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船舶压载水微生物总DNA提取及多样性分析的方法

摘要

本发明公开了一种船舶压载水微生物总DNA提取及多样性分析的方法;本发明根据船舶压载水的特性,使用3μm和0.22μm微孔滤膜的两级过滤和冷冻固定,加固了微生物在滤膜上的附着,使用十六烷基三甲基溴化铵(CTAB)处理得到的微生物总DNA纯度达到直接进行后续分子生物学研究的需要,提取的DNA片段可进行16SrDNA的扩增及变性梯度凝胶电泳(DGGE),将电泳图进行数字化分析后可判断船舶压载水微生物种群多样性程度,通过将特异条带切胶回收、克隆测序并进行BLAST序列比对,得到压载水优势菌群的种类,从而确定微生物群落结构组成,为今后研究船舶压载水及沉积物中微生物多样性与生态功能奠定基础。

著录项

  • 公开/公告号CN104946627B

    专利类型发明专利

  • 公开/公告日2017-09-12

    原文格式PDF

  • 申请/专利权人 上海海洋大学;

    申请/专利号CN201510362443.X

  • 申请日2015-06-25

  • 分类号

  • 代理机构上海伯瑞杰知识产权代理有限公司;

  • 代理人曹莉

  • 地址 201306 上海市浦东新区沪城环路999号

  • 入库时间 2022-08-23 10:00:32

法律信息

  • 法律状态公告日

    法律状态信息

    法律状态

  • 2017-09-12

    授权

    授权

  • 2015-11-04

    实质审查的生效 IPC(主分类):C12N 15/10 申请日:20150625

    实质审查的生效

  • 2015-11-04

    实质审查的生效 IPC(主分类):C12N 15/10 申请日:20150625

    实质审查的生效

  • 2015-09-30

    公开

    公开

  • 2015-09-30

    公开

    公开

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