一种利用纳米孔测序的转录组分析方法

摘要

一种利用纳米孔测序的转录组分析方法，所属分子生物学技术领域，本发明公开了一种利用nanopore测序数据的转录组分析方法，包括基于minimap2快速比对获得序列之间的关系；计算序列之间比对的相似性、覆盖度、最大缺失、最大插入；利用CARNAC‑LR软件进行网络状聚类，获得序列网络状关系；将聚类得到的cluster经过pbccs软件纠错而获得CCS序列；本发明方法通过获得高质量的CCS序列之后，可以进行转录组后续的基因定量等分析。