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一种基于神经归纳矩阵补充的图卷积网络疾病相关lncRNA基因预测方法

摘要

本发明提出了一种基于神经归纳矩阵补充的图卷积网络疾病相关lncRNA基因预测方法,该方法包括:通过已知数据库中的lncRNA‑disease关联利用两种疾病的有向无环图(DAG)和高斯交互剖面核相似度来计算疾病的语义相似性,利用lncRNAs的功能相似性评分和高斯相互作用谱核相似性评分来计算lncRNAs相似性。得到疾病的语义相似性和lncRNAs的功能相似性之后利用图卷积网络来监督学习疾病和lncRNAs的潜在特征,之后利用神经归纳矩阵补全方法,使用非线性神经评级模型来捕捉lncRNA和疾病特征之间复杂和微妙的相互作用。

著录项

  • 公开/公告号CN113539359A

    专利类型发明专利

  • 公开/公告日2021-10-22

    原文格式PDF

  • 申请/专利权人 张舒欣;

    申请/专利号CN202110821668.2

  • 发明设计人 张舒欣;

    申请日2021-07-20

  • 分类号G16B20/30(20190101);G06Q10/04(20120101);G16H50/20(20180101);G06K9/62(20060101);G06N3/04(20060101);G06N3/08(20060101);

  • 代理机构

  • 代理人

  • 地址 150080 黑龙江省哈尔滨市南岗区哈西街道学府路74号黑龙江大学C区10栋-02室

  • 入库时间 2023-06-19 12:56:12

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