一种基于粪便微生物标志物和人DNA含量的多种肠道疾病风险评估的方法及应用

摘要

本发明涉及医疗筛查领域，且公开了一种基于粪便微生物标志物和人DNA含量的多种肠道疾病风险评估的方法及应用，包括常见肠道相关细菌信息的收集、数据预处理、粪便人类DNA鉴定、肠病相关菌群与相关通路丰度鉴定、机器学习模型的建立、真实样本应用。鉴定到的标志物菌群与通路，结合人类粪便DNA含量，增加了分类模型的全面性；利用多个数据集通过Meta分析，可以减小背景噪音和其他因素的影响，得到更加稳定结果;同时考虑多种常见肠道疾病，挖掘其可能的致病机制，可避免因其有相似表型而误诊的可能；根据实际需求，根据不同目的建立了不同的机器分类器，便于使用者根据自己的需求使用或进一步验证。综合考虑上述因素，本发明机器学习模型有优良预测效果，更适用于实际应用场景，可得到更精确的结果。并且所选取的实验载体粪便是临床使用和体检机构中最常见的，获取难度小成本低，解释程度高。