rbcL

摘要： 为进一步解决食品中基于扩增子测序的植物成分掺假非定向筛查问题,实现对植物源性成分高通量的检测和评估,该研究基于扩增子测序技术,利用植物通用引物RbcL,开发了常见植物成分非定向筛查方法。通过PCR技术,以红小豆、大豆、绿豆、红薯、马铃薯、木薯、薏米、小麦、玉米、小米、水稻、杏、腰果、榛子、芝麻、巴旦木、核桃、桃、香蕉、梨、小番茄、南瓜、胡萝卜、苹果、花生、开心果、芸豆27种植物物种提取的DNA为模板对该方法进行特异性、通用性、灵敏度验证。结果表明,通过DNAMAN软件与美国国立生物技术信息中心数据库比对测序,可有效区分不同植物物种。此外,利用二代测序分析技术对4个混合植物源性成分样本进行高通量、非定向筛查,测序结果与产品标识一致。该方法的建立对于植物源性成分的掺杂掺假鉴定和监管、消费者权益的保护具有重要意义。

摘要： 黄精属(Polygonatum)的许多物种具有重要的药用价值,但目前缺乏能够准确、高效地鉴定黄精属药用植物的DNA条形码。本研究通过对ITS、trnK-matK、rbcL、psbA-trnH和psbK-psbI序列进行扩增和测序,并从ITS序列中提取ITS2序列,共获得黄精属7个药用物种23份样品的138条序列。进一步比较6个DNA条形码对黄精属药用植物的鉴定效率,并验证所筛选条形码的可靠性。结果显示:trnK-matK的种内和种间变异重合少且有较明显的条形码间隙,其他5个序列的种内和种间变异重合多且无条形码间隙;BLAST结果表明trnK-matK的鉴定效率最高(85.7%),系统发育树显示trnK-matK的鉴定能力最强,能将全部12个多花黄精样品聚在一支,并能区分黄精、滇黄精、玉竹、点花黄精和湖北黄精;AMOVA分析结果揭示trnK-matK的群体遗传分化指数(F_(st))最高,适用于区分黄精属物种间差异。因此,trnK-matK最适用于黄精属药用植物的分子鉴定。

摘要： Illegal trade is considered one of the greatest threats to the loss of biodiversity of endangered plants. Some of these plant species are often trafficked in processed forms, making it extremely difficult for taxonomic experts to identify them. In the past, illegal traders of endangered species have been arrested and prosecuted but eventually cleared due to a lack of conclusive evidence. DNA barcoding is a veritable tool to protect these endangered species from illegal trade. It identifies all stages of the species’ life forms including processed products (milled or powdered animal and plant parts). The study utilised the rbcL gene as a single barcode region in the identification/authentication of 19 Nigeria’s endangered forest species legislated under the CITES and other endangered species of national interest. The generated sequence barcodes were used to query NCBI-GenBank and BOLD databases. 57.89% of the samples were identified down to species level and 42.11% to genus level. Amongst the 19 samples, sample (S7) yielded a high-quality sequence for a single sequencing read (forward), sufficient to identify the sample with a 99.81% identity match on NCBI-GenBank and BOLD. The results reveal that the rbcL single barcode efficiently identified most of the sampled plants;this supports the potential utilisation of DNA barcoding in the accurate detection and conservation of CITES-listed plants in Nigeria. The study documented the CITES-listed plants and other essential plants endangered or threatened plants in Nigeria and provided the first chloroplast DNA reference dataset to support the utilisation of DNA barcoding to identify CITES-listed plant species in Nigeria, which is significant for future studies.

