一种基于QTL-seq发掘东乡野生稻耐冷基因的方法

摘要

本发明公开了一种基于QTL‑seq发掘东乡野生稻耐冷基因的方法。本发明以栽培稻‘协青早B’为受体亲本为母本，东乡野生稻为父本，远缘杂交后连续回交自交获得的重组自交系BC₁F₁₀进行耐冷鉴定，获得20耐冷株系组成耐冷基因池，20个冷敏感株系组成的冷敏感基因池。对两个基因池进行高通量测序及QTL‑seq分析，获得两个基因池的差异SNP标记和耐冷性状相关的QTL位点，对候选耐冷基因进行荧光定量PCR检测，最后鉴定检测到东乡野生稻中有5个耐冷相关基因。本发明可快速准确地探明和发掘东乡野生稻耐冷基因，可为全面阐明东乡野生稻耐冷性状的遗传机理提供有力证据，为东乡野生稻耐冷基因的克隆、功能分析奠定基础，促进东乡野生稻耐冷基因用于育种实践。