一种高通量检测植物circRNA等位位点差异表达的方法

摘要

本发明提供了一种高通量检测植物circRNA等位位点差异表达的方法，属于基因表达检测技术领域，所述方法包括以下步骤：1)提取植物样品总RNA，构建链特异性文库；2)用Illumina HiSeq对所述链特异性文库进行双端测序；3)从原始测序数据中筛选circRNAs数据；4)提取circRNAs数据中circRNAs成环处的反向剪接reads；5)对所述反向剪接reads进行单核苷酸变异检测；6)统计所述反向剪接reads中比对到所述SNP位点的不同基因型的reads数，以比对到不同基因型的reads数的比例为不同基因型的表达量比例。所述方法可以高通量、准确检测circRNA等位位点的差异表达。