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一种在全基因组水平鉴定植物基因组DNA胞嘧啶四联体位点的方法

摘要

本发明公开一种在全基因组水平鉴定植物基因组DNA胞嘧啶四联体位点的方法,该方法包括如下步骤:(1)准备植物材料;(2)提取并纯化细胞核;(3)对细胞核内染色质进行片段化并回收基因组DNA;(4)在变复性Buffer中进行变复性反应;(5)iMab‑iM DNA复合物;(6)用Protein G Beads回收过夜反应形成的iMab‑iMDNA复合物;(7)从beads上洗脱iMab‑iM DNA复合物,并回收DNA片段;(8)用qPCR方法检测DNA iM富集程度;(9)建库和Illumina测序,在全基因组水平鉴iM位点。整个方法流程简单,耗时较短,DNA片段化可视化效果强,理论上该方法适应于多种植物。

著录项

  • 公开/公告号CN114410813A

    专利类型发明专利

  • 公开/公告日2022-04-29

    原文格式PDF

  • 申请/专利权人 南京农业大学;

    申请/专利号CN202111336972.4

  • 申请日2021-11-12

  • 分类号C12Q1/6895;C12Q1/686;

  • 代理机构南京天华专利代理有限责任公司;

  • 代理人徐冬涛;李晓峰

  • 地址 211225 江苏省南京市溧水区白马镇国家农业科技园南京农业大学基地

  • 入库时间 2023-06-19 15:07:06

法律信息

  • 法律状态公告日

    法律状态信息

    法律状态

  • 2022-05-20

    实质审查的生效 IPC(主分类):C12Q 1/6895 专利申请号:2021113369724 申请日:20211112

    实质审查的生效

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