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一种应用于精准用药的智能报告系统

摘要

本发明公开了一种应用于精准用药的智能报告系统,包括信息管理模块、检测报告模块和分析报告模块;所述信息管理模块包括实验文件信息管理模块、用药知识信息管理模块和辅助匹配信息管理模块;所述检测报告模块用于根据所述实验文件信息、所述辅助匹配信息与所述基因用药信息匹配生成检测报告数据;所述分析报告模块用于汇总所有的所述检测报告数据,并根据所述检测报告数据、用户设定的分析数据以及预设的维度规则生成数据分析报告。本发明提出技术方案解决过于依赖检测结果指导用药,且对检测报告缺乏有效分析的技术问题。

著录项

  • 公开/公告号CN112635014A

    专利类型发明专利

  • 公开/公告日2021-04-09

    原文格式PDF

  • 申请/专利权人 长沙三济生物科技有限公司;

    申请/专利号CN202011640287.6

  • 发明设计人 李琦;滕祥云;袁鹏;

    申请日2020-12-31

  • 分类号G16H15/00(20180101);G16H50/70(20180101);G16B20/00(20190101);G16H70/40(20180101);G06F16/11(20190101);

  • 代理机构43005 安化县梅山专利事务所;

  • 代理人夏赞希

  • 地址 410013 湖南省长沙市长沙高新开发区麓谷国际工业园桐梓坡西路229号A5栋3楼

  • 入库时间 2023-06-19 10:32:14

说明书

技术领域

本发明涉及基因检测技术领域,尤其涉及一种应用于精准用药的知识库系统。

背景技术

基因与人类的生活息息相关,一个主要方面体现在基因对人类健康的重大影响,先天性的基因缺陷或后天性的基因突变与个体的身体健康,疾病的发生、发展有着密不可分的联系。随着基因与人类机体健康的关系被越来越多地发现、证实,为了满足社会对更好地预防和治疗基因相关疾病的需求,国内外涌现了众多提供基因检测技术服务的机构。

医学检测报告作为医学检测服务的产品,其准确性和时效性一直是医学检测服务行业的追求。医学分子生物学检测所涉及的检测方法或平台多种多样,对不同平台的结果进行分析,所需要的知识背景不尽相同,分析标准也不尽相同。而提供检测服务的不同机构或者是同一机构的不同项目对于检测平台的采取和检测报告的内容、样式会有自身的考虑和要求。

研究表明,基因与相关药物使用存在密切的关系,基因和药物能够构成药物基因对。例如,对于药物基因对“别嘌呤醇-HLA-B”来说,因别嘌呤醇这种常用的治疗痛风药物,其不良反应与HLA-B*5801显著相关,对于痛风患者能否常规使用别嘌呤醇,医院会委托基因检测公司检测该患者是否携带HLA-B*5801。如果基因检测结果为不携带HLA-B*5801,可以考虑使用常规的别嘌呤醇治疗方案;而若基因检测结果为携带HLA-B*5801,该患者使用别嘌呤醇进行治疗时发生毒副作用的风险较高,医生则会结合临床实际,调整治疗方案。

相关技术中,提供一种基因检测系统,提出一种针对患者进行基因自动检测的技术方案,该方案针对不同的基因检测项目自动出具含用药指导提出了愿景。但是,该方案实现仍然存在缺陷,例如,过于依赖检测结果指导用药,对检测报告缺乏有效分析。

因此,有必要提供一种新的应用于精准用药的智能报告系统,以解决上述技术问题。

发明内容

本发明的主要目的在于提供一种应用于精准用药的智能报告系统,旨在解决相关技术中,过于依赖检测结果指导用药,且对检测报告缺乏有效分析的技术问题。

为实现上述目的,本发明提供的应用于精准用药的智能报告系统,包括信息管理模块、检测报告模块和分析报告模块;

所述信息管理模块包括实验文件信息管理模块、用药知识信息管理模块和辅助匹配信息管理模块,所述实验文件信息管理模块用于管理实验文件信息,所述用药知识信息管理模块用于管理基因用药信息,所述辅助匹配信息管理模块用于管理辅助匹配信息;

所述检测报告模块用于根据所述实验文件信息、所述辅助匹配信息与所述基因用药信息匹配生成检测报告数据;

