一种基于种群熵的阶段性蛋白质结构预测方法

摘要

一种基于种群熵的阶段性蛋白质结构预测方法，在差分进化算法的框架下，利用种群中个体状态间的转变选择不同的变异策略，在全局探测和局部增强间达到平衡。在探索阶段，利用排挤策略，使种群在进化的保证种群的多样性；在增强阶段，根据种群中个体状态间的转变构建马尔科夫模型，根据构建马尔科夫型计算种群熵值，再根据计算的熵值信息指导下一代种群中变异策略的选择，从而在全局探测和局部增强间达到平衡，在不断搜索更好的构象的同时避免陷入局部最优，提高构象空间的探索性能。本发明提供一种搜索效率和预测精度较高的基于种群熵的阶段性蛋白质结构预测方法。