摘要： 以云南省玉溪市和河南省焦作市新采集的2株淡水胭脂藻标本为材料,对其进行形态特征观察和分子系统发育分析,联合我国已报道的其他胭脂藻序列信息,构建该属植物可靠的系统发育关系.根据其现代地理分布模式,对胭脂藻属进行了祖先地理起源重建.基于rbcL、psbA和UPA序列,利用贝叶斯法、最大似然法和邻接法构建的系统发育树高度一致,研究中的标本与鸡公山胭脂藻H.jigongshanensis聚合为一个独立分支,并得到了很高的支持率,根据分子生物学证据,将其鉴定为鸡公山胭脂藻.通过研究中所采集2株鸡公山胭脂藻的形态特征比较,发现传统的形态分类特征包括藻体高度和细胞直径,在不同的环境条件下是可变的,不适合作为胭脂藻属植物种类鉴定的依据.对于胭脂藻属这一形态结构较为简单的类群,必须借助分子生物学证据和系统发育分析手段对其进行种类鉴定和系统发育分析.分子系统发育分析结果表明,中国特有种鸡公山胭脂藻H.jigongshanensis形成单系类群,其与日本胭脂藻H.japananense亲缘关系较近,所有淡水胭脂藻种类形成一个独立的聚类群,与海洋种类遗传差异较大.祖先地理重建的分析结果表明,淡水胭脂藻的祖先起源地位于北美洲,然后逐渐向东加勒比海区域、拉丁美洲和欧亚大陆扩散,形成现代地理分布模式.胭脂藻属独特的种类地理分布特点,可能与其较为古老的起源时间和漫长的进化历史相关,同时淡水胭脂藻在北美洲区域起源时间较早,进化历史漫长,遗传多样性大,这与该地理区域分布的种类H.angolensis为多系类群是相一致的.

摘要： cqvip:本研究通过比较用于植物鉴定的DNA条形码序列ITS1、ITS2、rbcL、matK在菟丝子属(Cuscuta L.) 6个种的杂草籽的种间差异,分析研究菟丝子属DNA条形码鉴定的主要特征。通过对样品进行DNA提取、扩增、测序,利用NCBI中的Nucleotide BLAST、邻接法(Neighbor-Joining)进行鉴定分析。经综合比较可以看出利用DNA条形码能够准确地鉴别菟丝子属杂草,其中ITS2、rbcL序列的鉴定成功率较高,适合作为鉴别菟丝子属杂草籽的条形码序列。本研究结果以期为DNA条形码技术在菟丝子属杂草籽的筛选鉴定中提供依据。

摘要： 那屿藻属(新拟名)Yonagunia Kawaguchi et Masuda隶属于红藻门海膜科,本研究通过对该属的台湾那屿藻(新拟名)Yonagunia formosana(Okamura)Kawaguchi et Masuda进行了形态学和基于rbcL序列的系统发育分析,证实台湾那屿藻存在于我国海南省东南部地区,并较为详细地描述了该物种的分枝形式、小育枝、皮层细胞等营养结构以及生殖结构,发现藻体的枝端形状比最初报道的模式种更加多样化,且藻体各部分结构(分枝形式、小育枝、皮层细胞等)的大小与最初报道的模式种也存在一定的差异.本研究是我国海南省东南部地区台湾那屿藻的首次分子系统发育学研究报道.

摘要： 藻类鉴定被广泛应用于藻类遗传学、生理学、生态学和应用藻类学,尤其是藻类调查和评估.然而,基于形态学的鉴定往往因为分类特征未出现或不典型、设备限制和人员经验欠缺等原因带来较大误差.随着测序技术的不断发展,分子标记已成为藻类鉴定的一个通用工具.由于藻类类群众多且差异很大,分子标记的选择成为藻类鉴定的关键.本文综述了蓝藻、硅藻、绿藻、甲藻、裸藻、隐藻、金藻、黄藻、红藻和褐藻等主要门类分子标记的选择及应用进展,包括分子标记选择原则、常用标记和相应序列数据库,以及各个分子标记在不同类群应用中的优缺点等.藻类分子鉴定源于编码核糖体RNA的基因(rDNA),发展于细胞核、线粒体、叶绿体DNA等.然而,当前藻类分子鉴定逐渐细化和完善,单一的核糖体DNA、内转录间隔区(ITS)和保守蛋白编码基因等短序列分子标记已经很难满足藻类鉴定的需求,多标记组合成为一种必然选择.同时,线粒体基因组、叶绿体基因组、核基因组、转录组和宏基因组等提供了更多遗传进化信息,弥补了短序列分子标记在系统分类应用中的不足.对于藻类鉴定,单纯依赖分子标记或形态学都不足以保证鉴定的准确性,采用将分子生物学、形态学、生理生化学等结合的多相学方法,才能准确地完成鉴定工作.此外,藻类分子数据库的建立和完善是未来分子鉴定的重要工作,快速鉴定方法也必将在未来获得广泛的应用和发展.

