基于亲本基因型与子代表型的全基因组关联分析算法

摘要

本发明公开了一种基于亲本基因型与子代表型的全基因组关联分析算法，包括以下步骤：获取待分析群体的亲本基因型、子代表型以及子代父母本信息，根据亲本对的基因型建立子代的组合基因型矩阵，获得每个SNP位点不同子代的可能基因型组合信息，以及对应的子代群体分组表型数据，构建子代组合基因型与对应子代表型的统计模型进行关联分析，获取表型与各SNP位点的关联P值；之后区分SNP位点的关联类型，计算是否符合加性或完全显性效应，对候选位点进行筛选；再根据全基因组SNP标记的LD衰减获得强相关标记的平均距离，用于最终标记集合的筛选。