基于基因表达和DNA甲基化数据的胃癌生物标志物识别方法

摘要

本发明提供了一种基于基因表达和DNA甲基化数据的胃癌生物标志物识别方法(GCBMI)。本发明结合基因表达数据和DNA甲基化数据，将差异分析、统计检测以及互信息的方法相结合来识别潜在的胃癌生物标志物。首先利用互信息的方法选出排名靠前的基因，然后利用Fold Change(FC)与T‑test计算每个基因的FC值与p值，随后引入FDR来校正p值，通过设置相应的阈值进一步筛选差异表达基因。本发明分别对胃癌的基因表达数据与DNA甲基化数据进行上述操作，将获得的差异基因取交集后得到最终确定的胃癌生物标志物。本发明简单有效，通过与其他的特征选择方法比较，显示该发明在预测潜在的胃癌生物标志物中具有较好的表现。