摘要： Brassinosteroids participate in many physiological processes in plants;however,their regulatory roles on the activities of the enzymes involved in dark phase of photosynthesis remains elusive.In this study,detached leaves and protoplasts of maize seedlings were treated with epi-brassinolide(EBR)and brassinazole followed by the determination of the contents of chlorophyll(a+b)and soluble sugars,and the activity of dark reaction enzymes and the expression of the relevant genes.The results showed that chlorophyll(a+b)content increased by 7.4%under 0.1μM EBR treatment for 48 h;furthermore,chlorophyll(a+b)content increased by 34%in detached leaves that were continuously soaked in brassinazole.In addition,the transcription levels of glyceraldehyde3-phosphate dehydrogenase subunit A(GAPA),cytoplasmic FBPase(cyFBPase),ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase small subunit(rbcS),phosphoenolpyruvate carboxylase(PEPC),fructose-1,6-bisphosphatase(FBPase),Rubisco activaseβsubunit(RCAβ),ribulose-l,5-bisphosphate carboxylase large subunit(rbcL),and glutathione reductase(GR)were 96.8%,48.4%,79.3%,41%,85.6%,133.3%,68.8%,and 119.8%higher,respectively,in 0.1μM EBR than in the control group.The activity of RCA and Rubisco and soluble sugar content increased by 53.4%,28.7%,and 35.4%under 0.1μM EBR.Brassinazole inhibits the expression of these genes.However,the transcription level,protein content,and activity of some dark-reaction enzymes cannot be increased at the same time under EBR treatment.These results indicate that the effect of EBR on dark-reaction is mainly in transcription level.

摘要： 为找到适宜用于轮藻科植物系统发育研究的分子片段,对本研究所选轮藻进行18S rDNA、rbcL、atpB及18S rDNA-rbcL-atpB三基因联合序列的多样性分析,并通过构建系统进化树的方法,开展系统发育研究.结果表明,18S rDNA序列较适宜用于研究轮藻科下两个族和各属间的分类问题,但进一步对属内轮藻进行分类需要借助变异程度更高的序列;rbcL、atpB序列变异程度高于18S rDNA序列,但两者不适宜单独用于轮藻科植物的系统发育研究;三基因联合序列的种间、种内遗传距离有一定差异,种间遗传距离(0.002～0.097)大于种内遗传距离(0～0.001),且所得进化树的拓扑结构与传统形态学分类结构一致,属内轮藻分类不再混乱,进化树呈现良好的拓扑结构.综上所述,18S rDNA-rbcL-atpB三基因联合分析后可将形态近似的轮藻分开,解决本研究选取的轮藻科植物的分类问题.

摘要： 基于rbcL与COI基因序列分析,对分布在辽宁省大连海域的亮管藻(Hy alosi-phonia caespitosa)进行了分子鉴定,并对其外部形态、生长过程、各月份生物量、成熟个体比例及成熟个体生物量/总生物量(R/T指数)的变化等进行了详细的研究.结果表明:①大连海域6个采集地点样本的rbcL与COI基因序列间无碱基差异,均与产自加拿大的亮管藻聚在同一进化支中,确定为亮管藻;②藻体直立,单生或丛生,线形圆柱状,有明显的主轴或分枝,颜色为红色或紫红色,质地胶质,固着器为盘状;③亮管藻生物量4月达到最大,平均生物量为3.483 g/m2.6月藻体全部成熟且均为四分孢子体.④亮管藻的生长周期为12月至次年6月,属于一年生海藻.

