宿主外周血单个核细胞和T细胞的癌症DNA甲基化标志物

摘要

本发明发现了癌症在宿主的T细胞和外周血单个核细胞(PBMC)的DNA中具有DNA甲基化标志物。本发明公开了源自PBMC的DNA的CG IDs，通过上述CG IDs在PBMC或T细胞的DNA中的甲基化水平预测肝细胞癌(HCC)临床进展分期和慢性肝炎。本发明还公开了，一种通过使用本发明所识别的CG IDs来预测HCC的试剂盒，以及焦磷酸测序DNA甲基化实验、受试者工作特征(ROC)实验、惩罚回归实验和层级聚类分析在预测HCC中的应用。本领域任一技术人员均可以使用本发明来获得用于任何癌症和任何癌症临床进展分期的DNA甲基化标志物。本发明描述的DNA甲基化标志物(CG IDs)将用于诊断：a.癌症；b.癌症不同临床进展分期；c.正在接受治疗的患者对治疗的反应；d.慢性乙型肝炎或慢性丙型肝炎。