一种高效可并行运算且高准确性的全基因组选择方法

摘要

本发明涉及动植物育种及人类疾病预测技术领域，提供一种高效可并行运算且高准确性的全基因组选择方法。首先读取原始基因型文件和表型文件，构建新的基因型文件和表型文件，计算所有个体间的亲缘关系矩阵；然后提取新的表型文件中所有个体作为参考群，提取原始基因型文件中无表型数据的所有个体作为预测群；接着利用参考群数据进行全基因组关联分析，提取全基因组关联分析的结果特征；构建性状特异的模型库，采用交叉验证策略，依次优化最佳固定效应、最佳随机效应，从模型库中选取最优预测模型；最后，利用最优预测模型，计算预测群的基因组估计育种值。本发明能够快速准确且稳定地预测出个体基因组育种值，提升全基因组选择的准确性及效率。