所述分析报告模块用于汇总所有的所述检测报告数据,并根据所述检测报告数据、用户设定的分析数据以及预设的维度规则生成数据分析报告。

优选地,所述辅助匹配信息管理模块包括药物信息管理模块、基因信息管理模块与药物基因对信息管理模块;

其中,所述药物信息管理模块用于管理所述药物信息,所述基因信息管理模块用于管理基因信息,所述药物基因对信息管理模块用于管理药物基因对信息。

优选地,所述辅助匹配信息管理模块还包括报告模板信息管理模块,所述报告模板信息管理模块用于管理报告模板信息。

优选地,所述检测报告模块具体用于根据所述实验文件信息、所述基因用药信息、所述基因信息、所述药物信息、所述药物基因对信息及所述报告模块信息匹配生成所述检测报告数据。

优选地,所述实验文件信息包括样本地域信息和样本基因信息;所述分析数据为某一指定的所述样本基因信息;

所述分析报告模块具体用于:

汇总所有的所述检测报告数据,并筛选出包含指定的所述样本基因信息的所述检测报告数据;

依据所述样本地域信息排布筛选后的所述检测报告数据中的基因数据,以生成所述数据分析报告。

优选地,所述实验文件信息包括样本时间信息和样本基因信息;所述分析数据为某一指定的所述样本基因信息;

所述分析报告模块具体用于:

汇总所有的所述检测报告数据,并筛选出包含指定的所述样本基因信息的所述检测报告数据;

依据所述样本时间信息排布筛选后的所述检测报告数据中的基因数据,以生成所述数据分析报告。

优选地,所述实验文件信息包括样本个体特征信息和样本基因信息;所述分析数据为某一指定的所述样本基因信息;

所述信息分析模块具体用于:

汇总所有的所述检测报告数据,并筛选出包含指定的所述样本基因信息的所述检测报告数据;

依据所述样本个体特征信息排布筛选后的所述检测报告数据中的基因数据,以生成所述数据分析报告。

优选地,所述实验文件信息包括样本时间信息和样本药物基因对信息;所述分析数据为所述样本药物基因对信息;

所述分析报告模块具体用于:

汇总所有的所述检测报告数据,依据所述样本时间信息排布所有的所述检测报告数据中样本药物基因对的检测时间信息和检测数量信息,以生成所述数据分析报告。

优选地,所述实验文件信息包括样本时间信息和样本药物信息;所述分析数据为所述样本药物信息;

所述信息分析模块具体用于:

汇总所有的所述检测报告数据,依据所述样本时间信息排布所有的所述检测报告数据中所述样本药物的检测时间信息和检测数量信息,以生成所述数据分析报告。

优选地,所述实验文件信息包括样本时间信息和样本检测医院信息;所述分析数据为所述样本检测医院信息;

所述信息分析模块具体用于:

汇总所有的所述检测报告数据,依据所述样本检测医院信息排布所有的所述检测报告数据中检测时间信息和检测数量信息,以生成所述数据分析报告。

本发明提供的应用于精准用药的智能报告系统中,所述检测报告模块用于根据所述实验文件信息、所述辅助匹配信息与所述基因用药信息匹配生成检测报告数据;所述分析报告模块用于汇总所有的所述检测报告数据,并根据所述检测报告数据、用户设定的分析数据以及预设的维度规则生成数据分析报告;从而能够实现针对检测报告进行进一步的分析,通过大量检测报告数据的分析,指导用药,实现降低对检测报告指导的依赖,并对检测报告的数据价值进行进一步的开发和挖掘。

附图说明

图1为本发明提供的应用于精准用药的智能报告系统的一较优实施例的架构图;

图2为图1所示的检测报告模块的架构图;

图3为图1所示的辅助匹配信息管理模块的架构图;

图4为CYP3A4*1G(G20230A)频率分布地区表;

图5为CYP2C19各位点年检测量情况表;

图6为图5所示的CYP2C19各位点年检的测量情况图;

图7为MTHFR(C677T)频率分布表(性别/年龄/样本类别);

图8为系统各项目年检测量分布情况表;

图9为系统各药物分布情况表;

图10为CYP2C19各合作医院年检测量表;

