扬子鳄微卫星多态位点、鉴定方法及特异引物序列

摘要

本发明提供了一种扬子鳄微卫星多态位点、鉴定方法及特异引物序列，及在此基础上筛选出的13对特异引物序列，其序列如SEQ ID NO.1～SEQ ID NO.26所示。鉴定扬子鳄微卫星多态位点的方法利用扬子鳄基因组筛选出微卫星位点及高质量引物；将扬子鳄基因组测序read数据比对到扬子鳄参考基因组鉴定INDEL，根据INDEL鉴定结果和微卫星筛选结果，筛选出具有多态性的微卫星位点。本发明所提供的13对微卫星引物，均为多态性位点，具有较强的分辨能力。利用这套微卫星引物，可经济、快速、正确地用于扬子鳄的亲子鉴定，有助于对扬子鳄种群进行家族谱系重建和信息完善，从而制定科学的管理方案指导扬子鳄的后期保护工作。