摘要： 一种RbCl/BaCl2混合气溶胶及其制备镁基金属半固态浆料的方法，属于金属材料制备领域。该RbCl/BaCl2混合气溶胶，包括气溶胶溶质和气溶胶溶剂，气溶胶溶质占总RbCl/BaCl2混合气溶胶的质量百分比为80～85％；气溶胶溶质为RbCl和BaCl2以质量比为2:3的混合粉体；气溶胶溶剂为不与镁合金熔体反应的单一或混合气体，包括但不限于惰性气体和/或镁熔炼常用的保护气体。将RbCl/BaCl2混合气溶胶导入半固态温度区间的镁合金熔体内部，并充分接触，使其形成镁基金属半固态浆料。本方法相对于传统镁合金半固态浆料制备方法具有设备简单可靠、工艺稳定、产品质量高等优势，在降低成本的同时可以达到节能减排的效果。

摘要： 发明公开了一种硅藻rbcL基因在判断溺亡者是否真正死于溺亡的应用。本发明中提供一对检测硅藻rbcL基因的引物对，还提供一种硅藻rbcL基因的分析方法，提取硅藻内核酸，利用权利要求2所述引物对上述核酸中rbcL基因进行扩增，利用扩增产物制备待测样本，对待测样本进行核酸分析。本发明还提供了将上述硅藻rbcL基因分析方法应用于法医检测中的应用，在溺亡者脏器中提取硅藻核酸并用PCR技术进行扩增，然后进行检测并与水样中的硅藻核酸进行比对，通过检出率和硅藻rbcL基因测序结果的比对，即可判断溺亡者是否真正死于溺亡，同时有助于找出真正的溺亡区域。

摘要： 本发明公开了用于进行陆地植物物种鉴定的基于rbcL基因的特异引物对及其应用。本发明提供的特异引物对，由单链DNA甲和单链DNA乙组成；所述单链DNA甲为15-40bp且具有序列表的序列1所示的DNA片段的DNA片段；所述单链DNA乙为15-40bp且具有序列表的序列2所示的DNA片段的DNA片段。所述单链DNA甲可为序列表的序列1所示的DNA片段；所述单链DNA乙可为序列表的序列2所示的DNA片段。利用本发明提供的特异引物对，可开发通用试剂盒，有效鉴别陆地植物物种，推动植物DNA条形码发展和服务社会。

摘要： 一种RbCl/BaCl

摘要： 发明公开了一种硅藻rbcL基因在判断溺亡者是否真正死于溺亡的应用。本发明中提供一对检测硅藻rbcL基因的引物对，还提供一种硅藻rbcL基因的分析方法，提取硅藻内核酸，利用权利要求2所述引物对上述核酸中rbcL基因进行扩增，利用扩增产物制备待测样本，对待测样本进行核酸分析。本发明还提供了将上述硅藻rbcL基因分析方法应用于法医检测中的应用，在溺亡者脏器中提取硅藻核酸并用PCR技术进行扩增，然后进行检测并与水样中的硅藻核酸进行比对，通过检出率和硅藻rbcL基因测序结果的比对，即可判断溺亡者是否真正死于溺亡，同时有助于找出真正的溺亡区域。

摘要： 一种检测柽柳科植物

摘要： 本发明公开了用于进行陆地植物物种鉴定的基于rbcL基因的特异引物对及其应用。本发明提供的特异引物对，由单链DNA甲和单链DNA乙组成；所述单链DNA甲为15-40bp且具有序列表的序列1所示的DNA片段的DNA片段；所述单链DNA乙为15-40bp且具有序列表的序列2所示的DNA片段的DNA片段。所述单链DNA甲可为序列表的序列1所示的DNA片段；所述单链DNA乙可为序列表的序列2所示的DNA片段。利用本发明提供的特异引物对，可开发通用试剂盒，有效鉴别陆地植物物种，推动植物DNA条形码发展和服务社会。

摘要： 本发明公开了一种烟草rbcl基因片段，所述rbcl基因片段序列如SEQ No.1所示。所述烟草rbcl基因片段可用于鉴定烟草成分，即将所述rbcl基因片段作为烟草成分标记，在成分分析中若检测出相同序列片段，就说明成分组成中存在烟草。