图11为2012-2017各指标变化情况表。

本发明目的实现、功能特点及优点将结合实施例,参照附图做进一步说明。

具体实施方式

应当理解,此处所描述的具体实施例仅仅用以解释本发明,并不用于限定本发明。

本发明提供一种应用于精准用药的知识库系统。

请结合参阅图1-3,为实现上述目的,本发明的一实施例中,应用于精准用药的智能报告系统,包括信息管理模块、检测报告模块和分析报告模块;

所述信息管理模块包括实验文件信息管理模块、用药知识信息管理模块和辅助匹配信息管理模块,所述实验文件信息管理模块用于管理实验文件信息,所述用药知识信息管理模块用于管理基因用药信息,所述辅助匹配信息管理模块用于管理辅助匹配信息;

本实施例中,所述实验文件信息包括检测实验所获取的检测样本信息以及相关的参考信息,例如:检测时间,检测样本的来源地,检测样本的机构等。

所述检测报告模块用于根据所述实验文件信息、所述辅助匹配信息与所述基因用药信息匹配生成检测报告数据;

所述分析报告模块用于汇总所有的所述检测报告数据,并根据所述检测报告数据、用户设定的分析数据以及预设的维度规则生成数据分析报告。

本发明提供的应用于精准用药的智能报告系统中,所述检测报告模块用于根据所述实验文件信息、所述辅助匹配信息与所述基因用药信息匹配生成检测报告数据;所述分析报告模块用于汇总所有的所述检测报告数据,并根据所述检测报告数据、用户设定的分析数据以及预设的维度规则生成数据分析报告;从而能够实现针对检测报告进行进一步的分析,通过大量检测报告数据的分析,指导用药,实现降低对检测报告指导的依赖,并对检测报告的数据价值进行进一步的开发和挖掘。

所述辅助匹配信息管理模块包括药物信息管理模块、基因信息管理模块与药物基因对信息管理模块;

其中,所述药物信息管理模块用于管理所述药物信息,所述基因信息管理模块用于管理基因信息,所述药物基因对信息管理模块用于管理药物基因对信息。

本实施例中,所述基因信息可以包含110多条基因,所述药物信息可以包括170多种药物,将一条基因或多条基因和一种药物或一类药物组配形成所述药物基因对信息(药物基因对项目);因而,系统中必然包含很多种“药物基因对”项目内容。

例如:5-FU-DPYD、5-FU-MSI、5-FU-MTHFR、5-FU-TP、5-FU-TYMS、阿德福韦酯-HBV-P区、阿芬太尼-CYP3A4、阿芬太尼-CYP3A5、阿立哌唑-CYP2D6、阿霉素-GATP1.GSTM1、铂类-GSTP1、利福平-NAT2、华法林-CYP2C9.VKORC1、阿司匹林-COX1、氯吡格雷-CYP2C19、叶酸-MTHFR等。

所述辅助匹配信息管理模块还包括报告模板信息管理模块,所述报告模板信息管理模块用于管理报告模板信息。

本实施例中是,所述报告模板信息用于规范检测报告的内容和形式。

所述检测报告模块具体用于根据所述实验文件信息、所述基因用药信息、所述基因信息、所述药物信息、所述药物基因对信息及所述报告模块信息匹配生成所述检测报告数据。

可以理解,所述药物基因对信息能够反映所述药物信息与所述基因信息的匹配关系,并且,所述药物基因信息与所述基因用药信息之间也存储匹配的关系,所述基因用药信息可以用于展示临床指南信息,以简要介绍基于基因型的临床建议。

请参阅图4,所述实验文件信息包括样本地域信息和样本基因信息;所述分析数据为某一指定的所述样本基因信息;

所述分析报告模块具体用于:

汇总所有的所述检测报告数据,并筛选出包含指定的所述样本基因信息的所述检测报告数据;

依据所述样本地域信息排布筛选后的所述检测报告数据中的基因数据,以生成所述数据分析报告。

例如,指定的样本基因信息为CYP3A4*1G(G20230A);最终获得该基因信息的在不同省区的,样本量信息,基因型信息和突变率信息,通过上述信息,医师可以对不同省区的情况获得概率的预判,在分布概率足够大和预判所造成的医疗风险足够小的情况下,医师可以根据统计结果指导用药,从而减少根据个体进行具体的基因检测的情况,降低对个体基因检测的依赖。

