解决方案:输入并存储每个样本的二进制表型数据(1)。输入并存储相对于每个样本的M个单核苷酸多态性(SNP)的基因型(2)。针对每个SNP对每种表型进行基因型分类计数(3)。通过确定针对每个SNP的分析连续性的有效性/无效性来存储按基因型分类的计数(4)。确定表型的显性/隐性类型,并相对于确定为对分析继续有效的SNP进行存储(5)。相对于被确定为对分析连续有效的两个SNP,基于基于表型和显性/隐性类型的划分表的划分表,确定并存储上位效应,并且改变待分析的SNP对。根据分析程序(6)。对于确定了上皮效应的SNP对,通过logistic回归分析验证了上皮效应(7)。
版权:(C)2011,日本特许厅&INPIT
公开/公告号JP5413952B2
专利类型
公开/公告日2014-02-12
原文格式PDF
申请/专利权人 公益財団法人がん研究会;NECソフト株式会社;
申请/专利号JP20090070753
申请日2009-03-23
分类号G06F19/18;C12N15/09;
国家 JP
入库时间 2022-08-21 16:14:08