药的特殊性,其活性物质合成的遗传基础尚不清楚,遗传信息和功能基因的研究极其薄弱,亟需进行中草药活性成分的功能基因挖掘.本文将从转录组分析,基因甲基化,宏基因测序,基因组拼接,micro-RNA等几个方面进行综述,为高通量测序在中草药研究中的应用提供科学依据,为其进一步的研究提供广阔的前景.rn 自从人类基因组计划完成之后，便进入了后基因组时代，亦称功能基因组学时代。后基因组时代以提示基因组的表达及其调控、基因组的多样性、模式生物体基因组研究等为目标。高通量测序技术可以对一个物种的转录组和基因组进行细致全貌的分析，而使这一切成为可能。rn 有趣的是高通量测序技术中基因组分析，转录组分析，宏基因组测序中“组学”的概念与中医药中的“整体思想”不谋而合；基因甲基化，SNP标记等技术与中医药学中的“辨证论治”思想异曲同工；microRNA双向调控作用与中医药中的“阴阳平衡”观念有相似之处。近些年来，越来越多的研究也表明高通量测序在中草药研究中具有广泛的应用前景。例如实际研究中转录组中药的高通量转录组研究自开展以来获得了许多可喜的成果，中草药可控制基因甲基化程度，进而发挥其抗癌作用，等等。相信随着高通量测序技术的不断进步，实验流程的不断完善，其在中医药现代化发展中发挥的作用也将越来越巨大。