请结合参阅图5和图6,所述实验文件信息包括样本时间信息和样本基因信息;所述分析数据为某一指定的所述样本基因信息;

所述分析报告模块具体用于:

汇总所有的所述检测报告数据,并筛选出包含指定的所述样本基因信息的所述检测报告数据;

依据所述样本时间信息排布筛选后的所述检测报告数据中的基因数据,以生成所述数据分析报告。

例如,指定的样本基因信息为CYP2C19。从而获取该基因信息中各位点在2012-2017年中检测样本量的统计分布情况。

请参阅图7,所述实验文件信息包括样本个体特征信息和样本基因信息;所述分析数据为某一指定的所述样本基因信息;

所述信息分析模块具体用于:

汇总所有的所述检测报告数据,并筛选出包含指定的所述样本基因信息的所述检测报告数据;

依据所述样本个体特征信息排布筛选后的所述检测报告数据中的基因数据,以生成所述数据分析报告。

例如,指定的所述样本基因信息MTHFR(C677T)。

请参阅图8,所述实验文件信息包括样本时间信息和样本药物基因对信息;所述分析数据为所述样本药物基因对信息;

所述分析报告模块具体用于:

汇总所有的所述检测报告数据,依据所述样本时间信息排布所有的所述检测报告数据中样本药物基因对的检测时间信息和检测数量信息,以生成所述数据分析报告。

例如,2012年-2017年,各项目年检测量分布情况。

请参阅图9,所述实验文件信息包括样本时间信息和样本药物信息;所述分析数据为所述样本药物信息;

所述信息分析模块具体用于:

汇总所有的所述检测报告数据,依据所述样本时间信息排布所有的所述检测报告数据中所述样本药物的检测时间信息和检测数量信息,以生成所述数据分析报告。

例如,2012年-2017年,各药物分布情况。

请结合参阅图10和图11,所述实验文件信息包括样本时间信息和样本检测医院信息;所述分析数据为所述样本检测医院信息;

所述信息分析模块具体用于:

汇总所有的所述检测报告数据,依据所述样本检测医院信息排布所有的所述检测报告数据中检测时间信息和检测数量信息,以生成所述数据分析报告。

例如,2012-2017年各合作医院(机构)样本检测情况,通过获知合作医院的情况,能够为系统开发者提供良好的业务指导效果,并对合作医院的工作进行评估和考核。

通过以上的实施方式的描述,本领域的技术人员可以清楚地了解到上述实施例方法可借助软件加必需的通用硬件平台的方式来实现,当然也可以通过硬件,但很多情况下前者是更佳的实施方式。基于这样的理解,本发明的技术方案本质上或者说对现有技术做出贡献的部分可以以软件产品的形式体现出来,该计算机软件产品存储在如上所述的一个计算机可读存储介质(如ROM/RAM、磁碟、光盘)中,包括若干指令用以使得一台终端设备进入本发明各个实施例所述的方法。

在本说明书的描述中,参考术语“一实施例”、“另一实施例”、“其他实施例”、或“第一实施例~第X实施例”等的描述意指结合该实施例或示例描述的具体特征、结构、材料或者特点包含于本发明的至少一个实施例或示例中。在本说明书中,对上述术语的示意性表述不一定指的是相同的实施例或示例。而且,描述的具体特征、结构、材料、方法步骤或者特点可以在任何的一个或多个实施例或示例中以合适的方式结合。

需要说明的是,在本文中,术语“包括”、“包含”或者其任何其他变体意在涵盖非排他性的包含,从而使得包括一系列要素的过程、方法、物品或者系统不仅包括那些要素,而且还包括没有明确列出的其他要素,或者是还包括为这种过程、方法、物品或者系统所固有的要素。在没有更多限制的情况下,由语句“包括一个……”限定的要素,并不排除在包括该要素的过程、方法、物品或者系统中还存在另外的相同要素。

上述本发明实施例序号仅仅为了描述,不代表实施例的优劣。

以上仅为本发明的优选实施例,并非因此限制本发明的专利范围,凡是利用本发明说明书及附图内容所作的等效结构或等效流程变换,或直接或间接运用在其他相关的技术领域,均同理包括在本发明的专利保护范围内。

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